震撼！2025 深圳三院研究揭示HIV治愈关键竟在“治疗时机”！

大家好！今天分享一篇HIV免疫领域的高分文献——发表于《Signal Transduction and Targeted Therapy》（IF=38.1）

核心结论颠覆认知：HIV急性期启动ART治疗，可延缓单克隆整合位点积累，降低癌症风险及潜伏库形成难度。不管是做HIV免疫、生信整合分析的科研人，还是关注抗病毒治疗临床优化的医生朋友，都能从这篇文章里挖到发刊及临床实用价值～

这篇文章不仅结论有启发，生信+临床结合的研究思路更“抄作业友好”——生信层面的整合位点分析框架可迁移到肿瘤、肝炎等病毒感染领域，临床样本的纵向分析逻辑也能直接复用。下面咱们就拆解清楚：研究到底做了啥、核心结果是什么、怎么复刻思路发高分！

01 文献介绍

02 核心研究设计

【研究对象】：80例HIV感染者，分为急性期ART组（54例，感染6个月内启动治疗）和AIDS期ART组（36例，CD4+T细胞＜200 cells/μL时启动治疗）。

【研究方法】：采用线性靶向扩增PCR（LTA-PCR）结合二代测序，分析独特整合位点（UIS）；通过PMD分析（多克隆-单克隆距离分析）量化克隆多样性，结合GO/KEGG富集分析整合基因功能。

【研究路线】：先构建两组队列采集样本→用LTA-PCR+NGS捕获整合位点→生信分析克隆特征与基因功能→结合临床数据验证ART时机的影响（附：研究路线图，红色框突出LTA-PCR测序及PMD分析关键环节）。

03 关键结果

【图1】：队列构建和HIV感染阶段的示意图

PLWH根据ART启动时间进行分类：急性-ART组指在急性期开始ART的PLWH（n=54）;AIDS-ART指的是在艾滋病阶段（n = 36）期间开始ART的带原病毒患者。

【图2】：单克隆UIS比例的饼图分析【图3】：染色质修饰和安全港区域在急性ART组中是HIV整合的优先位置

（注：每个条形图和数据中每个测量点分别表示为SEM平均值±;p < 0.05表示统计显著性;D的Wilcoxon检验;随机线性回归检验 g;所有图中“急性”和“艾滋病”分别指在急性期开始使用ART的带原病原（也称为急性-ART组）和在艾滋病阶段开始使用ART的（也称为AIDS-ART组）

图3这些发现表明，虽然大多数染色质修饰区和安全港区在急性期初期被HIV首选整合，但随着ART过程，这些区域往往不稳定。这种不稳定性导致转变，整合位点越来越多地存在于基因内和增强子区域（见图）。3j）。

【图4】：宿主细胞基因参与关键生物过程

急性ART组（A组）中治疗持续时间为

【图5】：单克隆UIS的PCA图分析

在艾滋病阶段开始使用ART的PLWH中，HIV前病毒更频繁地以单克隆类型整合到特定基因中，与急性期开始ART者相比，癌症风险显著增加（见图。5e， f）。这种风险因克隆扩增而加剧，即携带整合进TSGs或其他关键调控基因的前病毒的细胞发生增殖，导致具有致癌潜力的细胞积累。为说明这一点，我们列出了计数百分比>40%的顶级UIS，其中TSG整合位点的克隆扩增促进单克隆扩张，使艾滋病阶段开始ART的PLWH患者比急性期治疗者更为癌症风险（见图）。5g，h）。我们在补充图中列出了与TSG相关的剩余UIS。6b，c。综合来看，这些发现强调了早期ART在预防感染细胞克隆扩增、减少稳定且持久储量形成以及最终克服实现艾滋病功能性治愈的主要障碍中的关键性。

04 价值与局限

PART.01

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【价值】：

科研层面：提供了“测序+生信分析+临床验证”的HIV潜伏库研究框架，PMD分析方法可复用至其他病毒感染领域；临床层面：明确急性期ART的肿瘤预防价值，为HIV治疗指南优化提供依据。

【局限】：

未区分完整与缺陷前病毒，无法精准关联功能性潜伏库；样本来自单一中心，需多中心队列验证结果稳定性。

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05 实用复刻指南

这篇文章的生信+临床结合思路易复刻，核心步骤拆解：

1. 队列设计：优先选择纵向随访队列，按关键干预因素（如治疗时机）分组，样本量控制在30+每组，保证统计效力；

2. 核心方法选型：采用“LTA-PCR+NGS”捕获整合位点，搭配PMD分析克隆多样性，生信工具可选用GENE-IS pipeline+Metascape富集分析，性价比高且易发高分；

3. 数据分析技巧：重点关注独特整合位点（UIS）的丰富度与均匀度，关联临床结局（如癌症风险、治疗效果），强化结果转化价值。

互动与结尾

结尾总结