MSYSTEMS|武汉病毒所袁志明/夏菡、郑振华团队合作揭示肯尼亚蚊虫微生物组的生态驱动因素

蚊虫携带的多样化微生物组（microbiome）可影响其传播病原体的潜力。然而，目前对蚊虫微生物组的结构组成及其生态驱动因素仍知之甚少，在蚊媒传染病高发的非洲地区，相关研究尤为缺乏。

2026年1月20日，中国科学院武汉病毒研究所袁志明/夏菡团队、郑振华团队合作在国际学术期刊mSystems发表题为“Host and geography shape microbial communities in Kenyan mosquitoes: insights from metatranscriptomics”（宏转录组学揭示宿主与地理特征共同塑造肯尼亚蚊虫微生物组）的研究论文。

研究对2019-2023年间从肯尼亚8个生态区采集的伊蚊和库蚊（图1A），采用宏转录组学技术并结合多维度统计建模与共现网络（co-occurrence network）分析，发现肯尼亚蚊虫微生物组呈现的特征为病毒在数量上占优势，而细菌则主导种类多样性（图1B）。在宏观尺度上，地理区域是决定其微生物组整体构成的首要因素；而在局部尺度（如城市/采样点），蚊虫的种类则成为影响其微生物组多样性的关键。进一步分析表明，伊蚊与库蚊的微生物共现网络存在差异显著。伊蚊的微生物网络相对库蚊更为稳固，伊蚊网络中以细菌类群为核心枢纽，库蚊网络中病毒扮演更为关键的角色（图1D）。此外，研究团队从这些蚊虫中鉴定出102种病毒序列，分属24个不同的病毒科，其中31种为潜在的新型RNA病毒。系统发育分析还揭示，在布尼亚病毒目、小RNA病毒目等已知大类中，存在尚未被分类的进化分支（图1C）。

该研究系统阐明了肯尼亚蚊虫微生物组的结构组成特征与驱动因素，为基于生态地理学的病媒生物监测和未来开发针对微生物组的病媒生物干预策略提供了新思路。

武汉病毒所助理研究员张乃楼、研究生Evans Atoni为该论文共同第一作者，武汉病毒研究所夏菡研究员、袁志明研究员、广州海关技术中心戴俊主任医师为论文共同通讯作者，武汉病毒所郑振华研究员、肯尼亚自然博物馆（National Museum of Kenya）Bernard Agwanda研究员等为该项研究的合作作者。该研究得到国家重点研发计划项目、中国科学院中非中心的资助。

图1. 肯尼亚蚊虫微生物组

（A）蚊虫采样地点及微生物组组成；（B）细菌和病毒组成的α和β多样性分析；

（C）病毒类群的系统发育分析；（D）伊蚊和库蚊微生物群落的共线性网络。

文章链接：https://journals.asm.org/doi/10.1128/msystems.01427-25