从“蓝图”到“施工队”——揭秘生命真正的执行者
在中心法则的指引下,mRNA如同生命的“蓝图”,而核糖体则是高效的“施工队”。然而,仅仅知道有哪些“蓝图”(转录组)是远远不够的。哪些蓝图正在被高效执行?施工进度如何?是否存在“停工”或“拥堵”?这些动态过程,才是决定细胞命运和功能的关键。
欢迎关注“翻译组学”,这片连接基因组学与蛋白质组学的重要前沿领域。作为国内专业的翻译组技术服务商,卿泽生物致力于为您提供全方位、高精度的翻译组学研究解决方案,助力您揭开基因表达调控的最后一层神秘面纱。
公司简介:前沿技术驱动,专注翻译组技术服务
卿泽生物是一家专注于翻译组学技术开发与服务的生物科技公司。我们以深厚的专业技术积累和先进的硬件平台为基石,为国内外高校、科研院所、医院及药企提供一站式的顶尖科研服务。
核心技术平台:以多聚核糖体图谱技术为根基,建立了覆盖Polysome-seq, Ribo-seq, 线粒体Ribo-seq, Disome-seq等全方位的技术体系。
核心硬件保障:拥有专业的蔗糖梯度分离系统和超速离心机等核心设备,确保实验结果的高分辨率与卓越重复性。
资深团队:核心团队成员均来自知名院校,具备多年翻译组学技术实操与数据分析经验,能为您提供从课题设计、实验执行到数据解读的全程专业支持。
核心技术详解:多维度捕捉翻译动态
基石技术:多聚核糖体图谱
原理简介:利用蔗糖密度梯度超速离心技术,将细胞提取物中的核糖体及其结合的mRNA按大小(单核糖体、二聚体、多聚核糖体等)进行分离。通过监测各梯度的吸光度,即可得到一幅反映整体翻译效率的“图谱”。
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解决的科学问题:
(1)全局翻译水平评估:快速判断细胞或组织在特定条件(如应激、药物处理、疾病状态)下的整体蛋白质合成活性。
(2)特定基因翻译效率:结合qPCR,可定量分析特定mRNA的翻译效率,区分转录调控和翻译调控。
技术延伸:Polysome-seq
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在Polysome Profiling的基础上,收集多聚核糖体结合的mRNA进行高通量测序。从而在全基因组范围内,精确量化每一条mRNA的翻译效率。
金标准技术:SelectiveRibo-seq
原理简介:利用核酸酶消化未被核糖体保护的mRNA片段,再通过蔗糖密度梯度超速离心技术捕捉单个核糖体严密保护的约28-30 nt的“足迹”。对这些足迹进行建库测序,可实现对正在翻译的核糖体进行单核苷酸精度的定位。
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解决的科学问题:
(1)精确鉴定翻译起始位点:发现上游开放阅读框和短肽。
(2)揭示翻译速率:通过核糖体密度分析基因各区域的翻译速度。
(3)从头鉴定开放阅读框:发现新型微肽或非经典ORF。
特色技术:线粒体Ribo-seq
原理简介:在Ribo-seq基础上,通过优化线粒体提取或富集方案,专门用于研究线粒体基因组编码基因的翻译过程。线粒体核糖体保护的特征性片段长度与胞质核糖体不同。
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解决的科学问题:研究线粒体蛋白质合成的独特调控机制,与细胞能量代谢、细胞凋亡、神经退行性疾病及癌症等重要生物学过程密切相关。
前沿技术:Disome-seq
原理简介:专门捕获和测序由两个核糖体形成的“双核糖体”所保护的mRNA片段。这通常代表了核糖体在mRNA上翻译暂停或滞留的区域。
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解决的科学问题:
识别翻译暂停位点:发现哪些密码子或mRNA二级结构会导致核糖体“卡顿”。
研究共翻译调控:理解蛋白质折叠、翻译质量控制等过程。
揭示mRNA稳定性调控新机制:翻译暂停常与mRNA降解途径相关联。
合作共赢:客户案例与文献展示
案例一:[中山大学],[Molecular Cancer],[IF=37.3]
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本研究发现了一种新的低氧应答环状RNA circINSIG1,该环状RNA在结直肠癌组织中表达上调,并与晚期临床分期和低生存率相关。机制上,采用Polysome profiling和qPCR分析等技术证实circINSIG1编码一个121个氨基酸的蛋白circINSIG1-121,通过募集CUL5-ASB6复合物(一种泛素E3连接酶复合物),促进关键胆固醇代谢调节因子INSIG1第156和158位赖氨酸的k48关联泛素化,从而诱导胆固醇生物合成,促进结直肠癌的增殖和转移。原位异种移植肿瘤模型和患者源异种移植模型进一步确定了circINSIG1在CRC进展中的作用和CRC的潜在治疗靶点。
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总之,本研究发现的circINSIG1提供了一种表观遗传机制,揭示了缺氧与胆固醇代谢之间的联系,为CRC的治疗提供了一个有希望的治疗靶点。
案例二:[复旦大学],[Advanced Science],[IF=15]
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本研究通过系统分析非小细胞肺癌(NSCLC)细胞分泌的外泌体,发现了一种缺氧诱导的外泌体环状RNA--circPLEKHM1。它可将巨噬细胞极化为M2型来驱动NSCLC转移。机制上,外泌体circPLEKHM1促进PABPC1-eIF4G相互作用,促进抑瘤素M受体(OSMR)的翻译(Polysome profiling+qPCR),从而促进巨噬细胞极化与癌症转移。重要的是,circPLEKHM1靶向治疗可显著降低NSCLC体内转移,因此,circPLEKHM1可作为非小细胞肺癌患者转移和生存不良的预后生物标志物和治疗靶点。
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本研究揭示了癌细胞如何在缺氧肿瘤微环境中与巨噬细胞相互作用以促进转移的新机制,并强调了外泌体circPLEKHM1作为肺癌转移预后生物标志物和治疗靶点的重要性。
客户文章部分展示
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School anniversary
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INTERVIEW
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表型差异无法用mRNA水平解释?
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