近日,广东省农科院作物所花生基因组与遗传育种团队在The Plant Journal期刊发表题为“Functional analysis of a GWAS pleiotropic hotspot suggests an auxin-biosynthesis gene (AhPDS1), regulating pod development in peanut (Arachis hypogea L.)”的研究成果。该研究在花生B06染色体上定位到一个调控花生荚果与种子大小的关键基因AhPDS1。广东省农科院作物所鲁清研究员和Muhammad J. Umer博士后为论文共同第一作者,鲁清研究员、刘浩副研究员、洪彦彬研究员和陈小平研究员为论文共同通讯作者。
研究团队利用390份种质资源全基因组变异数据(Lu Q et al., 2024, Nature Genetics),结合多个环境下荚果和种仁大小表型进行全基因组关联分析,共鉴定出883个显著性关联位点。其中,在B06染色体上挖掘到一个多效性热点关联区域,与荚果和种仁大小均存在显著关联。通过候选基因关联分析锁定了一个编码类黄素单加氧酶基因,命名为AhPDS1。通过水稻和拟南芥过表达分析均表明该基因可显著增加种子和角果大小。激素谱分析表明该基因通过吲哚-3-丙酮酸(IPA)途径参与IAA合成调控种子大小。
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AhPDS1调控种子大小功能验证
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.70608
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