教科书要改写了?你开车在路上,红绿灯同时亮起了红灯和绿灯——这种完全违背常理的混乱,竟然就是科学家刚刚在一种微生物的遗传密码中发现的惊人真相,它直接粉碎了统治生物学界60年的“中心法则”铁律!
这次颠覆性的发现,其意义可能远超你的想象。它不仅挑战了我们对生命底层逻辑的认知,更可能为治疗包括囊性纤维化在内的10%遗传性疾病打开全新的大门。这项重磅研究由加州大学伯克利分校(UC Berkeley)的Dipti Nayak教授和前研究生Katie Shalvarjian领衔,成果2025年11月6日刚刚发表在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。
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这一发现究竟有多离谱?让我们走进这微观世界的“法外之地”。
在生物学的世界里,有一套神圣不可侵犯的“密码本”。DNA转录成RNA,RNA每三个碱基组成一个“密码子”,对应一种氨基酸。绝大多数生物只用20种标准氨基酸来以此搭建生命的大厦。
在这个密码本中,UAG(琥珀密码子)的含义是绝对的:“停车!翻译结束!”它是红灯,是句号,是蛋白质合成的终点。
但是,科学家们早就注意到,有一类特立独行的产甲烷古菌(Methanogenic archaea),它们拥有一种名为吡咯赖氨酸(Pyrrolysine,简称Pyl)的独门秘籍——这是生物界的第22种氨基酸。这种氨基酸对它们代谢甲胺(一种存在于环境甚至人类肠道中的化合物)至关重要。
诡异的事情发生了:编码这个Pyl氨基酸的密码子,竟然就是那个代表“停止”的UAG
这就像在英语字典里,“STOP”这个词同时也被定义为“GO”。细胞究竟是怎么搞清楚何时该停,何时该走的?
以前,科学家们认为这背后一定有精密机关。比如第21种氨基酸(硒半胱氨酸),就需要一个特殊的“通行证”(SECIS序列)才能让核糖体无视红灯,强行通过。
于是,伯克利的研究团队对模式生物——巴氏甲烷八叠球菌(Methanosarcina acetivorans展开了地毯式搜索,试图找到类似的“通行证”。
结果令人大跌眼镜:根本没有!
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为了实锤,研究人员对这种古菌中的关键基因rdmS进行了测试。如果UAG代表停止,你会得到一个短蛋白(26.2 kDa);如果UAG代表Pyl,你会得到一个长蛋白(112.8 kDa)。
Western Blot实验结果出来的那一刻,所有人都沉默了:两条条带同时出现了。
这意味着,同一个mRNA上的同一个UAG位点,在同一个细胞里,既被读成了“停止”,也被读成了“继续”。这根本不是什么精密调控,而是一场“模棱两可”的赌博!
细胞似乎在说:“我也不知道该咋办,干脆两个都要吧。”
这种混乱难道不会导致细胞崩溃吗?造出一堆错误的蛋白质垃圾,细胞不就死翘翘了?
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但事情显然不是这样,研究团队提出了一个基于“供需关系”的模型。
当这种古菌生活在甲胺环境中时,它需要大量合成甲基转移酶(这些酶里全是UAG密码子),对Pyl的需求激增(Demand),远远超过了供应(Supply)。这就导致UAG的“通读效率”实际上降低了,大部分时候还是当作“停止”来用。
这听起来像是个Bug(缺陷),但实际上是个Feature(特性)。为了在混乱中求生,这种古菌在漫长的进化中做了一次壮士断腕般的“基因大清洗”:
它们把基因组里绝大多数无关紧要的UAG都删掉了!在普通生物中,UAG作为终止信号的使用率可能高达22%,但在这类古菌中,这一比例被压缩到了惊人的5%甚至更低(1%-5%)。
换句话说,既然我分不清红绿灯,那我就把路上绝大多数红绿灯都拆了,只保留必须的那几个!
这项研究告诉我们要对大自然保持敬畏。生命并不总是精确的机器,有时候,适度的“模糊”和“混乱”反而是生存的最高智慧。
如果这种机制能被人类掌握,也许在未来,我们就能通过人为制造一点“混乱”,让那些因为基因突变导致蛋白提前终止的遗传病患者,重新获得生命的希望。
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参考文献:
- Shalvarjian, K. E., et al. (2025). Methanogenic archaea encoding Pyrrolysine maintain ambiguous amber codon usage.Proceedings of the National Academy of Sciences, 122(45), e2517473122.
- University of California - Berkeley. (2025, December 4). Scientists Have Discovered an Organism That Breaks Biology’s Golden Rule.
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