题目:
YuPingFeng (YPF) upregulates caveolin-1 (CAV1) to alleviate pulmonary fibrosis through the TGF-β1/Smad2 pathway
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研究思路梳理:
本研究采用“网络预测 + 实验验证”的双轮驱动策略,首先通过TCMSP、GEO、UniProt等数据库筛选玉屏风散的活性成分与肺纤维化相关靶点,构建“成分-靶点-疾病”网络;随后利用PPI网络、功能富集分析与中心性计算识别核心靶点;最后在BLM诱导的肺纤维化细胞模型中,通过Western blot、RT-qPCR、免疫荧光与ELISA等技术验证关键靶点与通路机制。
主要结果:
1. 活性成分与靶点筛选
从TCMSP数据库中筛选出24个活性成分(黄芪12个、白术4个、防风8个),并鉴定出178个玉屏风散作用靶点。从GEO数据集GSE53845中获取615个肺纤维化差异表达基因(上调342个,下调273个)。通过韦恩图分析,最终筛选出18个玉屏风散抗肺纤维化的潜在候选基因。
2. 成分-靶点网络构建与关键成分识别
构建“YPF成分-靶点”网络图,发现山奈酚(kaempferol)、槲皮素(quercetin)和7-O-甲基异芒柄花素(7-O-methylisomucronulatol)是连接靶点数量最多的三种关键活性成分,提示其在抗纤维化过程中可能发挥核心作用。
3. 功能富集分析与通路预测
Metascape富集分析显示,18个候选基因显著富集于肿瘤坏死因子响应、NF-κB生存信号、凋亡过程正调控、低氧响应、细胞迁移等关键生物过程与通路,提示YPF可能通过调控炎症、凋亡与纤维化相关通路发挥作用。
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