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为什么有人喝凉水都长肉?50 万人基因研究揭密|249 种代谢物背后,这些基因是“隐形操控者”

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(来源:生物谷)

转自:生物谷

有人顿顿大鱼大肉却血脂正常,有人清淡饮食仍代谢紊乱——这种 “不公平” 的背后,藏着基因对新陈代谢的隐秘调控。如今,伦敦玛丽女王大学团队发表在《Nature Genetics》的研究,用 50 万人的基因数据绘制出全球最大规模 “人类代谢遗传图谱”,不仅找到 249 种血液代谢物的基因 “操控者”,更发现心血管病、糖尿病等代谢性疾病的全新防治靶点,为精准医疗按下 “加速键”。

全球每年约 1790 万人死于心血管疾病,血脂异常、代谢紊乱是核心诱因。过去,科学家对基因与代谢的关联研究多局限于小样本或单一族群,难以揭示普适规律。

这次研究团队整合英国生物银行 45 万人(涵盖欧洲、非洲、南亚三大族群)的基因数据,用核磁共振技术精准测量 249 种代谢物,包括 14 种脂蛋白亚型(如超大极低密度脂蛋白、小高密度脂蛋白)、氨基酸、酮体等关键指标,最终识别出 29824 个 “基因-代谢物” 关联,定位到 753 个基因组区域,相当于为代谢调控找到了数百个 “基因开关”。

更令人意外的是,这些基因调控模式在不同族群和性别中高度一致。比如非洲族群中常见的 CD36 基因变异(欧洲族群中罕见),会降低欧米伽 3 脂肪酸浓度,与该基因在脂肪酸转运中的功能完全匹配;男女之间代谢相关基因的效应相关性高达 0.98,仅 360 个位点存在轻微性别差异,且方向一致,说明人类代谢的遗传基础具有跨族群、跨性别的普适性。这种一致性为开发通用型代谢疾病药物提供了重要依据。

研究不仅验证了已知代谢基因的作用,更挖出一批 “新角色”。比如过去较少被关注的 SIDT2 基因,其罕见变异会影响高密度脂蛋白(HDL,“好胆固醇”)的分泌,携带该变异的人,HDL 相关代谢指标异常的概率显著升高;JAK2 基因的罕见突变不仅与血液疾病相关,还会通过影响胆固醇转运蛋白 ABCA1,降低 HDL 清除胆固醇的能力,间接增加心血管病风险。这些发现将原本分散的研究线索串联,为代谢调控机制补上关键拼图。

团队还首次分析了 “从罕见到常见” 全频谱基因变异的代谢效应。比如 SLC13A5 基因,无论是罕见的功能缺失变异(每拷贝使柠檬酸浓度升高 1.4 个标准差),还是常见的多态性位点,都指向柠檬酸代谢异常,形成清晰的 “等位基因系列”;ANKH 基因的 4 个常见变异和 1 个罕见变异,则共同调控血清柠檬酸水平,这种 “罕见-常见” 变异的协同效应,为理解代谢疾病的遗传多样性提供了全新视角。


循环代谢产物的共同遗传调控

更关键的是,研究找到代谢与疾病的 “基因桥梁”。比如血管内皮生长因子基因(VEGFA),过去因调控血管生成被用于癌症治疗,此次发现其变异会影响 HDL 颗粒大小——携带特定变异的人,HDL 颗粒更大,冠心病风险降低 35%(OR=0.65,95% CI 0.50-0.83)。这意味着,未来或可通过调控 VEGFA 改善 HDL 功能,为无法通过他汀类药物降低心血管风险的患者,提供全新治疗路径。类似地,PNPLA3 基因变异虽不直接影响低密度脂蛋白(LDL,“坏胆固醇”),却会改变 LDL 颗粒大小和极低密度脂蛋白(VLDL)特性,解释了为何部分人 LDL 正常仍有心血管风险。

值得注意的是,研究还揭示了基因 “多效性” 的复杂模式:约一半代谢相关基因会通过 “垂直多效性” 调控上下游代谢通路(如 ANGPTL3 基因同时影响甘油三酯、HDL 和磷脂),另一半则通过 “水平多效性” 影响互不相关的代谢过程(如 APOB 基因同时调控脂蛋白和肌酐)。这种分类为区分 “因果代谢物” 和 “伴随代谢物” 提供了依据,避免后续药物研发走弯路。

尽管基因对代谢影响显著,但研究人员强调,代谢是基因与环境共同作用的结果。比如携带相同代谢风险基因的人,规律运动和健康饮食仍能显著降低疾病风险。未来,通过解读个人 “代谢基因图谱”,医生可精准预测代谢疾病风险,甚至定制饮食和用药方案,比如对 VEGFA 变异携带者,优先推荐能改善 HDL 功能的干预措施,让 “精准防治” 从概念走向现实。

这项研究不仅填补了代谢遗传领域的空白,更让我们看清:基因不是代谢的 “宿命”,而是健康管理的 “导航图”。当我们终于读懂这些藏在基因里的 “代谢密码”,或许就能真正掌握健康主动权,让 “喝凉水都长肉” 的无奈,成为过去式。

参考文献:

Zoodsma, M., Beuchel, C., Yasmeen, S. et al. A genetic map of human metabolism across the allele frequency spectrum. Nat Genet (2025). doi:10.1038/s41588-025-02355-3

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