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翻译组研究三剑客:带你快速搞懂Ribo-seq、Polysome profiling和RNC-seq

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前沿

在转录组时代之后,翻译组正逐步成为揭示基因表达调控“最后一公里”的关键。新使生物现已搭建三大翻译组测序技术服务平台:超高分辨率Ribo-seqPolysome profiling以及RNC-seq

这些技术各有所长,覆盖从单核糖体到多聚核糖体的不同层级,满足基础研究与临床应用的多样需求。本文将带您快速了解,帮助您选择最适合自己的技术。


技术介绍

超高分辨率Ribo-seq平台

从单核糖体到双核糖体,揭示翻译精细调控

01

Ribo-seq核糖体印迹分析

核心原理

通过核酸酶消化未被核糖体保护的RNA片段,仅保留核糖体包裹的区域,对这些核糖体保护片段(RPFs)测序,以单核苷酸精度描绘翻译状态

适用场景

  • 测量翻译效率(TE)

  • 单碱基分辨率分析翻译起始位点(TIS)与终止位点(TTS)

  • 检测非标准翻译事件(如uORF、框移)

  • 发现非注释小肽(micropeptide)

推荐人群

注重翻译调控机制的研究者,如关注启动位点选择、非编码区翻译、翻译效率精确计算,肿瘤新生抗原的挖掘等

02

Disome-seq双核糖体印迹分析

核心原理

在部分应激、异常或翻译负载过高的条件下,核糖体可能在mRNA上“拥堵”或“碰撞”。通过核酸酶消化未被核糖体保护的RNA片段,捕获富集被两个相邻核糖体保护的RNA片段,对这些区域进行测序,用于研究翻译过程中的特殊情况

适用场景

  • 研究核糖体碰撞(ribosome collision)机制

  • 探索翻译质量控制通路(如RQC、NGD)

  • 分析应激条件下的翻译调控

  • 功能性小肽或uORF翻译拥堵分析

推荐人群

注重非经典翻译调控的研究者,适合翻译拥堵、核糖体停滞、应激条件下的翻译动态分析项目

新使生物Ribo-seq优势

超高分辨率:高质量的周期性,无碱基偏好

低起始量:可针对微量细胞及组织样本

高统一性:在一份样本中可同时进行翻译组和转录组两项分析

适配多种物种与样本类型:哺乳动物、植物、真菌等细胞和组织均适用

个性化分析:拥有专业翻译领域生信团队,可按需求分析出图

点击图片查看详细介绍

Polysome profiling平台

三种策略评估直观评估翻译活跃度

01

Polysome profiling多聚核糖体分析

核心原理

通过蔗糖密度梯度离心分离细胞中的各类亚基、核糖体单体与多聚核糖体,结合吸光曲线分析整体翻译状态

适用场景

  • 研究翻译状态的全局动态变化,如药物处理、应激条件下的蛋白合成变化

  • 分析特定mRNA的翻译活跃性,可结合qPCR或RNA-seq

  • 探索转录后调控机制(如UTR结构、调控因子作用)

推荐人群

需要直观对比整体翻译状态强弱的用户,研究转录-翻译过程及转录后调控的课题组,有明确目标基因、想检测其在各级核糖体组分中的分布

02

Polysome-seq多聚核糖体结合RNA测序

核心原理

在经典Polysome profiling的基础上,提取多聚核糖体各组分样本中的RNA并测序,深入分析特定mRNA的翻译状态和多聚核糖体分布特征

适用场景

  • 估算翻译效率(TE),通过多聚核糖体富集的mRNA相较于总RNA来估算TE

  • 适合整体水平上分析翻译调控、筛选关键调控基因

推荐人群

关注多个样本条件对比下的整体翻译水平变化,需要对整个转录组范围进行翻译活跃度评估,有较大样本量、希望以较低成本获取翻译信息的客户

03

酶切-Polysome profiling

核心原理

在Polysome profiling的基础上进行酶切处理,打断未保护的mRNA,仅保留被核糖体保护的片段,通过发现二聚体或三聚的变化来测核糖体碰撞(collision)与翻译停滞(stalling)现象

适用场景

  • 直观发现核糖体碰撞的现象

  • 发现不同应激下核糖体的变化情况

  • 实验流程上可衔接Disome-seq进行测序

推荐人群

需要直观了解核糖体在mRNA上的拥堵或碰撞现象,有一定机制探索需求,联合Ribo-seq或Disome-seq来一起验证分析的科研学者

新使生物Polysome profiling优势

流程成熟操作技术经验丰富,大批量样本可快速完成

设备齐全引进全套最新设备,为客户降低研究成本,缩短实验周期

适配多种物种与样本类型哺乳动物、植物、真菌等细胞和组织均适用

点击图片查看详细介绍

RNC-seq平台

核糖体结合mRNA的特异性捕获

RNC-seq核糖体-新生肽链复合物结合转录组测序

核心原理

采用蔗糖垫离心(sucrose cushion)沉淀法富集核糖体复合物(RNCs),包含80S及多聚核糖体上的新生肽链,再提取结合在核糖体上的mRNA后进行测序

适用场景

  • 快速判定哪些mRNAs正在翻译

  • 检测整体翻译水平变化(如应激、突变)

  • 筛选翻译依赖调控靶点

推荐人群

适合快速筛查翻译活跃RNA的研究,如突变体筛选、转录后调控、差异分析初筛,非编码RNA的调控等

新使生物RNC-seq优势

灵活建库:客户可自行选择不同的建库方式,满足自己的课题需求

高标准方法:不同于过柱分选,我们使用高于行业标准且严格遵循文献方法的蔗糖垫超速离心法富集RNC复合物。

设备齐全:引进全套最新设备,为客户降低研究成本,缩短实验周期

适配多种物种与样本类型:哺乳动物、植物、真菌等细胞和组织均适用

点击图片查看详细介绍

选择新使生物

翻译组全平台技术覆盖,满足各类需求

从Ribo-seq到Polysome profiling、RNC-seq,全面支持不同深度的翻译调控研究,一站式满足多样科研需求

技术创新与设备齐全,软硬实力兼具

自主研发并持续迭代的QEZ-seq®技术,搭配最新的梯度离心分选设备,前沿的技术能力+完善的实验条件,为高质量交付数据结果

样本类型灵活,物种覆盖度大

我们的翻译组Ribo-seq支持低起始量样本,物种类型包括动植物和真菌,样本类型支持细胞和组织,特殊样本可免费测试

服务灵活可选择,不拘泥于标准流程

支持翻译组、转录组、仅建库、全流程托管等多种合作模式,部分项目可灵活选择建库模式,科研更自由

专业生信分析支持,科研成果更进一步

翻译组学的分析内容庞大,需求差异性大,我们从标准分析到一对一的个性化分析,全部囊括

新使生物专业翻译组一站式服务平台
产品名称

网站:www.neoribo.com

销售区域:中国大陆、亚太地区、美国

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