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重磅成果问世,南科大副教授:做科研“不要在死胡同里钻牛角尖”

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先确认研究方向的科学意义、可行性和潜在突破点,再梳理机制框架,然后逐步完善和丰富实验细节。遇到瓶颈及时调整,尽量避免内耗和重复劳动。这种工作方法让她的团队高效推进了两项重要课题的研究。

撰文 | 刁雯蕙(《中国科学报》记者)

“如果之后您有这方面的重要进展,欢迎优先考虑我们。”今年2月份和4月份,南方科技大学副教授贾宁在新西兰举办的CRISPR 2025和在法国举办的SISB 2025国际会议上,汇报完自己的最新研究成果之后,多家国际学术期刊编辑纷纷向她抛出了橄榄枝。

3个月后,她汇报的研究成果以两篇论文的形式接连两周登上《科学》杂志。“这两项工作像是同一枚硬币的两面。”贾宁在接受《中国科学报》的采访时说道,“一个揭示细菌如何用前所未见的方式抵御噬菌体侵染,另一个则展示噬菌体如何用巧妙的策略反制细菌的免疫系统。”

连续发表两项重要成果,科研工作是怎么规划的?“我们的目标是希望解决领域内的一些重要科学问题,研究工作做得扎实,发表顶刊是水到渠成的事情。”在贾宁看来,在选对研究方向的同时,要注重团队沟通与节奏管理,遇到瓶颈要及时调整策略,避免内耗及重复劳动,“不要在死胡同里钻牛角尖”。

贾宁

1

揭示细菌与噬菌体的“攻防战”

今年4月24日,贾宁团队与美国华盛顿大学Alexander J Meeske团队合作在《科学》发表研究,发现小RNA抗CRISPR因子如何打破细菌抵抗外敌的CRISPR-Cas防御系统。短短一周后,贾宁团队的独立研究成果于5月1日再次登上《科学》杂志,首次揭示细菌防御相关逆转录酶DRT9如何利用其独特的功能机制,实现对噬菌体的免疫防御。

细菌与噬菌体(感染细菌的病毒)之间的博弈,是地球上最古老、最激烈的生存战争,细菌也由此进化出了免疫系统。除了人们熟知的RM和CRISPR-Cas系统,科学家们已经发现了上百种细菌免疫机制。

在独立研究中,贾宁团队首次发现了一种通过合成长的poly(A)的核酸来由DRT系统介导细菌免疫反应的新型抗噬菌体机制。这个系统由一个细菌逆转录酶DRT9和一段非编码RNA共同组成。在噬菌体入侵被识别后,它能够逆转录产生大量富含poly(A)的序列,形成长度可达数千个核苷酸的单链cDNA分子,从而阻断噬菌体的复制。“DRT9抗噬菌体免疫机制的发现,不仅扩展了我们对细菌抗病毒机制中的认知,以及对逆转录酶的认知,也可能为未来生物技术工具开发提供新的分子来源。”贾宁介绍。

而在前一项研究中,贾宁团队与合作者则聚焦于噬菌体如何利用移动遗传元件反制CRISPR免疫系统。他们发现,一种来源于内源整合质粒的小RNA分子,通过模拟crRNA结构来抑制CRISPR免疫系统的活性。这一发现不仅扩展了对CRISPR系统调控机制的理解,也为今后开发基于RNA的CRISPR调控工具提供了新思路。

“这两项工作就像展示了细菌与噬菌体的一场‘攻防博弈战’,从不同角度揭示了细菌如何抵御噬菌体、质粒等可移动遗传元件入侵,以及这些可移动遗传元件又是如何‘反制’细菌免疫系统的,分别代表了细菌免疫与噬菌体等可移动遗传元件反免疫机制研究的最新进展。”贾宁表示。

贾宁在CRISPR 2025国际会议上作报告

2

“不在死胡同里钻牛角尖”

2022年启动这两项研究时,贾宁刚加入南方科技大学医学院不久,建立了自己的独立实验室。她的实验室共有博士生、博后等10人,来自生物化学、微生物、结构生物学等不同领域,团队虽小但注重高效。

历时3年多的研究过程中,贾宁团队常常会遇到实验不出结果、数据不一致、现有的理论无法解释观察到的现象等情况。他们的策略是不断分析问题、拆解问题,在细节中找灵感,从文献中找线索,反复检查实验设计,必要时换一个思路和方法重新尝试。

让贾宁印象最为深刻的是,研究团队第一次看到测序结果全是大量逆转录酶合成的poly(A)分子序列的时刻。“那一刻既激动又敬畏,因为我们意识到可能真的发现了一种全新的免疫机制,也更加坚定了继续探索的信心。”

科研工作中,遇到困难是常态,而贾宁团队的方法是避免内耗,不在死胡同里钻牛角尖。谈到科研规划的经验时,贾宁认为,应该先确认研究方向的科学意义、可行性和潜在突破点,再梳理机制框架,然后逐步完善和丰富实验细节,避免一开始就陷入细节研究。此外,课题组还会定期交流实验进展,遇到瓶颈及时调整,尽量避免内耗和重复劳动。这种工作方法让团队在过去3年,高效推进了两项重要课题的研究。

“工作的时候专注投入,休息的时候尽情放松。我常常和课题组成员说,科研是场马拉松,在高效工作的同时,也要学会快乐生活。”作为两个女儿的母亲,贾宁把家庭视为最重要的“充电站”。“每天回家看到她们,陪她们玩一会儿,跟家人聊聊天,整个人就放松下来了。”贾宁笑着说。

在她看来,一个人最好以80%左右的努力去应对日常工作,留出余力用于锻炼和体验生活,长期处于100%的努力状态并非明智之举,反而可能削弱创造力和幸福感,适时放慢脚步,正是为了更长远、更稳健地前行。

贾宁团队

3

“科学是我们的良药”

“Science is our medicine(科学是我们的良药)。”在采访过程中,贾宁分享了一句她极为认同的话。从小,她就对“生命是如何运行的”“人为什么会生病”“药物为何有效”等问题充满好奇。对贾宁而言,科研不仅是职业选择,更是探索生命奥秘的途径。

2017年,从中国科学技术大学博士毕业后,贾宁前往美国纪念斯隆-凯特琳癌症中心从事博士后研究,开展CRISPR免疫系统相关的研究。2021年,贾宁回国加入南科大,这一次她有了新的身份——大学老师。

作为一名新手教师,既要兼顾科研工作,又要承担教学任务,对贾宁来说无疑是一个新的挑战。“那时,我常常担心在讲台上讲不好课。幸运的是,这种焦虑的状态并没有持续很久。医学院饶海教授给予了我很大的指导和帮助,他是一位非常关心并支持青年教师成长的好老师。”

贾宁回忆道,为了学习如何讲课,她借来其他老师的课件仔细学习,阅读大量的教科书,追踪《科学》《自然》杂志发表的最新研究,甚至旁听饶海的《科学交流与写作》课程,逐渐形成了自己的讲课风格。“在旁听饶海老师课程的过程中,我对科研方法和科研思维有了更深入的理解与反思,这对刚成为一名独立PI的我来说,帮助非常大。”

“我不喜欢糊弄,做事情一定在自己能力范围内认真做好。”贾宁坦言,给学生上课能夯实做科研方面的基础知识,而研读前沿文献又能为教学提供新思路。这是一个教学相长的过程。第一次开设《现代分子生物学》课程,她被学生评为了“前15%最喜爱的教师”。

在贾宁看来,基础研究短期内看似“无用”,却可能是解决人类重大问题的根本途径。目前,她的团队正在探索这两项研究的实际应用:一方面通过调控细菌免疫机制优化噬菌体疗法,解决日益严重的耐药菌问题;另一方面挖掘这些独特分子在合成生物学和基因编辑中的潜力。

相关论文信息

http://doi.org/10.1126/science.adr3656

http://doi.org/10.1126/science.ads4639

本文经授权转载自微信公众号“科学网”,文中图片均为受访者提供,原标题《接连两项重磅成果问世,南科大副教授:做科研“不要在死胡同里钻牛角尖”》。

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