综述解读：NGS检测在HR+/HER2-转移性乳腺癌PTEN基因检测中的应用

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NGS技术凭借独特优势，成为解析PI3K通路基因变异及伴随分子事件的关键

激素受体阳性/HER2阴性（HR+/HER2−）转移性乳腺癌（MBC）的分子异质性显著影响其临床诊疗策略。其中，磷脂酰肌醇3激酶（PI3K）通路相关基因（如PIK3CA、AKT1及PTEN）的变异是驱动该亚型肿瘤发生、进展及耐药的核心机制，且检测结果能够直接影响患者靶向治疗选择。二代测序（NGS）技术凭借其高通量、多基因同步检测的优势，成为解析PI3K通路变异及伴随分子事件（如ESR1突变、BRCA1/2缺失）的关键工具。2025年5月25-27日， 第33届欧洲胸外科医师协会（ESTS）年会于 匈牙利隆重召开 。在本届年会上，KEYNOTE-671研究 针对Ⅱ 期 患者 的第三次中期分析（IA3）结果披露。作为目前唯一在NSCLC围手术期治疗中同时取得 无事件生存期（ EFS ） 和 总生存期（ OS ） 双 终阳性 结果的Ⅲ期临床研究，其最新进展无疑将为NSCLC 的 治疗带来重要启示与实践价值。

目前，欧洲肿瘤内科学会（ESMO）已明确推荐NGS作为HR+/HER2−MBC患者的标准诊断方案，其临床价值不仅体现在治疗靶点的精准筛选，更在于通过多维分子图谱揭示肿瘤进化轨迹与耐药机制。然而，现有研究多聚焦于PIK3CA热点突变，对PTEN变异（包括缺失、移码突变等）的分子特征及其临床意义尚缺乏系统性解析。针对这一挑战，近期发表在Critical Reviews in Oncology/Hematology杂志的一篇综述文章基于NGS技术平台探讨了HR+/HER2−MBC中PI3K通路基因变异特别是PTEN变异的检测现状，以期为NGS作为该亚型患者的精准分子检测选择提供新的临床证据[1]。

图1 研究标题

聚焦PTEN变异检测：传统检测方法的临床局限性与NGS检测的独特优势

PI3K信号通路的失调与肿瘤发生和进展显著相关，约50%的HR+/HER2−MBC患者存在该通路异常，其中PIK3CA突变最为常见（约40%），AKT1突变占5%，PTEN功能缺失性变异占5%。目前，已有多种针对PI3K通路的靶向治疗药物获得美国食品药品监督管理局（FDA）和欧洲药品管理局（EMA）批准用于MBC治疗。因此，精准检测PI3K通路变异已成为MBC个体化诊疗的关键环节之一。在PI3K通路中，PTEN状态的评估面临独特挑战，因其变异类型可涉及DNA、RNA及蛋白水平的复杂改变，这种复杂性叠加其他可干预生物标志物（如ESR1、BRCA）的分子谱分析需求，使得通路整体评估更为困难。

图1 PI3K/Akt/mTOR信号通路的示意图，包括已批准药物及其靶点

>>>>IHC：PTEN分析的实用之选，但局限不容忽视

IHC是一种普及度高且成本效益相对较高的技术，理论上可作为PTEN分析的实用选择。IHC能够直观确认PTEN蛋白在肿瘤区域内的表达水平及分布特征，使病理学家得以对蛋白进行半定量定位分析。然而，IHC评分结果易受肿瘤内异质性影响，不同肿瘤区域的蛋白表达差异可能导致结果显著波动，取材部位不同可能产生结果偏差。此外，IHC检测流程及判读缺乏标准（如抗体选择、染色条件及评分体系），降低了结果的可重复性与诊断可靠性。

此外，IHC的另一核心局限性在于其无法关联蛋白表达水平与功能活性。例如，非编码区突变、剪接变异体或翻译后修饰（如磷酸化异常）可能破坏PTEN功能，但此类改变不会显著影响IHC检测的蛋白丰度，导致假阴性结果。同样，IHC无法区分功能性与非功能性PTEN蛋白，而后者对下游PI3K/AKT通路活性的调控具有决定性意义。这些缺陷严重限制了IHC在需基于PTEN功能状态指导治疗决策场景中的应用价值。

>>>>PCR：适合PTEN点突变检测，但缺乏分析潜力

PCR技术通过靶向已知基因区域（如外显子及热点突变位点），可高特异性地检测PTEN点突变、小片段插入/缺失等变异，其灵敏度与精确性在单基因检测中表现突出。然而，PCR的检测范围局限于预设的基因片段，无法识别结构重排（如大片段缺失/倒位）、拷贝数变异或表观遗传沉默等复杂变异类型，而这些改变是PTEN功能失活的重要机制。

此外，另一关键限制在于PCR缺乏功能或背景分析能力。例如，PCR虽可鉴定PTEN基因突变，但无法判断该变异是否导致蛋白功能丧失或影响PI3K/AKT通路活性。在HR+/HER2−乳腺癌等需综合多基因变异进行精准分型的场景中，PCR的单一基因检测模式无法提供PTEN通路全局状态的关键信息，难以满足临床需求。

>>>>NGS：全面解析PTEN改变的多维度工具

NGS技术能够对PTEN变异（包括单核苷酸变异、拷贝数变异、结构重排及表观遗传改变等）进行多维综合分析。与PCR（仅能检测预设区域）或IHC（仅评估蛋白表达而无法揭示遗传学改变）相比，NGS通过标准化指南提供PTEN状态的全面评估，克服了辅助检测方法的局限性（如IHC的观察者间变异性及存档样本中蛋白降解导致的假阴性）。同样，基于PCR的检测虽特异性高，但无法识别基因缺失或表观遗传沉默，而这些变异对MBC的PTEN检测至关重要。此外，NGS还可同步评估其他可干预基因（如PIK3CA、AKT1、BRCA、HER2及ESR1）的变异，提供更精细的分子特征。此外，尽管NGS与液体活检技术的结合进一步拓展了其临床应用潜力，但PTEN缺失的液体活检检测仍面临技术挑战与争议。

诚然，NGS检测成本高昂，且高度依赖实验室基础设施、生物信息学分析能力及大量资金投入。同时，其数据解读的复杂性尤为突出，例如需区分致病性突变与意义未明的变异。此外，NGS结果的回报周期通常长于PCR或IHC，可能延迟治疗决策的制定。然而，随着HR+/HER2−MBC中全面分子分型检测需求的提升，NGS作为标准诊断工具的临床价值愈来愈获得临床广泛认可。

结论：NGS是HR+/HER2−MBC分子检测的首选方法

PI3K通路靶向药物在HR+/HER2−MBC中的疗效凸显了精准评估该通路分子状态的重要性，尤其是筛选可能从AKT1抑制治疗中获益的患者群体。尽管IHC和PCR已被广泛应用于实体瘤中PTEN变异的检测，但两者在全面评估HR+/HER2− MBC患者PTEN状态时均存在显著局限性。

NGS技术通过多维检测能力（包括单核苷酸变异、拷贝数变异、结构重排及表观遗传改变）可系统解析PTEN基因的完整变异谱，同时提供肿瘤生物学特征的深度洞见，从而克服传统方法的不足。然而，NGS的临床应用需依托标准化的质量控制流程与指南规范，以确保检测结果的精确性与可重复性。在尚未建立统一标准的医疗场景中，构建区域性技术协作网络以支持NGS的可持续实施（尤其是全基因组谱分析）将成为推动精准诊疗的关键举措。

医学界肿瘤领域

参考文献：

[1]Fusco N, Malapelle U. Next-generation sequencing for PTEN testing in HR+/HER2- metastatic breast cancer. Crit Rev Oncol Hematol. 2025;207:104626.

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审批编号：CN-60053 过期日期：2025-11-19

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