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《自然》子刊:针对癌细胞致命弱点,创新小分子有望克服癌症耐药性难题

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▎药明康德内容团队编辑

编者按:染色体不稳定性(CIN)是癌细胞的一个普遍特征,这一特性不仅驱动了肿瘤的异质性和进化,也成为了其特有的弱点。然而,尽管这一特性在癌症生物学中具有重要意义,其在临床治疗中的应用潜力尚未得到充分开发。近期,来自Volastra Therapeutics的研究团队在《自然-通讯》(

Nature Communications
)发表研究论文,开发了一种靶向小分子抑制剂VLS-1272,为针对CIN的新型抗癌策略提供了重要的理论依据和治疗工具。在该论文中, 药明康德为研究团队提供了体内药理分析服务。

KIF18A:癌症治疗潜在靶点

在细胞分裂过程中,遗传物质的精确分离对生物体的生存至关重要。然而,染色体分离错误会导致遗传物质分配不均,这种现象被称为染色体不稳定性(CIN)。CIN在大多数人类癌症中普遍存在,与多种实体瘤和血液肿瘤的发生发展密切相关。具体而言,CIN不仅增加了肿瘤的异质性,还可能导致肿瘤对标准治疗药物产生耐药性,并促进癌症的转移进程。因此,开发针对CIN的治疗策略具有重要的临床意义,不仅有望延长患者的生存期,还可能通过克服药物耐药性为癌症治疗带来广泛的益处。

在这项研究中,研究人员利用癌症依赖性图谱(DEPMAP)数据库,对细胞系的CIN进行量化并分级。基于这一分析,研究团队发现,KIF18A在高CIN细胞中表现出更高的必需性。结合本研究的数据以及既往发表的机制研究和实验证据,KIF18A被确立为CIN相关癌症的潜在治疗靶点。

为了评估CIN细胞对KIF18A的依赖性,研究人员构建了CIN细胞系模型,并且敲除了KIF18A。实验结果显示,KIF18A缺失显著抑制了高CIN细胞的增殖,且这种抑制作用在高CIN细胞中更为明显。这一结果与DEPMAP数据库的分析一致,进一步证实了高CIN细胞对KIF18A缺失的高度敏感性。

为了验证这一发现的普适性,研究人员在乳腺癌细胞系中进行了进一步实验。结果表明,在不同CIN水平的乳腺癌细胞中,降低KIF18A表达均能抑制细胞增殖,且抑制程度与细胞的CIN基线水平呈正相关。在高CIN水平的乳腺癌细胞中,KIF18A敲低不仅显著抑制细胞增殖,还导致G2/M期细胞比例增加。这些数据表明,细胞通过在有丝分裂期停滞来响应KIF18A的缺失。

图片来源: 123RF

为了进一步评估KIF18A在肿瘤生长中的作用,研究人员将表达对照质粒或KIF18A shRNA质粒的肿瘤细胞植入免疫缺陷小鼠体内,这些肿瘤细胞分别接受或不接受强力霉素(Dox)处理。实验结果显示,与植入转染对照质粒的细胞或未接受Dox处理的小鼠相比,经Dox处理且KIF18A shRNA诱导的肿瘤细胞的生长显著延迟。此外,对肿瘤样本的分析证实了KIF18A的有效敲低。这些体内实验结果表明,CIN肿瘤细胞在体内生长过程中高度依赖KIF18A,进一步支持了KIF18A作为CIN相关癌症治疗靶点的潜力。

VLS-1272:新型KIF18A靶向抑制剂

为了进一步评估KIF18A作为治疗靶点的潜力,研究人员开发并运行了一个高通量筛选平台,旨在寻找能够抑制KIF18A的ATP酶活性的小分子化合物。通过对一个包含5万种类先导化合物的库进行筛选,研究人员重点针对KIF18A马达结构域(氨基酸1-374)的微管依赖性ATP酶活性进行抑制剂的筛选。经过多轮药效学和药代动力学性质的优化,最终获得了候选化合物VLS-1272。

VLS-1272的分子结构(图片来源:参考资料[1])

VLS-1272具有一系列优异的特性,包括口服生物利用度高、效力强、非ATP竞争性、微管依赖性以及对KIF18A的高度选择性(相较于其他驱动蛋白)。该化合物能够强效抑制KIF18A的ATP酶活性,并阻止KIF18A在有丝分裂纺锤体上的转移,从而导致染色体集合缺陷、诱导有丝分裂停滞与细胞死亡。这些作用机制表明,VLS-1272是一种具有潜力的KIF18A靶向抑制剂,为CIN相关癌症的治疗提供了新的方向。

基于在100多种癌细胞系中对VLS-1272的分析结果,VLS-1272展现出对CIN癌细胞的特异性抑制作用,这一特性显著区别于其他处于临床开发阶段的抗有丝分裂药物。在肿瘤异种移植模型中,VLS-1272治疗诱发了显著的有丝分裂缺陷,并以剂量依赖的方式抑制了肿瘤生长。研究人员进一步证明,无论是通过遗传学手段敲低KIF18A,还是通过药物抑制其活性,均能有效抑制肿瘤生长。这些数据共同揭示了KIF18A抑制剂在临床治疗中的潜在价值。

综上所述,本研究揭示了KIF18A抑制剂通过靶向CIN来抑制肿瘤生长的新策略。作为一种广泛存在于恶性肿瘤中的特征,CIN通过克隆异质性驱动癌症转移并加速耐药突变演化。靶向抑制KIF18A能够选择性清除具有高水平CIN的肿瘤细胞,破坏其适应性生存优势,从而延缓耐药表型产生。作为一款新型KIF18A抑制剂,VLS-1272在临床前模型中展示出了显著的抗癌效力。其独特优势在于不影响T细胞增殖,这为其与免疫检查点抑制剂的联合应用提供了可能。展望未来,研究人员将进一步探索KIF18A抑制的临床潜力,为CIN相关癌症的治疗开辟新的方向。

参考资料:

[1] Phillips, A.F., Zhang, R., Jaffe, M. et al. Targeting chromosomally unstable tumors with a selective KIF18A inhibitor.

Nat Commun
16, 307 (2025). https://doi.org/10.1038/s41467-024-55300-z

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