陕西
表观遗传修饰在转录调控中起着重要作用，如染色质重塑、组蛋白修饰和DNA甲基化等。染色质重塑因子PICKLE (PKL) 和组蛋白去乙酰化酶HDA6是基因沉默所必需的，但它们是否协同作用还有待进一步研究。
近日，武汉大学杨红春教授课题组在Plant Physiology发表了题为“PICKLE and HISTONE DEACETYLASE6 coordinately regulate genes and transposable elements in Arabidopsis”的研究论文，揭示了染色质重塑因子与组蛋白去乙酰化酶相互作用，通过调节靶位点的染色质状态协同抑制基因和转座子的表达。
该研究发现，T-DNA插入基因RING1A的启动子，导致插入位点核小体占据增加、H3K9ac水平降低，抑制RING1A的表达。遗传筛选发现，在此背景下突变染色质重塑PKL能够部分回复染色质的状态和RING1A的表达。进一步研究发现，HDA6和PKL相互作用，协同PKL共同调节该遗传背景下RING1A的表达。RNA-seq、MNase-seq和H3K9ac的ChIP-seq发现PKL和HDA6通过增加核小体密度和降低H3K9ac来抑制一些基因和转座子的表达。综上所述，染色质重塑因子和组蛋白去乙酰化协同改变染色质的状态抑制基因和转座子的表达。
武汉大学生命科学学院杂交水稻全国重点实验室博士研究生李文娟和张晓玲为该论文的共同第一作者，杨红春教授为该论文的通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金和中央高校基本科研业务费的资助。
论文链接：
https://doi.org/10.1093/plphys/kiae369
特别声明：以上内容(如有图片或视频亦包括在内)为自媒体平台“网易号”用户上传并发布，本平台仅提供信息存储服务。
Notice: The content above (including the pictures and videos if any) is uploaded and posted by a user of NetEase Hao, which is a social media platform and only provides information storage services.
