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80余位抗衰学者认证,Nature顶级综述:衰老细胞的核心标志竟是它

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近日,SenNet计划[1]发布阶段性重磅成果,首次全面总结了不同组织中衰老细胞的标志物,给出权威的检测建议[2]。80余位专家联合推荐,精准捕捉衰老细胞将不是梦。

图注:SenNet关于检测不同组织中衰老细胞的建议。刊登于顶级综述性期刊Nature Reviews Molecular Cell Biology(影响因子112.7)

很多抗衰人士听到衰老细胞,身体本能般想起:“衰老细胞积累引发慢性炎症”、“清除衰老细胞延缓衰老”等经典观点,但衰老细胞更是把双刃剑:

西班牙顶级学者Manuel Serrano提出,衰老细胞能较快激活免疫细胞,有对抗肿瘤的潜力[3];

加州大学Tien Peng教授、博士后研究员Nabora S. Reyes等,顶刊发文“年轻组织中的衰老细胞有效促进了组织器官修复和再生”[4]。

图注:时光派直播连线加州大学Nabora S. Reyes博士视频截图

在连线交流中,Nabora S. Reyes博士提到精准识别、靶向衰老细胞是具有挑战性的——“衰老细胞在不同组织中有差别,更会逃脱免疫系统监控。我们很难使用相同靶点或标记找到所有的衰老细胞。

而这,也同样是SenNet联盟学者们关注且头疼的问题。破局者必躬身入局,SenNet科学家们决定首先全面总结细胞衰老的标识。

无巧不成书,身为10年前首批被提出的九大经典衰老标识之一,细胞衰老也同样拥有九大标识。

图注:细胞衰老的九大标志(AI辅助汉化)

九大细胞衰老标识(深度学习请看)

①细胞周期停滞:衰老细胞积累p21或p16,抑制转录因子并下调增殖标志物,导致周期停滞;

②SASP(衰老相关分泌表型):包括多种促炎细胞因子、趋化因子、白细胞介素等,引发邻近细胞的旁分泌衰老;

③细胞核改变:组蛋白的翻译后修饰、DNA甲基化变化,促使异染色质形态改变,并通过细胞核向外释放特定蛋白,发出细胞应激或损伤信号;

④细胞表面标志物:诱导细胞p21或p16堆积的蛋白(如DEP1/NTAL/EBP50),与NOTCH1、NOTCH3、CD36、uPAR等分子;

⑤细胞形态改变:细胞衰老中会表现出扁平、增大、空泡化、多个/增大细胞核的特点,并伴有细胞质染色质碎片出现,与cGAS-STING通路触发干扰素反应有关;

⑥溶酶体含量增加:溶酶体数量、大小上升,如脂褐素的增加,可通过与衰老相关的β-半乳糖苷酶(SA-β-gal)活性去检测;

⑦代谢适应:线粒体功能障碍导致ROS生成增加,线粒体外膜通透性的改变还将释放mtDNA到细胞质,增加SASP含量;

⑧DNA损伤(DDR):细胞激活DDR而应对损伤,DDR过程表达p53蛋白诱导细胞衰老,且持续的DDR将促进SASP释放;

⑨抗凋亡途径的上调:RNAi靶向生存途径因子(BCL2L1、PI3K等),显示衰老细胞的活力显著降低。

九大标识整体概括了衰老细胞的特征,但具体到特定组织,是否标志物们的优先度有差别?

对此,联盟学者们细致梳理了来自224篇文献与328种标志物的信息,生物样本来源于14种小鼠、人体组织,涵盖了心血管系统、免疫系统、中枢神经系统、皮肤等9个系统,以及肝脏、肾脏、肺等器官。

数据结果显示,在多标识中,SASP,以高达近80%的出现频率,压倒性夺魁,成为最具代表性的衰老细胞标识。紧随其后为DNA损伤、细胞周期停滞与溶酶体变化。

下方表格展示了在三种及以上生物组织中高频出现的代表性标识,及其检测指标。

表格注:在三种或更多小鼠和人类组织出现的细胞衰老标志物(AI辅助汉化)

限于篇幅,仅部分展示,需获取全文的读者可小窗联系我们

虽总结了标识的整体情况与组织差异,但SenNet研究人员们仍一致认为:“不应使用单一标志指标细胞衰老状态,衰老细胞需要多标志去共同确定。”

这是因为机体存在“假阳性衰老细胞”现象,没有发生衰老的细胞中也可能存在衰老标志物。

例如巨噬细胞向M2表型的极化会导致代表细胞周期停滞的p16,以及衰老相关的β-半乳糖苷酶(SA-β-gal)的表达[5],即便这个巨噬细胞本身还很年轻、啥事没有。

在本篇专家推荐中,研究人员们建议:组织中至少需要检测三个标志物,而后确定细胞是否已经衰老。

表格注:专家推荐中举例说明的衰老细胞标志物检测

以及未来,机器学习和人工智能技术的持续开发,我们也从形态差异上更精确区分衰老细胞和非衰老细胞。

作为这份“重磅推荐”的幕后推动者、成立于2021年的SenNet计划,还将提供公开可访问的衰老细胞图谱,便于学界研究衰老细胞及其分泌分子的差异,希望致力于解决数据资源难获取问题,去建立通用术语与标准分类,团结衰老细胞研究人员,加速开发针对细胞衰老和改善人类健康的治疗方法。

SenNet联盟未来将计划

搭建多个细胞衰老图谱研究中心

加快新技术开发与应用

完善联盟枢纽与数据协调中心

图注:表征细胞衰老的蓝图。图源[6]

—— TIMEPIE ——

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参考文献

[1] https://commonfund.nih.gov/senescence

[2] Suryadevara, V., Hudgins, A. D., Rajesh, A., Pappalardo, A., Karpova, A., Dey, A. K., Hertzel, A., Agudelo, A., Rocha, A., Soygur, B., Schilling, B., Carver, C. M., Aguayo-Mazzucato, C., Baker, D. J., Bernlohr, D. A., Jurk, D., Mangarova, D. B., Quardokus, E. M., Enninga, E. A. L., Schmidt, E. L., … Neretti, N. (2024). SenNet recommendations for detecting senescent cells in different tissues. Nature reviews. Molecular cell biology, 10.1038/s41580-024-00738-8. Advance online publication. https://doi.org/10.1038/s41580-024-00738-8

[3] Marin, I., Boix, O., Garcia-Garijo, A., Sirois, I., Caballe, A., Zarzuela, E., Ruano, I., Stephan-Otto Attolini, C., Prats, N., Lopez-Dominguez, J. A., Kovatcheva, M., Garralda, E., Munoz, J., Caron, E., Abad, M., Gros, A., Pietrocola, F., & Serrano, M. (2022). Cellular senescence is immunogenic and promotes anti-tumor immunity. Cancer discovery, CD-22-0523. Advance online publication. https://doi.org/10.1158/2159-8290.CD-22-0523

[4] Reyes, N. S., Krasilnikov, M., Allen, N. C., Lee, J. Y., Hyams, B., Zhou, M., Ravishankar, S., Cassandras, M., Wang, C., Khan, I., Matatia, P., Johmura, Y., Molofsky, A., Matthay, M., Nakanishi, M., Sheppard, D., Campisi, J., & Peng, T. (2022). Sentinel p16INK4a+ cells in the basement membrane form a reparative niche in the lung. Science (New York, N.Y.), 378(6616), 192–201. https://doi.org/10.1126/science.abf3326

[5] Hall, B. M., Balan, V., Gleiberman, A. S., Strom, E., Krasnov, P., Virtuoso, L. P., Rydkina, E., Vujcic, S., Balan, K., Gitlin, I. I., Leonova, K. I., Consiglio, C. R., Gollnick, S. O., Chernova, O. B., & Gudkov, A. V. (2017). p16(Ink4a) and senescence-associated β-galactosidase can be induced in macrophages as part of a reversible response to physiological stimuli. Aging, 9(8), 1867–1884. https://doi.org/10.18632/aging.101268

[6] Roy, A. L., Sierra, F., Howcroft, K., Singer, D. S., Sharpless, N., Hodes, R. J., Wilder, E. L., & Anderson, J. M. (2020). A Blueprint for Characterizing Senescence. Cell, 183(5), 1143–1146. https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.10.032

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