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专访劲风生物|把AI融入细胞疗法开发中

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作为一种新型免疫治疗方法,肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)疗法通过从患者自身的肿瘤组织中采集并分离出具有特异性识别肿瘤细胞抗原能力的 T 淋巴细胞,在体外培养和大量扩增后回输到病人体内,从而扩大免疫应答并实现针对肿瘤的杀伤和清除。

相较于 CAR-T 细胞疗法和 PD-1/PD-L1 抗体,TIL 细胞疗法具有肿瘤趋向和浸润能力强、多靶点、副作用小等优势。

近年来,随着对 TIL 细胞疗法认识的深入,科学界已经开始尝试提高 TIL 细胞疗法的有效性和可操作性的新方法,比如通过基因工程改造 TIL 细胞使其具有更强的抗肿瘤能力和更长的存活时间,以及通过联合 CAR-T、PD-1/PD-L1抗体等其他免疫疗法来增强 TIL 的治疗效果。目前,TIL 细胞疗法已在多种实体瘤(如恶性黑色素瘤、肺癌、乳腺癌等)中表现出较好的试验数据。

作为一家肿瘤细胞治疗产品开发公司,劲风生物通过源头技术创新提高了 TIL 疗法的有效性。近期,生辉采访到了劲风生物创始人兼 CEO于福利博士,他围绕公司的产品管线、业务布局和发展规划,以及 TIL 细胞疗法产业现状和前景等多个方面进行了分享与解读。

▲图|劲风生物创始人兼 CEO 于福利博士(来源:受访者)

于福利在南开大学获得生物化学和分子生物学学士学位后,进入美国贝勒医学院攻读分子遗传学博士学位,博士期间他师从美国科学院院士、基因组学泰斗 Richard Gibbs 教授;随后,他进入哈佛医学院师从群体遗传学家、古人类遗传学家 David Reich 教授进行博士后研究工作。

2008 年,他回到贝勒医学院并在人类基因组测序中心任职,专注于大规模人类基因组学研究,参与或领导了多项国际重大人类基因组项目,包括人类基因组单体型项目、人类千人基因组项目、人类心血管疾病项目等。截至目前,于福利已在Nature、Science、Genome Research等世界顶级期刊发表论文 70 余篇,被引超 4.5 万次。

2015年,他受聘贝瑞基因并全职担任首席生物信息官,专注于整体生物信息分析、产品研发,以及 AI 和云计算技术在基因组学中的应用,在那里他领导了多款基因测序产品的开发以及多个子公司的孵化。“这段国内初创公司经历让我能够比较深入到产业中,直接深入到临床医学的第一线,和很多医学 KOL 成为事业的伙伴,也正是这个契机为我后来的创业打下了基础。”于福利博士表示。

2020 年,他创立了劲风生物,开发 TIL 细胞疗法治疗实体肿瘤。“TIL 本身是一种混合物,而基于生物信息学(包括 AI 算法等)能够从中快速找到发挥关键杀伤作用的 TIL 细胞,这是我创立劲风生物的一个切入点。”于福利博士说道。

基于生物信息学数据优化 TIL 疗法

通常情况下,TIL 疗法临床试验需要患者在肿瘤组织切除前不可进行化疗以避免对离体 TIL 扩增的干扰,针对现阶段 TIL 疗法在筛选患者存在的痛点,劲风生物团队拓展了 TIL 疗法在临床的应用范围。目前,这项研究成果已经以“Successful ex vivo expansion of tumor infiltrating lymphocytes with systemic chemotherapy prior to surgical resection”为题发表Cancer Immunology, Immunotherapy在上。

(来源:Cancer Immunology, Immunotherapy)

在这项研究中,他们通过从未经治疗和接受化疗的患者中获取肿瘤组织,分析了来自不同患者群体的 TIL 并对患者肿瘤组织进行了 TIL 细胞分离与体外扩增。试验结果显示,TIL 细胞制备总体成功率达 90.9%,表明成功且高效地从化疗患者的肿瘤组织中制备出了功能性 TIL 细胞;而相较于非化疗患者,化疗患者的 TIL 细胞并没有表型或功能差异,这意味着或许不应该把有化疗史的患者排除在 TIL 治疗试验之外,为患者拓宽了治疗选择。

现阶段,劲风生物专注推进肿瘤细胞治疗产品研发及临床应用。“我们利用 AI 技术和生物信息学技术挖掘肿瘤多组学数据,将 AI、多组学、生物信息学融入细胞疗法开发,通过智能优化细胞治疗策略来提高肿瘤治疗有效性,加速推进 TIL 疗法应用于临床。”于福利介绍道。

目前,劲风生物已经构建起 TIL 治疗平台,涵盖新抗原驱动 TIL、单细胞多组学 TIL 扫描,以及端到端 CMC 等多种细胞治疗产品的开发。

面对公司在发展过程中需要克服的挑战,于福利表示,“TIL 细胞疗法的开发需要临床医生和研发团队的密切合作,但国内对于 TIL 细胞疗法的认知程度并不高,市场教育处于早期阶段。”他说道,“作为应对,我们将通过与临床医生开展广泛且深入的合作,联手把 TIL 细胞疗法尽快推进临床应用。”

▲图|劲风生物技术平台(来源:公司官网)

技术层面,在他看来,“劲风生物借助生物信息学技术来优化 TIL 细胞和提高 TIL 疗法有效性,这在中国和美国都属于独创。”于福利介绍道,“具体而言,我们借助生物信息学,通过 AI 算法筛选出 TIL 中的关键主成分,即通过 AI 算法从中寻找最为有效的 TIL 细胞,把主成分更为精准地筛选出来,这是我们的一大核心优势。”

据介绍,劲风生物现阶段已经完成了 AI 算法的开发并且已经提交了多项 AI 算法专利。“当然,我们现阶段也有一些需要完善的地方,围绕 TIL 细胞疗法在技术研发角度、产品开发角度等多个方面都有很大的提升空间。”

“此外,劲风生物采用“中美双运营”的模式开展研究工作,我们在中国天津和美国休斯敦都具备分工精细的内部业务运作体系,这也是我们的一个优势。”于福利说道。

谈及未来中长期的发展规划,“国内每年约有 500 万例新发实体肿瘤患者,我们希望尽快将 TIL 细胞疗法推进到临床,以造福更多国内患者。”于福利表示。

“将形成技术路径多样化的竞争格局”

TIL 细胞疗法的历史可以追溯到上世纪 50 年代,当时随着移植物抗肿瘤反应的发现以及 T 细胞在此过程中所起的关键作用,科学界开始探索 T 细胞在抗肿瘤免疫中的作用。

1982 年,美国国家癌症研究所的 Steven Rosenberg 博士等人首次从多种小鼠肿瘤模型中分离出 TIL 并证明了其联合 IL-2 可以治愈 100% 的 MC38 肝转移结肠腺癌小鼠和 50% 的肺转移小鼠,为后续的临床应用打下了基础;1988 年,TIL 细胞治疗开始尝试在临床上的应用,试验发现其在转移性黑色素瘤中达到了 60% 的客观有效率(ORR)。

▲图|劲风生物位于天津的研发团队和实验室(来源:公司官网)

如今,TIL 疗法已被证明针对许多患有各种类型的实体肿瘤有效。“近十年来,TIL 细胞疗法开始拓展到更多肿瘤类型,比如结直肠癌,胃癌等等,其推动因素是由于第二代 TIL 细胞疗法实现了主成分(高杀伤性 TIL 细胞)更好的扩增,真正找到具有杀伤性的 TIL 细胞亚群,而这也是劲风生物一直聚焦的地方。”于福利介绍道,“目前,适应症方面,TIL 细胞疗法针对黑色素瘤适应症的发展速度是最快的,这主要是由于黑色素瘤的免疫原性比较高,因此 TIL 治疗效果较好。”他指出。

纵观全球,国内实体肿瘤发病率依然较高,临床方面存在较大缺口。“TIL 细胞疗法的国内市场规模,就整个行业而言,国内每年约有 500 万新增实体肿瘤患者,TIL 细胞疗法有望实现每年治疗 5 万例患者,相当于是 1%,这个比例在短期内还是值得期待的。”于福利表示。

TIL 细胞疗法产业层面,国内外很多公司都在布局和探索第二代 TIL 细胞疗法,在于福利看来,“不论是中国还是美国, TIL 细胞疗法这个赛道的竞争将日趋激烈,而围绕 TIL 细胞疗法的开发,每家公司都有自己的技术路径,即挖掘自己认为有效的 TIL 主成分,技术路径的多样化是今后 TIL 细胞疗法产业的竞争格局。”

融资方面,劲风生物目前已经完成了千万美元级的 A 轮和 Pre-A 轮融资,投资者包括道彤投资、弘励创投、翰颐资本等。“我们的技术路径相当于是把 AI 融入到了细胞疗法开发之中,即 AI+TIL, 优化治疗的有效性。”于福利表示,“资金的注入让我们能够更为快速地推进肿瘤细胞治疗产品的研发和临床应用,生物技术公司的前期投入较大并且我们是中美双运营的模式,所以劲风生物的融资将处于持续开放的状态。”他说道。

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