2003年7月13日在其家乡被美军抓获。萨达姆被捕入狱后，与其他大约100名囚犯被关押在巴格达附近的克劳卜营地监狱之内。据报道，这一“阴冷的”监狱由三排一层的牢房组成，监狱四周环绕着双层铁丝网，上空还不时有美军“阿帕奇”和“奥基瓦”直升机巡逻掠过，警惕任何劫狱企图。
克劳卜营地监狱内，每个（单人）牢房只有2平方米的空间，而且没有窗户，只是在牢房钢门上离地约1米的地方，有一个通风盖板。在每一排牢房的走廊尽头，有一个独立的淋浴房。美军监狱管理部门办公室与医务室和牢房相分离，至于监狱内的独立金属小屋，就是审讯囚犯的房间。
萨达姆入狱以后的一组生活照。其中一张照片上，萨达姆光着膀子，正在叠一条褐色裤子，全身只穿了一条白色短裤。另一张照片上，身穿白色阿拉伯长袍的萨达姆正坐在塑料椅子上，用一个小盆洗一件衣物。在另外一张照片上，这位前伊拉克领导人头戴一顶黑色帽子，正躺在一个白色枕头上睡觉。还有一张照片是穿着长袍和凉鞋的萨达姆正在牢房里踱步。
据报道，有些时间，囚犯们将这块通风盖板顶开，就能观望到监狱放风院子里面的情形，呼吸一下新鲜空气。看守们有时为了惩罚犯人，会将通风盖板锁上。监狱中的犯人最初每天只有半小时的轮流放风时间，红十字会提出抗议之后，放风时间已经增加到了1小时。很多囚犯也得到了更为宽敞的关押环境。其中有不少人都在单人牢房中度过了至少18个月的时间。
不过对于萨达姆，以及其他美军眼中的“高价值囚犯”——约占监狱犯人数量的一半——则仍然被关押在单人牢房之内。他们中的很多人两年来除了审讯人员、看守和律师偶尔来访之外，没有见到过任何人。
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