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中国农业大学/福建农林大学合作团队揭示苹果果实成熟的表观遗传调控机制

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组蛋白乙酰化的动态修饰参与调控植物生长发育,然而,组蛋白去乙酰化修饰如何调控苹果果实发育成熟方面鲜有报道。近日,中国农业大学与福建农林大学的合作研究团队在Plant Physiology在线发表了题为“Ethylene response factor MdERF4 and histone deacetylase MdHDA19 suppress apple fruit ripening through histone deacetylation of ripening related genes”的研究论文。该研究发现,MdERF4-MdTPL4能够招募组蛋白去乙酰化酶MdHDA19去乙酰化修饰果实成熟相关基因,如MdACS3a,MdACO3-like等,进而调控苹果果实成熟进程。该研究为呼吸跃变型果实的表观遗传修饰调控研究提供了参考。

前期研究表明,乙烯响应因子MdERF4参与形成的MdERF4-MdTPL4转录抑制复合体在苹果果实发育成熟方面具有重要的调控作用(Hu et al., 2020),但这种转录抑制复合体是否与染色质修饰偶联尚不清楚。该研究通过BiFC和Pull-down分析发现,组蛋白去乙酰化酶MdHDA19能够被招募到MdERF4-MdTPL4复合物中,进一步通过对苹果果实H3K9ac ChIP-seq,ChIP-qPCR和VIGS分析发现H3K9乙酰化水平直接与MdACS3a等果实成熟相关基因的表达水平有关,从而影响果实乙烯的生物合成及成熟进程。同时,研究发现,早熟品种Gala果实中,在MdACS3a上有一个特异的早熟H3K9ac乙酰化修饰峰,是由于早熟品种Gala的MdERF4 EAR基序C-G突变削弱了MdERF4-MdTPL4-MdHDA19复合物对MdACS3a的抑制,从而使MdACS3a表达特异性上调。综上所述,MdERF4-MdTPL4-MdHDA19阻遏复合物通过表观遗传修饰参与调控苹果果实成熟进程。

中国农业大学吴婷副教授,福建农林大学吕培涛教授为该论文的通讯作者。博士生胡亚楠韩振云为论文共同第一作者。该研究得到了国家重点研发项目、国家自然科学基金、北京科技创新服务能力建设-高精尖学科、111引智平台和福建省高原学科建设项目支持。

参考文献:

Hu Y, Han Z, Sun Y, Wang S, Wang T, Wang Y, Xu K, Zhang X, Xu X, Han Z, Wu T (2020) ERF4 affects fruit firmness through TPL4 by reducing ethylene production. Plant J. 103: 937-950

论文链接:

https://doi.org/10.1093/plphys/kiac016

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