清承明制，在取代明朝后，清朝在很多政治制度上采取的是明朝以来的制度。比如总督和巡抚，明朝和清朝都有，不过两者却有着本质的区别。这个区别就是：在明王朝总督与巡抚隶属于京官，也就是中央官员，而在清王朝，这两个官职可是名正言顺的地方大员。
朱元璋当年建立大明后，就一直致力于加强中央集权，为此他把宰相都给废了，把所有权力集中在了自己手里。
明朝在地方延续了自元朝的行省制度，只不过名字换成了承宣布政使司，其行政长官为承宣布政使，明代在全国设置十五个省级单位。不过即使如此，朱元璋还是认为一个地方长官权力太大了，所以将行省长官的权力一分为三，将行省之中的政务、司法、军事划分为三个部门。
不过这样做问题又来了，权力是分散了，可是也带来了很多不便。所以朝廷从宣德年间开始派部（六部）、院（都察院）大臣以总督和巡抚的名义督抚地方行政，后来更是成为了各省常制，他们的权力很大，因为是中央委派的，所以有点钦差大臣的味道，凌驾于地方长官之上。这其中，巡抚主理民政，总督署理军务。
清朝建立后，沿用明制，只不过是废除了南京留都的地位，到了康熙时期改名为省。不过清朝在内地和边疆采取了不同的制度，在明朝原本是临时派遣的巡抚，成为了一省的长官。而总督总管一省或二三省。督抚制度一起组成了管理地方军政的重要官员组合，清代的总督权力相较巡抚更大。
在清代，督抚也是在不断地发展的。尤其是权力，到了晚清总督的权力过大，具备了征召人马组建军队的权力，不过这样是由特殊的环境所决定的。
明清两朝督抚制度有所区别这是很正常的事，毕竟两朝的实际情况不同，简单的说督抚在明朝时是中央官员，清朝时是地方官员。
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