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1.流行病学调查：重点调查疾病的发生情况，如发病季节、死亡率、主要临床表现、既往病史等；饲养管理方法，如日粮组成、饲料种类和质量、饲料添加剂种类和数量、饲养方法和程序等。环境条件，如土壤类型、水源数据、环境污染等。
2.临床检查：收集的症状要参照流行病学资料进行全面系统的分析。根据临床表现，有时可以大致推断出营养代谢性疾病的可能病因，如不明原因的家禽跛行和骨骼异常，可能是钙磷代谢紊乱。
3.饲料分析：对饲料中营养成分的分析提供了各营养成分水平和比例的信息，可作为营养代谢性疾病尤其是营养缺乏性疾病病因诊断的直接证据。
4.病理检查：某些营养代谢性疾病可呈现特征性病变，如关节痛风时关节腔内尿酸盐结晶沉积；维生素A缺乏时，家禽上消化道和呼吸道粘膜角质化。
5.实验室检查：主要测定患病个体和患病禽群血液、羽毛、组织器官中的某些营养素、相关酶和代谢物的含量，作为早期诊断和确诊的依据。
6.治疗性诊断：为了验证基于流行病学和临床检查结果的初步诊断或可疑诊断，可以进行治疗性诊断，即补充一种或多种可能缺乏的营养素，观察其对疾病的治疗和预防作用。治疗性诊断可作为营养代谢性疾病临床诊断的主要手段和依据。
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