我首先要告诉你的是国企同样没有编制，现在国企的编制都是企业内部自己的编制，与事业单位哪种需要编制部门下达的编制完全是两码事。
对于在没有编制的事业单位工作，说穿了就是一个临时工资，虽然按照事业单位人事管理条例的规定，对于事业单位工作人员采取公开招聘的和竞聘上岗两种方式。公开招聘的职位一般都是要有编制的，编制是由政府的编制部门来控制的，只有编制内的人员，才属于事业单位正式的工作人员，才能按照机关事业单位工作人员的规定为其缴纳五险一金和职业年金。你作为硕士生，如果通过人才引进的方式进去，由于受到编制的影响，进不了编制内，也还是属于临时工，虽然工资待遇可能不会受影响，但是和单位签订的是劳动合同，而不是聘用合同，缴纳的是企业职工养老保险，而且不能缴纳职业年金，这在以后退休的待遇影响是比较大的。
如果进当地市属国企，虽然国有企业没有国家规定的编制，国资委是按照工资总额来进行管理，国有企业进人方式都是采用市场化的方式。当然每个企业为了控制工资总额，也会根据自己的需要，按照三定的原则，制定的自己工作岗位的编制，这个编制和机关事业单位的编制具有本质上的差别。
市属国有企业仍然需要和企业签订劳动合同，按照相应的工作岗位确定工资待遇，但是国有企业的工资待遇都是在工资总额范围内，由企业自主决定的，不像事业单位那样需要财政拨款，国有企业虽然也是劳动合同制，但总体上比在事业单位作编制外职工更好，更稳定，上升的空间也更大，工作出色的人员，在本企业提拔到一定的岗位工作，今后还有可能通过跳动的方式进入机关担任主任科员以上级别的干部，发展前景总体上比事业单位编制外人员更好。而且国有企业很多单位都办理了企业年金，今后的退休待遇比事业单位编制外人员更好。
综上所述，对于刚毕业的硕士生，可能对于职场的很多方面还不是很熟悉，所以不好选择工作，特别是在两份工作待遇差不多之间不好选择这是正常的。但是选择工作除了薪酬待遇以外，还要考虑社会地位，发展前景等因素，综合各方面的情况来分析，我觉得你还是进入市属国企工作更好。
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