在苏联 74 年的历史中，在解决民族问题方面取得了很大的成就，但其民族工作中也有着严重失误和重大过失。亚美尼亚和阿塞拜疆的民族矛盾，就是其中之一。
1988 年 2 月20 日,纳卡州人民代表苏维埃非常会议通过决议请求将本州划入亚美尼亚,但是遭到阿塞拜疆的拒绝。2 月 28 日,亚美尼亚人示威要求阿塞拜疆放弃纳卡地区,引起了双方的暴乱,造成 26 名亚美尼亚人以及 6 名阿塞拜疆人死亡。此后在亚美尼亚进行了一系列的示威游行与罢工,苏共中央声明纳卡地区进入紧急状态。
虽然亚美尼亚和阿塞拜疆两国领导人表面上都支持苏共中央的决定,但是两国人民的激动情绪并没有平息下来。
1990年1月13日的晚上，在苏联加盟共和国阿塞拜疆首府巴库市的中心广场上，正举行一场有15万人参加的集会。会上，突然有人跳上主席台，向人们宣布了一个消息：就在前一天，亚美尼亚一伙极端分子乘一架直升机，向阿塞拜疆的纳戈尔诺地区的村庄发动了袭击，并且打死多名阿塞拜疆人。
正在集会的阿塞拜疆人不等集会结束，便纷纷冲上街头。他们带着棍棒和燃烧瓶，来到巴库市的亚美尼亚人聚集区，冲进亚美尼亚人的家中，将他们家里的家具、衣服扔到大街上，一些愤怒的阿塞拜疆人用手里的大棒痛打亚美尼亚人，用燃烧瓶烧毁他们的房子。当晚的骚乱，造成至少五十名亚美尼亚人死亡，数千亚美尼亚人坐船逃到克拉斯诺沃茨克。
次日，30多万亚美尼亚人在首府埃里温举行集会，要求亚美尼亚政府保护居住 在阿塞拜疆的亚美尼亚人。人们群情激昂的围住正在埃里温视察工作的苏共中 央政治局委员斯柳尼科夫，要求他同意亚美尼亚成立“特别自卫委员会”,并在亚美尼亚人中实行总动员。
1月14号，在阿塞拜疆和亚美尼亚的边境上，双方发生了激烈的交火。虽然交火者并不是代表政府的正规军，而是自愿参加的民兵及武装人员，但是，两国的军方都向这些武装人员提供了装甲车、机枪和火箭炮。在一天中，双方都有五六十人被打死，双方的情绪更加激昂。
起初，亚美尼亚政府还能听从斯柳尼科夫的命令，要求人们冷静、克制；但埃里温的居民已失去了理智，他们冲进警察局和兵营，抢夺警察和士兵的武器，从全国各地向紧邻本国的阿塞拜疆的纳戈尔诺地区冲去，发誓要给死去的同胞报仇。而阿塞拜疆的武装人员，也自发的组成了志愿队，拿着自动步枪和机关枪，封锁了通往亚美尼亚的所有道路。
1月16日，苏联派16万陆军及警察部队赴阿塞拜疆。这些部队包括了苏联内务部的特种部队，战斗力应该是特别强悍的。但是，精锐的内务部“捷尔任斯克师”却在进入阿塞拜疆第二大城市基洛瓦巴德后遭到伏击，阿塞拜疆新成立的“人民阵线国防委员会” 封锁了所有进城的道路，并在机场到城市的途中打死了七名捷尔任斯克师的士兵。
1月17日，苏联最高苏维埃主席团宣布巴库市进入紧急状态，大批苏联增援部队在坦克的支援下，冲进了阿塞拜疆的首府。阿塞拜疆新 “人民阵线国防委员会”随即宣布这一天是阿塞拜疆的“国耻日”，并要求戈尔巴乔夫立即辞职，苏联军队从阿塞拜疆“滚出去”。
事态的发展，出乎了许多人的意料。苏中中央立即召开紧急会议，解除了阿塞拜疆中央第一书记韦济罗夫的职务，苏军紧接着用大炮、坦克对盘踞在巴库的“人民阵线国防委员会”成员进行了打击，粉碎了他们企图夺取阿塞拜疆领导权的企图。
到了1月26日，阿塞拜疆的极端分子中，有80人被苏军打死，约500人被捕；而苏军也付出了20名军人和5名警察牺牲的代价，另有498 人受伤。
发生在苏联时期阿塞拜疆的这起阿、亚冲突，从1月18日爆发，至 1 月底平息，造成的直接经济损失约 2.5 亿卢布，骚乱使20万亚美尼亚人和数万阿塞拜疆人沦为难民。
苏联解体后,亚美尼亚和阿塞拜疆两国为了争夺纳卡地区，直接爆发了战争。尽管双方于 1994 年达成停火协议,但该地区的小规模冲突仍旧不断，直至此次来了个总爆发。
纳卡地区是苏联民族矛盾的一个缩影, 该地区的民族冲突反映出了苏联在协调各加盟共和国和各民族之间关系上的严重失误。纳卡冲突不但引发了阿、亚两国的流血事件，也让波罗的海沿岸各国同苏联的关系也变得紧张起来，还引起了国内各加盟共和国的连锁反应。这也为苏联最后的解体，添加了一剂催化剂。
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