尽管鸡在世界各地的人类社会中发挥了重要作用，但其驯化的地理和时间起源仍存在争议。
2020年6月25日，中国科学院昆明动物研究所，中国农科院北京畜牧兽医研究所等多单位合作，张亚平，吴东东及韩建林共同通讯在Cell Research 在线发表题为“863 genomes reveal the origin and domestication of chicken”的研究论文，该研究分析了全球范围内的鸡样本以及所有四种野生丛林禽和红色丛林禽（RJF）的五个亚种中的每一个的代表，并分析了863个基因组。
该研究表明家禽最初起源于红色丛林禽（RJF）鸡种西班牙鸡，其主要分布在中国西南部，泰国北部和缅甸。驯化后，鸡被转移到东南亚和南亚，在那里与红色丛林禽（RJF）亚种和其他家禽物种在当地杂交。此外，该研究分析表明，家养鸡会经历遗传适应，这是它们独特的行为，形态和生殖特征的基础。该研究研究提供了有关家禽进化史的新颖见解，并为促进正在进行的对世界上数量最多的家畜的遗传和功能研究提供了宝贵的资源。
最后，Science 发表了题为“The chicken first crossed the road in Southeast Asia, ‘landmark’ gene study finds”的点评文章，系统盘点了该研究成果。
它是世界上最常见的农场动物，也是人类最大的动物蛋白单一来源。大约有240亿只，它比其他所有鸟类都高一个数量级。然而，两个世纪以来，生物学家一直在努力解释鸡是如何变成鸡的。
现在，对鸟类完整基因组的首次广泛研究得出的结论是，东南亚北部或中国南部的人们在公元前7500年左右的某个时候驯养了鸡。然后，移民和商人将鸡带到整个亚洲，再到除南极洲以外的每个大陆。
中国科学院昆明动物研究所的研究人员在Cell Research 上的一篇论文中写道：“我们的结果与先前声称鸡是在中国北方和印度河谷驯化的说法相矛盾。”他们还发现，现代鸡的主要祖先是红色丛林禽类的一个亚种，名称为“鸡”。
伦敦大学学院的考古学家Dorian Fuller说：“这显然是一项具有里程碑意义的研究。”他补充说，研究结果可以揭示农业和早期贸易网络的出现，以及鸟类的哪些特征使其对人们如此具有吸引力。
Charles Darwin辩称，鸡是从红色丛林禽类衍生而来的，因为它们彼此相似，可以繁殖出可育的后代。他推测驯化发生在印度。根据推测的鸡骨头，考古学家以不同的方式声称，人们在9000年前在中国北方和4000年前在巴基斯坦驯养了鸡。
DNA研究有望解决这个问题，但是研究人员从鸟类野生亲戚那里得到的样本很少。因此，家畜和牧草遗传资源联合实验室的遗传学家韩建林开始了一项为期20年的项目，对亚洲和非洲120多个村庄附近的土著村庄鸡和野生丛林禽进行采样。
张亚平等团队对863种鸟的完整基因组进行了测序，并进行了比较。结果表明，现代鸡主要来自现在缅甸，老挝，泰国和中国南方的驯养和野生品种。诺丁汉大学的合著者，遗传学家Olivier Hanotte说：“这个地区是驯化的中心。”这些结果证实了日本鸟类学家秋田亲王在1994年根据线粒体DNA数据提出的假设。
史密森学会的考古学家Melinda Zeder称新论文“令人着迷”，并表示“驯化和传播的故事比我们想象的要复杂。”她敦促结合遗传和考古数据充实故事。考古学家现在正在收集鸡骨头，这表明中国南方和东南亚的农民大约在3500年前首次驯化了鸡，这一发现加强了遗传工作。
与此同时，韩建林研究组正在基于来自亚洲，欧洲和非洲的1500多个现代鸡基因组创建庞大的数据集。研究人员计划分析鸡在欧洲和非洲的扩散情况，以及诸如抵抗疾病或生产更多卵的能力等性状背后的遗传变异。“这项研究为鸡基因组学打开了一个全新的一页，” 韩建林说。
参考消息：
https://www.nature.com/articles/s41422-020-0349-y
https://www.sciencemag.org/news/2020/06/chicken-first-crossed-road-southeast-asia-landmark-gene-study-finds
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