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背靠背!施一公团队连发两项研究成果

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2020年5月6日,施一公团队(清华大学为第一单位)在Cell Research在线发表题为”Structure of the cytoplasmic ring of the Xenopus laevis nuclear pore complex by cryo-electron microscopy single particle analysis“的研究论文,该研究介绍了非洲爪蟾NPC CR的单粒子冷冻电子显微镜(cryo-EM)结构,平均分辨率为5.5-7.9–,局部分辨率达到4.5。

改进的分辨率允许在大多数CR组件中标识和放置辅助结构元素。每个CR亚基中的两个Y复合物彼此相互作用,并与侧翼亚基的Y复合物缔合,形成圆形支架。在每个CR亚基中,含有Nup358的区域包裹着两个Y复合物的茎,可能稳定了支架。 Nup205连接两个Y配合物的短臂,并与相邻Y配合物的茎相连。包含Nup214的区域使用延伸的卷曲螺旋连接两个Y络合物的Nup85,并突出到NPC的轴向孔中。这些以前没有特征的结构特征揭示了对NPC组装的了解。

另外,2020年5月4日,施一公团队(西湖大学为第一单位)在Cell Research在线发表题为”Molecular architecture of the luminal ring of the Xenopus laevis nuclear pore complex“的研究论文,该研究报告了非洲爪蟾卵母细胞的NPC的腔环(LR)的冷冻电子断层扫描(cryo-ET)结构。LR的观察到的关键结构特征可通过单粒子低温电子显微镜(cryo-EM)分析独立确认。该研究揭示了LR以前未知的特征,并可能解释了NPC的弹性。

核孔复合物(NPC)是真核细胞在细胞质和细胞核之间双向货物运输的唯一途径。核孔复合物(NPC)在高等真核生物中大约为110-125 MDa的分子质量,详细的结构信息是对NPC进行机械理解的先决条件功能。为了实现这一目标,阐明NPC的三维结构的探索始于25年前。X射线晶体学已成功应用于NPC的各个成分和亚复合物,从而形成了30多个晶体胞质环(CR)及其相关的胞质细丝(CF)中的结构域和亚复合物。

NPC胞质环(CR)亚基的冷冻EM结构(图源自Cell Research )

然而,对于完整的NPC,唯一可行的结构研究方法是电子显微镜(EM),该方法可以重建是1993年使用随机规范倾斜方法进行的低分辨率成像,近年来使用冷冻电子断层扫描(cryo-ET)进行了约10次中等分辨率的重建。特别是在人类,非洲爪蟾,酿酒酵母等揭示了NPC的一般结构特征。 cryo-ET重建允许对接现在的X射线结构。

NPC具有圆柱形外观,位于内核膜和外核膜之间的融合点。从细胞质侧沿着圆柱轴,NPC由胞质细丝(CF),胞质环(CR),内环(IR),核环(NR)和核篮(NB)组成。在核包膜(NE)的内腔中,有一个称为腔环(LR)的圆形支架。

Nup214复合体连接外部和内部Y复合体(图源自Cell Research )

NPC显示大约八倍的对称性。 NPC的异常大尺寸及其构象可塑性,对于以更高的分辨率,尤其是cryo-ET进行结构确定提出了挑战。迄今为止,通过cryo-ET的人类NPC的CR亚基的局部分辨率已达到15。在此分辨率下,蛋白质成分仅在结构域水平和X射线结构可以牢固地停靠在重建结构中以生成复合坐标。在这项研究中,研究人员通过单粒子分析(SPA)报告了非洲爪蟾NPC的CR的冷冻-EM结构。该重建结果显示平均分辨率为5.5–7.9,这显示了单个α螺旋的管状密度,并且允许放置CR的大多数组件的辅助结构元素。

https://www.nature.com/articles/s41422-020-0319-4

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