其实，本硕连读从出来的第一天起就争议声不断，很多人认为本科生的毕业要求仅仅是课程学习合格，而在研究生的毕业要求中却明确规定了要有一定的创造性。本科生与研究生这两种教育分别属于“通才教育”和“专才教育”。不同的培养目标，需要选拔不同类型的人才，并适用于不同的选拔标准。由此，研究生的选拔不应以课程考试型的高考来定夺。其实，任何事物都有两面性，绝对的优和绝对的劣，都是不存在的。正如本硕连读，那时见仁见智的看法。
本硕连读的招生方式
招生院校多是具有自主设置本科专业的高校。各个高校还有不同的操作办法，一部分学校在高招录取时就亮出了“本硕连读”和“本硕连读基地班”的牌子，规定某些专业学生读完本科可以一步到位再读研究生，不需要参加竞争激烈的研究生考试；还有一些高校是在每年新生入学后，对个别专业的新生进行严格的入学考试，选拔出优秀的学生进入本硕连读班；此外，有的高校虽没有本硕连读班，但可以保送部分优秀本科毕业生直接读研究生。
考生要注意当地的招生专业目录，设本硕连读专业的高校，需要教育部批准，一般来说，重点本科院校和有特色的普通本科院校设有本硕连读专业，有些称作某专业基地班，实际上就是本硕连读班。
本硕连读招生人数较多的专业
大部分医学类院校都招本硕连读专业。除此之外，一些院校的冷门专业为了吸引考生，也是招收本硕连读专业的大户。
例如农林地油矿等冷门专业为了吸引高分考生，尽力多设本硕连读形式，如重庆大学的采矿工程、工程力学、冶金工程等专业，考生的高考成绩只要高于重庆大学在当地的调档线20分以上便可优先入围(其中采矿工程专业录取批次在一般本科批)。
中国地质大学一共有四个专业本硕连读：资源勘察工程基地班、地质工程实验班、地质与地球物理实验班、水资源与环境实验班。另外，在农林类重点大学里，凡是与农林有关的专业，几乎都设有本硕连读形式。
本硕博连读专业
除了本硕连读专业，有的医学高校还招收本硕博连读专业，即从大学本科到研究生连续读8年，最终获得医学博士学位。目前，全国共有10所高校试办八年制医学教育，这10所高校分别是：北京大学、清华大学、北京协和医学院、南方医科大学(原第一军医大学)、复旦大学、四川大学、中山大学、华中科技大学、中南大学和上海交通大学。
北京协和医学院八年的临床医学专业学习分为三个阶段：第一个阶段就是我们讲的叫医学预科教育，就是在综合大学学习两年半的时间：然后转入到基础医学的学习基础医学，这就在协和医科大学的校本部，在学校的基础学院，那么有一年半的时间主要是学像解剖、生理、组织学、胚胎等课程。然后进入第三个阶段，就是临床医学阶段，临床医学阶段大致是有三年多一点点的时间。最后有大概八个月左右的时间要做一个毕业论文，毕业论文要通过答辩委员会的答辩通过，英语必须通过六级考试，那么这种就是医学博士学位。如果是成绩合格，但是没有达到优秀水平，那么他会获得医学硕士学位。
如果以上这个专业读到本科，或者是硕士后，不想读了，只能是退学，没有相应的证书，因为这中间没有出口，也不能转专业。
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