沙俄在得到清朝远东地区150万平方公里的土地还不满足，又把目光放在了中国的西域，新疆。新疆旁边的浩罕汗国在英俄的支持下，打着圣战的旗号进犯南疆，曾一度占领了大半个新疆。紧接着沙俄从北方占领伊犁，对整个新疆虎视眈眈。
而清朝内部却还在讨论要不要收复新疆，李鸿章认为，新疆乃是千里不毛之地，不值得动兵收回。但左宗棠认为，新疆是中国的门户，丢了新疆西北门户洞开，蒙古不保，京师也会直接受到威胁，中原将无险可守。到时候中国会面临海陆两方面的威胁，大清朝到时候会非常危险。
慈禧一听觉得形势确实非常严重，下定决心出兵新疆，不惜砸锅卖铁也要收回新疆。慈禧从各地抽调给左宗棠五百万两白银当作军饷，允许左宗棠拿清朝的铁路权和关税权做抵押，向列强借款。
最后终于筹到了1000万两军饷，左宗棠于1876年6月率领七万大军直扑北疆， 1877年又率兵横扫南疆，带领大军直逼伊犁，沙俄看到清朝这是是下定决心要收复新疆了，为了避免自己的损失，就又回到了谈判桌上。
左宗棠本有能力一口气攻克伊犁，收复新疆的所有地区，但是清朝跪久了，很难站起来。1881年，清朝和沙俄签订了《中俄伊犁条约》，沙俄同意从伊犁撤兵，把伊犁还给清朝，但是清朝得支付给沙俄500万两白银的军费，还得准许沙俄的商人在新疆经商，并且不给清朝交税。1882年，伊犁正式回到清朝的疆土中，历时7年的西域之乱终结，左宗棠上书建议在新疆地区建省，并说这是“他族逼处，故土新归”。随后慈禧就把西域等地命名为新疆，一直沿用至今。
新疆现在物产丰富，而且拥有各种稀有金属，比说石墨，新疆的石墨储量非常丰富，储量高达7000万吨，确实是一比不小的宝藏。
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