大明洪武五年，朱元璋大发雷霆，立刻召见文臣，宣布即日起“罢免孟子配享孔庙”，将孟子的牌位撤出孔庙，取消他在孔庙里和孔子一起被祭祀的资格。孔孟之道是中华立邦之本，此命一下，举朝哗然。这一举动就如同基督教国家里要把耶稣驱逐出教堂一样惊世骇俗。
《明史·钱唐传》记载：“帝尝览《孟子》，至''草芥''''寇仇''语，谓：''非臣子所宜言''，议罢其配享。诏：''有谏者以大不敬论。''唐抗疏入谏曰：''臣为孟轲死，死有余荣。''时廷臣无不为唐危。帝鉴其诚恳，不之罪。孟子配享亦旋复。然卒命儒臣修《孟子节文》云。”
后来在大臣们的死谏下，朱元璋又恢复了孟子配享孔庙的资格。但是他却命令臣下“删孟”，将自己看着不顺眼的“反动文字”尽皆删去。共砍掉孟子原文85条，只剩下100多条，编了一本《孟子节文》，又专门规定，科举考试不得以被删的条文命题。
那么朱元璋究竟为什么要把孟子赶出孔庙？并且要删除孟子原文呢？
孟子：“民为贵，社稷次之，君为轻。”也就是说，与老百姓和国家相比，国君最不重要。
君之视臣如手足，则臣视君如腹心；君之视臣如犬马，则臣视君如国人；君之视臣如土芥，则臣视君如寇仇。
孟子并不认为皇帝绝对正确论，一再强调在君臣体系中皇帝的主导作用，宣扬皇帝不合格就该换的造反有理论。而朱元璋在这个问题上一向自负，认为皇帝木有错，有错的必然是臣下，他对大臣们犯错的态度是零容忍，对官员更是十分不信任。对君权更是只有强化，甚至包括采取了废除宰相这样的别致做法。朱元璋严刑、集权的政治理念和孟子民本、仁政的思想有悖。
曾有传说朱元璋对太子朱标表示，他对臣下所做的一切是在帮继承人去掉刺头帮助他更好的掌控江山，而朱标的回答是“上有尧舜之君，下有尧舜之民”，这说法其实和孟子的君臣论如出一辙，显然不合朱元璋的理念，也使他大怒，虽然有人也怀疑这段故事的可信度，但能侧面反映朱元璋对孟子思想的不待见，甚至出了《孟子节文》删减圣人之言，历代对儒家经典一般都是加点解释注译，直接删减确实很少见。
孟子的君臣论朱元璋看不惯，朱元璋造反起家，当上皇帝以后最怕就是别人依葫芦画瓢学自己造反，而孟子上述言论在他看来就是为“弑君”找借口。但是对本来就是造反上台的朱棣来说，等于是给了他夺权的理论基础，那就不是小好而是大好，因此永乐复尊孟子，仅仅存在了17年的《孟子节文》也被朱棣一笔勾销。
朱元璋初登皇位，内心有点没底：中国人向来重视门第，讲究出身，自古以来，岂有乞丐而为天子？他认为许多人虽然畏服于他的刀剑，对于他这个人却相当瞧不起。所以，朱元璋要大力提倡“天命论”，就是“天命无常，有德者居之”。老天爷的心思很难猜，证明它的唯一证据，就是谁最终得了天下。朱元璋的“天命观”其实很简单，那就是成王败寇。
他删掉有恒产者有恒心的理论——有恒产当然有恒心，但无恒产也必须有恒心。也就是说，在朱元璋的统治之下，你纵然沦为赤贫，走投无路，也不得起造反之心。
他删掉帝王必须仁慈——对帝王不得有任何要求，什么样的帝王百姓都应该服从。
他不许批评商纣王——并不是朱元璋喜欢商纣王，而是因为他主张，即使皇帝如同商纣王一样荒淫无道，臣下也不应该批评，更不应该推翻。
对于他这样赤手空拳开天辟地的人来说，没有什么是至高无上，神圣不可侵犯的。朱元璋不再满足于做一个世俗政权里的国王，而且还要做“教主”。和儒者争夺道统的话语权，朱元璋们肯定是会成功的，不是别的而是因为他们握有权力。到了清朝的康熙，就更牛了，他径直宣告：“道统在是，治统亦在是。”传统儒家在君权之上的道统被彻底颠覆。
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