原形毕露！海南大学联合华大发布全物种鉴定方案

如今，全物种鉴定的需求正在多个领域持续攀升。种业振兴战略驱动下，农作物、畜禽及水产种质资源亟需从“保存”向“精准鉴定”跃迁；外来物种入侵风险加剧，海关口岸对截获物的快速精准鉴定需求急剧增长；肉类、水产品等加工制品的物种真实性鉴定成为食品安全与溯源的关键；非法野生动植物贸易更对生物多样性保护执法提出严峻挑战。

但传统鉴定手段已难以应对这些新需求：依靠传统形态观测与理化检测的方法，遇到降解检材、多物种混合样品，难以做到精准判别；而常规DNA鉴定技术高度依赖实验室环境，流程冗长、专业门槛高，难以在现场场景使用。市场迫切需要一套低成本、高通量、更便携、更准确的全物种鉴定整体解决方案。

8月15日，在第二届植物生物技术前沿学术会议上，华大生命科学研究院数据中心主任魏晓锋正式发布CycloneSEQ-SeqFD全物种鉴定方案。

该套方案由海南大学携手华大生命科学研究院、华大智造联合研发，集成三大核心模块：SeqFD极简建库技术、CycloneSEQ纳米孔测序平台与SpecID Hub物种智能分析平台，实现了从样本处理到出具报告的全流程自主可控。方案以低成本、高通量、便携精准的新范式，回应农业种质资源鉴定、海关检疫、食品安全溯源及生物多样性保护等领域日益增长的全物种快速鉴定需求；同时，方案将序列、样本来源、实验信息、参考数据库版本、鉴定结论及可信度等信息结构化留存，为复杂样本的持续识别和模型迭代提供可复用的数据基础。

CycloneSEQ-SeqFD全物种鉴定方案上线

三大核心模块无缝衔接

CycloneSEQ-SeqFD发布现场

CycloneSEQ-SeqFD全物种鉴定方案三大模块——SeqFD实现极简低成本建库、CycloneSEQ提供长读长实时测序、SpecID Hub完成全物种一键式智能分析，三大模块无缝衔接，从样本到报告，不仅输出鉴定结果，还持续沉淀经质控和标注的物种序列数据，提升后续对混合样本、未知来源样本和细分场景样本的鉴定能力。

01

SeqFD技术

SeqFD技术概述

SeqFD 是一种经济高效、可自动化的 PCR 建库方法。它利用跨物种通用引物，选择性地扩增特征片段，快速获得高特异性的“物种指纹”，而且标记密度可按需灵活调整。该技术适用于大群体和规模化样本，适配CycloneSEQ 纳米孔测序平台，为物种鉴定、遗传分析及生物多样性研究提供低成本高通量的解决方案。

02

CycloneSEQ纳米孔测序平台

G100-ER 是一款中通量纳米孔基因测序仪，采用双芯片独立运行架构，灵活适配不同通量需求。它的超长读长、实时测序与持久续测性能，能完整读取全长物种条形码片段，以种级分辨率轻松应对混合样本与复杂群落，为物种鉴定、生物多样性调查与环境 DNA 监测提供强力支撑。

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SpecID Hub智能鉴定平台

SpecID Hub是面向全物种鉴定场景打造的智能解析平台，内置多物种识别基座模型与自动化推理引擎，兼容主流测序平台产生的全读长数据。平台以持续更新的高质量、多模态参考数据库为基础，依托数据驱动的智能分析流水线，实现从原始测序数据、序列比对到物种组成、相对丰度及鉴定可信度等结果的端到端自动解析，在保障鉴定准确性的同时显著缩短分析周期。用户无需具备生物信息学背景，即可一键完成混合样本测序数据分析并获得标准化鉴定报告。对于经实验或专家验证的新序列，平台支持收录、标注、质控及细分领域数据库扩展，将新增数据持续回流至参考数据库和识别模型，逐步提升复杂样本、未知来源样本的识别覆盖度与准确性，并为后续模型训练和迭代提供可复用的数据支撑。

重新定义物种鉴定的

效率与可及性

CycloneSEQ-SeqFD物种鉴定全流程

极速鉴定与超高通量并行以SeqFD简化建库技术为核心，将DNA提取、建库、三代测序与数据分析串联，全流程压缩至6小时以内。单批次可处理逾千份样本，使建库通量与测序通量相匹配，破解了传统高通量测序"前端堵塞"的结构性矛盾。

跨类群广谱识别与低成本大规模监测依托SeqFD跨物种通用引物体系和多位点指纹策略，实现对动物、植物、微生物及环境DNA等样本的统一鉴定，适用于海关截获物、深加工制品、中药材等复杂对象，解决"未知来源、未知物种、未知混合成分"的鉴定难题。显著降低单样本检测成本，使物种鉴定从"少量样本送检"拓展为高频次、大规模、主动式监测。

一体化智能分析系统与系统性技术壁垒前端SeqFD快速建库、中端三代测序实时产出、后端自动化智能分析三者协同，形成"低成本测序+自动化平台+智能算法"的系统性壁垒，区别于单一设备或试剂供应商的解决方案，全流程国产化自主可控。同时，SpecID Hub的持续迭代，让每一次经过验证的鉴定结果，成为下一次更准确鉴定的依据。

120+物种真实样本验证

CycloneSEQ-SeqFD全物种鉴定方案已完成超过120种物种的测试验证，包括动物（猪、羊、鸡、蟋蟀等）、植物（玉米、水稻、油麦菜等）、微生物（大肠杆菌、志贺氏菌、鲁氏耶尔森菌等），鉴定结果准确，重复性高。

在96物种混合样本的测试中，经过分样鉴定后，各物种均获得极高精确度的鉴定结果：

• 玉米（Zea mays）相关序列占比为（87.87%），玉米及其近缘序列占比超过92%;

• 鲁氏耶尔森菌（Yersinia ruckeri）占比99.79%，鲁氏耶尔森菌及其近缘序列占比达到100%;

• 褐鳟（Salmo trutta）占比70.47%，同时检测出同鲑科鱼类序列占比11.27%，展现出对近缘物种的区分能力。

米及其近缘序列占比超过92%

鲁氏耶尔森菌及其近缘序列占比达到100%

褐鳟相关序列占比70.47%

海南大学三亚南繁研究院副院长夏志强表示：“依托全物种鉴定方案SeqFD简化建库、CycloneSEQ实时测序、SpecID Hub智能分析的三大核心模块，我们希望以全流程自主可控体系，为种业振兴、国门安全、食品安全和生物多样性保护提供技术底座。”

华大生命科学研究院数据中心主任魏晓锋指出：“在AI驱动的科研时代，构建从数据获取、智能解析到持续优化的闭环，是提升物种鉴定能力的关键。CycloneSEQ-SeqFD方案正是这一理念的实践：SeqFD实现高通量标准化建库，CycloneSEQ提供实时长读长测序，SpecID Hub通过AI模型完成物种智能解析，并将经验证的序列与鉴定结果持续沉淀、回流至参考数据库和识别模型。我们希望以这套‘建库+测序+智能分析’的全流程方案，让每一次鉴定都成为下一次更准确识别的基础，推动物种鉴定从传统送检走向更高效、更普惠的现场应用。”

未来，该技术方案将持续迭代优化，深化多场景适配能力，推动物种数据与智能模型的双向进化与反馈迭代，以高质量数据集和模型能力赋能行业应用，让精准物种鉴定从实验室走向田间、口岸、车间与执法一线，真正成为各领域“用得上、用得起、用得好”的普惠型技术工具。

*本文转载自“CNGBdb”微信公众号

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