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科研人员开发荧光显微成像新技术——用极少光子“看清”活体动物大脑活动

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来源:滚动播报

(来源:千龙网)

在脑科学实验当中,科研人员常面临一个困境:想要看清活体动物大脑中大量神经元的活动,如果显微镜打光太亮,会损伤细胞,甚至扰乱大脑原本的生理状态;如果灯光调弱,获得的信号又微弱残缺,得不到可靠实验数据。

中国工程院院士、清华大学自动化系教授戴琼海团队为这一问题给出新解法——研发首光子事件感知荧光寿命成像方法(EFLIM),在保证成像质量的条件下,将高质量荧光寿命成像所需要的荧光分子数量降低99%。应用该技术,即便在光子极度匮乏的低光环境下,依然可以实现稳定的定量荧光寿命成像。相关成果近日发表于《自然·生物技术》杂志。

定量观测遭遇“硬约束”

生命科学,尤其是脑科学研究,对显微镜成像技术提出了很高现实要求:在介观尺度进行活体成像,不仅要看清单个神经元,还要同步记录大片脑区、上百万个细胞的实时活动。大视野、快速度、长时间记录,三者要同时兼顾。

“现在绝大多数活体荧光成像,依靠荧光的强度,也就是亮度来成像。”团队成员之一、清华大学自动化系副教授吴嘉敏道出实验中的痛点,“亮度信号很直观,但干扰源特别多。荧光探针分布不均、激发光源波动、生物组织散射、小动物实验样本扭动、光漂白效应等,任何一项都会引起图像亮度的改变。做实验的时候,我们经常分不清信号起伏来自细胞真实的生理活动,还是外界干扰带来的假象。定量分析就成了难题。”

为了规避亮度成像的缺陷,科研团队在实验室采用了荧光寿命成像(FLIM)技术。该技术不依赖荧光强度,而是测量荧光分子受激发之后的存活时间,即荧光寿命。这一物理参数不受探针浓度和光源功率的干扰,还可以反馈细胞内部微环境、蛋白相互作用,是非常理想的定量观测手段。

然而,将FLIM应用到大视野活体实验时,却遇上了物理条件的“硬约束”。传统FLIM要拿到可靠结果,需要对每一个像素点进行多次重复激发,收集足够数量的光子,再通过统计直方图计算荧光寿命。

“当视野扩大、成像提速之后,分摊到每个像素的光子数就会变少。”吴嘉敏介绍,“想要攒够统计用的光子,只有两条途径:增强光照,或者拉长拍摄时间。但强光会带来光毒性,伤害活体细胞;拉长时间,又跟不上神经信号转瞬即逝的变化。这就是过去FLIM很难大规模用于活体介观观测的核心原因。”

计算成像突破物理边界

研究初期,团队沿着传统技术路线反复调试算法,但始终很难突破物理天花板。在一次组会上,研究人员提出一个关键的问题:是不是必须攒够一大堆光子,才能做荧光寿命统计?正是这个疑问,成为整个项目思路的转折点。

EFLIM的核心突破,就是跳出了“先攒大量光子,再做统计拟合”的传统范式,把每一次激光激发都视作一次独立观测事件,把稀疏微弱的光子信息充分利用起来。

“传统方法好比要等一桶雨水接满,才开始统计雨量。”论文第一作者、清华大学自动化系博士生周逸亮打了个比方,“EFLIM不一样,每一次激光脉冲激发后,我们只关注有没有光子被探测到,如果有,就记录下第一个到达探测器光子的到达时间。哪怕大部分脉冲激发未产生任何光子,这条观测事件信息也会被保留下来。”

只依靠零星、稀疏的首光子事件,图像信号天然残缺。因此,团队进一步将荧光寿命估计转化为时空自监督去噪问题。依托生物图像本身具备的空间、时间连续性,团队利用算法参考相邻像素、前后时间帧的稀疏信号,让算法自主学习统计规律,最终重建完整的荧光寿命图像。

“经常有人问我们,算法是不是无中生有造出信号。”吴嘉敏特意澄清,“并不是。我们没有生成不存在的数据,只是改变了数据使用策略,让每一个采集到的光子价值最大化。”

多组对照实验验证了这套方案的有效性。在成像质量相当的前提下,EFLIM所需的光子数量相比传统FLIM减少了99%。在清醒小鼠脑钙成像实验中,平均每个像素仅接收到0.2—0.8个光子,仍可输出稳定的荧光寿命读数;在活细胞钙动态观测中,单像素光子数量低至0.2—0.5个的极端条件下,也可以还原细胞内部的快速变化。

“计算成像的魅力,在于光学硬件与算法协同设计,突破原有物理边界。”戴琼海说,“过去大家默认,定量测量必须要有充足光子。EFLIM证明,通过重构解读逻辑,极少光子同样可以实现高精度定量成像。”

多领域应用潜力巨大

长期以来,荧光显微成像一直在成像视野、速度、分辨率与光损伤之间做权衡。EFLIM以事件化采样搭配时空自监督算法,把荧光寿命成像的光子门槛大幅压低,为低损伤活体定量观测打开新空间。随着工程化迭代推进,这项新技术有望为我国脑科学、肿瘤、免疫等领域的基础研究,提供全新观测手段。

“清醒动物脑成像是一块‘硬骨头’。动物会活动,神经信号变化极快,强光还会扰动脑组织本身的状态。多重干扰叠加,测量稳定性很难保障。”吴嘉敏介绍,借助EFLIM,光照剂量被大幅压低,能够有效抑制样本运动、荧光波动带来的测量偏差,实现单细胞尺度稳定检测。该技术未来有望支撑清醒动物高速神经活动记录、数小时级别长时程低损伤观测,以及更深层脑组织成像,降低观测行为本身对实验对象的干扰。

EFLIM的应用不仅限于神经科学。在细胞研究中,新技术可用于捕捉亚细胞尺度钙信号变化;免疫学研究中,依靠荧光寿命差异,可在单一光谱通道区分多种细胞,追踪免疫细胞迁移与细胞相互接触过程;在病理成像方面,团队已经完成169例人脑胶质瘤组织成像,单视场采集仅需0.33秒,速度较传统方式提升10倍,同时保留了组织结构与肿瘤异质性信息。

目前,这项研究已完成原理、算法、多类生物样本的验证。它的创新主要集中在算法层面,不需要对显微镜硬件做颠覆性改造。

“未来可以将其做成软件模块、升级插件,直接兼容现有的FLIM设备。科研仪器的转化路径相对更近,有望数年内逐步推向实验室。”吴嘉敏说,“但如果走向医院临床病理诊断,就要走一条更长的路,需要大规模多中心样本验证,建立统一标准,完成医疗器械整套审批流程。”

在戴琼海看来,做仪器技术研究,论文只是阶段性成果,真正目标是服务一线科研人员的实验需求。“高端科学仪器是基础研究的‘眼睛’,我们希望开发真正好用的工具,帮助科学家看见过去看不见的生命过程。”

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