上海
近年来，单细胞RNA测序（single-cell RNA sequencing，scRNA-seq）已成为解析细胞异质性的重要技术，但绝大多数单细胞RNA测序方法主要测量基因表达水平，难以解析转录本异构体（transcript isoforms）及RNA加工过程。随着长读长测序等新技术的发展，单细胞转录组学正逐步迈向异构体分辨率，为解析可变剪接、可变转录起始、可变多聚腺苷酸化等RNA加工过程提供了新的技术手段。
近日，费城儿童医院王丰、邢毅、林兰在Trends in Genetics发表综述文章Beyond Gene Expression: Single-Cell Transcriptomics at Isoform Resolution，系统总结并展望了异构体分辨率单细胞转录组学的发展历程、技术进展及未来方向。
该综述回顾了单细胞RNA测序从传统基因表达分析向异构体分辨率发展的技术演进，总结了短读长和长读长测序技术以及相关计算方法的最新进展，并重点介绍了异构体分辨率单细胞转录组学在解析转录本异构体、RNA序列变异、等位基因特异性表达与转录本结构、转座元件来源转录本、融合转录本、非poly(A) RNA、RNA修饰、免疫组库等方面的应用。文章还讨论了空间转录组、多组学整合、遗传扰动、群体遗传学和人工智能等新方向的发展趋势，展望了异构体分辨率单细胞转录组学在基础研究和生物医学研究中的应用前景。
作为本期封面文章，作者团队设计了原创插画“异构体烤串（Isoform Kebab）”。画面中，每个盘子代表一个细胞，每根烤串代表一个转录本异构体，每一块食材代表一个外显子，不同食材的排列组合对应不同的异构体，以生动直观的方式展现了单细胞水平的转录本多样性。值得一提的是，本期不仅是Trends in Genetics创刊以来的第500期，也是聚焦pre-mRNA剪接的专题专刊。这幅以“异构体烤串”为主题的封面巧妙呼应了本期主题，也寓意着单细胞转录组学向异构体分辨率发展的趋势。
https://www.cell.com/trends/genetics/fulltext/S0168-9525(26)00140-X
制版人： 十一
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