上海
撰文丨王聪
编辑丨王多鱼
排版丨水成文
2026 年 7 月 29 日，南京大学黄硕团队（陈佳璐、张含含、王可凡为论文共同第一作者）在国际顶尖学术期刊Nature上发表了题为：Sequential reading of a stepwise-shortened peptide immobilized on nanopore 的研究论文。
该研究提出了一种全新的纳米孔多肽测序策略——瞬态孔-分析物环化（transient Pore Analyte Looping，tPAL）。该策略通过工程化改造纳米孔、固定单个肽分子，并结合酶促逐步切割，实现了对肽链氨基酸序列的连续读取，为单分子蛋白质测序领域带来了新的技术路线。
准确解码肽段序列在蛋白质组学中至关重要。然而，由于肽段的组成和结构复杂性，实现这一目标在技术上具有挑战性。受纳米孔核酸测序成功启发的相关研究表明，基于纳米孔的技术也可应用于肽段测序。其关键在于：在纳米孔连续读取过程中，产生分布窄、一致性高且具有序列依赖性的信号事件。
在这项最新研究中，研究团队提出一种名为“瞬态孔-分析物环化”（transient Pore Analyte Looping，tPAL）的纳米孔策略。研究团队开发了一种经工程改造的耻垢分枝杆菌（Mycobacterium smegmatis）porin A 蛋白（MspA）纳米孔，该孔道经镍离子结合的次氮基三乙酸（NTA-Ni）适配体与目标肽段双重修饰。这种独特的传感构型通过多次重读实现了对固定化肽段 N 端的精准识别。借助胆固醇化氨肽酶，固定化肽段能以单氨基酸为增量逐步缩短，产生序列依赖、阶跃式且分布窄的信号变化，为肽段序列解码提供线索。
总的来说，该研究利用纳米孔技术提出了 tPAL 策略，通过“固定肽分子-重复读取-逐步切割-信号解析”的创新模式，实现了单分子肽序列的单氨基酸分辨率的解析，可有效识别单氨基酸突变、翻译后修饰及非天然氨基酸插入——表明其在纳米孔蛋白质组学与手性肽分析中具有广泛适用性。
论文链接：
https://www.nature.com/articles/s41586-026-10868-y
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