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PNAS | 戈凯团队揭示脂肪细胞中组蛋白伴侣HIRA的功能及调控转录的新机制

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脂肪组织在维持机体糖脂稳态中发挥核心作用,其不仅负责能量储存,还作为内分泌器官分泌多种脂肪因子1,2。 脂联素 ( a diponectin ) 由 Adipoq 基因编码,是调节胰岛素敏感性的关键脂肪因子, Adipoq 敲除小鼠表现出严重的胰岛素抵抗,尤其是在高脂饮食刺激下3,4。脂肪组织的 发育 ( adipogenesi s ) 受到 PPARγ 、 C/EBPα 等转录因子及多种表观 遗传 因子的共同控制5,6,脂肪细胞数目增加 ( 增生 ) 及体积增大 ( 肥大 ) 共同驱动了肥胖状态下脂肪组织的扩张2,7。然而,组蛋白伴侣在脂肪组织功能维持及扩张中的作用未被报道 过 。

组蛋白伴侣 HIRA ( H istone R egulator A ) 可将组蛋白 H3 变体 H3.3 以不依赖 DNA 复制的方式 整合到 基因调控区域包括启动子和增强子8-12。此前研究表明, HIRA 介导的 H3.3 在基因组上的整合 对胚胎发育、心脏发育、造血及肌肉再生等多个生物学过程至关重要,提示其功能具有谱系或阶段特异性13-16。然而, HIRA 如何调控基因表达,并 是否参与脂肪组织功能调控,目前尚不清楚。

近日,美国国立卫生研究院 ( NI H) 糖尿病 和消化及 肾脏病 研究 所 ( NIDDK )戈凯团队在PNAS杂志上发表了题为Histone chaperone HIRA regulates adiponectin expression and obesity-associated adipose expansion by facilitating Pol II pause release的文章 。该研究证明脂肪细胞特异性敲除Hira会损害小鼠胰岛素敏感性并限制高脂饮食诱导的脂肪组织扩张机制上HIRA结合Adipoq及脂代谢基因的启动子和增强子,促进暂停在启动子上的RNA聚合酶II(Pol II)释放及转录延伸这一过程很可能独立于HIRA经典的整合H3.3功能


研究团队首先将 Hira f/f 小鼠与 Adipoq -Cre 小鼠杂交,构建了脂肪细胞特异性 Hir a 敲除小鼠 ( A-KO ) 。在正常饮食条件下, A-KO 小鼠的体重、脂肪量及瘦体重与对照组 ( f/f ) 小鼠并无明显差异,但血清脂联素水平降低约 3 倍,胰岛素水平及 胰岛素抵抗稳态模型评估 指数 ( Homeostasis Model Assessment of Insulin Resistanc e ) 显著升高,提示存在胰岛素抵抗。 对脂肪组织的 RNA - Seq 分析显示, Adipoq 、 Retn 、 Slc25a1 等胰岛素 应答 及脂代谢相关基因表达显著下调,而脂肪 发育 标志基因 Pparg 和 Cebpa 未受影响,表明 HIRA 缺失特异性影响了 脂代谢 基因 表达 。

为探究 HIRA 在肥胖发生中的作用,研究人员进一步给予小鼠 8 周高脂饮食喂养。与对照组相比, A-KO 小鼠体重及脂肪量增加显著减少,尤其是附睾脂肪增重受限最为明显 ,且 脂肪细胞体积总体偏小,提示脂肪细胞肥大过程受阻。 同时, A -KO 小鼠 血清 中 总胆固醇、脂联素及瘦素水平均显著降低。 RNA - S eq 结果表明 , Fasn 、 Agpat2 、 Bscl2 、 Cd36 等脂代谢基因在两种脂肪组织中一致下调,功能富集分析显示这些基因高度集中于脂质代谢通路 。这些结果 提示 HIRA 对肥胖相关的脂肪组织扩张至关重要。

为深入 探究 HIRA 调控转录的分子机制,研究团队在 3T3-L1 脂肪 前 体 细胞中引入 dTAG 快速蛋白降解系统 ,实现对 HIRA 蛋白的 快速 清除 ( 3 小时内清除超过 90% ) ,从而避免 稳定 基因敲除带来的继发效应。 ChIP-Seq 分析显示, HIRA 在脂肪细胞分化 第 4 天 直接 结 合 Adipoq 、 Chrebp 、 Fasn 等 脂质代谢 基因的启动子和增强子区域 。第 4 天 恰好是这些基因被强烈诱导表达的 时间点。 结合新生 RNA 测序 ( nascent RNA-Seq ) 分析,研究人员发现 快速 清除 HIRA 后, Adipoq 及 Chr ebp 等 多个脂代谢基因的转录水平显著下降,证实 HIRA 对这些基因的转录具有直接的正向调控作用。

有意思的是, 快速 清除 HIRA 后,转录 共 激活因子 CBP 、 BRD4 及 Mediator 复合物亚基 MED1 在增强子上的招募几乎不受影响,说明 HIRA 并非通过调控增强子活化发挥作用。进一步 对 Pol II 在染色体上的结合 分析显示, HIRA 清除后 Pol II 在启动子处 明显 累积,全基因组水平 P ol II 的暂停指数 ( pausing index ) 显著升高;与此同时,代表转录起始的 Ser5 磷酸化 Pol II 水平上升,而代表转录延伸的 Ser2 磷酸化 Pol II 及延伸因子 CDK9 、 SPT6 水平则明显下降。这些结果表明, HIRA 的核心功能在于促进 Pol II 从启动子近端暂停状态释放并进入有效延伸,而非调控转录起始。值得注意的是, 快速 清 除 HIRA 6 小时后, H3.3 的整合 仅出现 微弱 下降,而 Pol II 暂停释放 的 缺陷 明显 ,提示 HIRA 介导的这一转录调控机制很可能独立于其经典的 H3.3 整合 功能。


总的来说,该研究首次将组蛋白伴侣 HIRA 与脂肪组织功能及肥胖联系起来,揭示了一条区别于经典 H3.3 整合 途径的全新转录调控机制 : HIRA 直接结合 Adipoq 及脂代谢基因的调控元件,促进 RNA Pol II 暂停释放及转录延伸,从而维持 相关基因的正常表达 。这一发现不仅拓展了组蛋白伴侣调控基因转录的认知框架,也为肥胖及胰岛素抵抗的治疗提供了潜在的新靶点。

NIH 的万丹阳博士是本文的独立第一作者 ( 现为 NIH Research Fellow ) 。原 NIH 终身 资深研究员 戈凯为通讯作者。 该工作得到了 NIH 的 Keiko Ozato 和 Oksana Gavrilova 等合作者的大力支持。

https://doi.org/10.1073/pnas.2603875123

戈凯教授现已全职回国,加盟浙江大学医学院附属第一医院,创建表观遗传研究所并担任所长。研究发育、肥胖和肿瘤的表观遗传调控,聚焦增强子上的染色质修饰酶。戈凯团队 现阶段在国内具备充足且稳定的科研经费支持 ,现面向国内外招聘优秀团队成员。感兴趣的请联系。

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制版人:十一

参考文献

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