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Med:浙江大学沈宁团队通过AI设计的ASO疗法,延长早衰症寿命超80%

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撰文丨王聪

编辑丨王多鱼

排版丨水成文

早衰样层蛋白病(PL),包括哈钦森-吉尔福德早衰综合征(HGPS),是一类罕见的早衰疾病,会导致加速衰老和致命性的心血管功能衰竭。目前的治疗方法对生存获益有限,而由于患者基因型多样以及缺乏生理相关的模型,开发普适性的基因治疗仍面临挑战。

反义寡核苷酸(ASO)是一种有前景的治疗策略,但其最佳设计原则及其对心血管病理的影响仍不明确。

2026 年 7 月 1 日,浙江大学良渚实验室沈宁团队(吕林刘畅为论文共同第一作者)在 Cell 旗下旗舰医学期刊Med上发表题为:AI-driven therapeutic antisense oligonucleotide for processing-deficient progeroid laminopathies 的研究论文。

该研究创新性地利用人工智能(AI)算法,设计出具有转录水平特异性的反义寡核苷酸(ASO)——LM2556,靶向处理缺陷的层粘连蛋白A亚型,作为针对早衰症的“万能钥匙”。LM2556 在患者来源的心肌细胞、心脏类器官及早衰症小鼠模型中均得到验证,能安全抑制有毒的早衰样蛋白,改善心脏功能障碍,并将早衰症小鼠的中位寿命延长 82.86%。这一研究路径表明,将人工智能与基因靶向策略相结合,可显著加快针对罕见病的个性化治疗药物研发进程。



该研究的核心发现;

  • 深度学习框架可实现反义寡核苷酸(ASO)的计模拟筛选;

  • ASO 治疗加工缺陷型早衰样核纤层蛋白病;

  • 在心肌细胞、心脏类器官和小鼠模型中验证了设计的 ASO 的治疗效果;

  • ASO 长期治疗可延长早衰症小鼠模型的寿命和健康寿命。

早衰样层蛋白病(PL)包括一系列以加速衰老和全身生理功能衰退为特征的罕见遗传疾病。这些疾病从根本上由核纤层加工过程紊乱驱动,其中层粘连蛋白 A 的成熟缺陷导致有毒异构体的积累以及核膜的进行性结构异常。其中,哈钦森-吉尔福德早衰综合征(HGPS)是最典型且研究最深入的类型;其经典关联为 LMNA c.1824C>T(p.G608G)突变, 该突变产生 法尼酰化修饰修饰的 有毒异构体早老蛋白 ( progerin ) 。

然而,PL 涵盖更广泛的基因型谱系,ZMPSTE24 功能缺失突变同样会导致未完全加工的层粘连蛋白 A 积累,从而引发 PL 样表型。对 PL 患者队列的分析证实,一系列非经典 LMNA 突变及 ZMPSTE24 缺陷占 PL 患者的 50% 以上。这种基因型多样性表明,仅针对经典突变的治疗策略对于更广泛的 PL 患者人群而言是不够的。

在这项最新研究中,研究团队开发了一种人工智能(AI)模型——ASOMAR,这是一种二分类模型,结合了卷积神经网络(CNN)以捕捉序列特征,以及多层感知机(MLP)来整合化学修饰和热力学参数等非序列特征,用于预测高效的 mRNA 降解靶位点,并输出反义寡核苷酸(ASO)在降解目标 mRNA 方面是否具有高效率。


接下来,研究团队使用ASOMAR设计靶向 LMNA 转录本的3′UTR的 ASO,旨在通过减少减少异常蛋白加工所需的底物,降低异常蛋白加工导致的有毒核纤层蛋白 A(lammin A)异构体的积累,从而将适用患者群体扩展至所有加工缺陷型核纤层蛋白病。

设计的候选 ASO 在患者来源的诱导多能干细胞衍生的心肌细胞(PL-iCM)、三维心脏类器官以及 LMNA 转基因小鼠模型中进行评估,并通过分子学、组织学和血清生化分析,对药物的有效性、毒性和全身转录反应进行评估。

优化后的 ASO——LM2556,可选择性地降低早老蛋白(progerin)和法尼酰化修饰的前体核纤层蛋白 A(farnesylated pre-lamin A)的表达,同时保留核纤层蛋白 C(lamin C)。在体外实验中,LM2556 减轻了 PL-iCM 和心脏类器官中的细胞衰老,并改善了其结构与功能表型。在体内实验中,LM2556 可在多种组织中减少致病 lamin A 异构体的表达,且未发现肝毒性或肾毒性。长期给药可缓解早衰样特征,改善心血管病理,使 LMNA 转基因小鼠的中位寿命延长82.86%,并显著提升整体健康寿命。


总的来说,这些发现建立了一个基于人工智能的治疗性反义寡核苷酸设计框架,并提供了概念验证证据,表明靶向 LMNA 转录本的 3′UTR 可有效抑制致病性核纤层蛋白 A 异构体,改善全身系统性早衰表型。

论文链接

https://www.cell.com/med/fulltext/S2666-6340(26)00196-0





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