哪个育种软件比较好？——育种数字化工具深度解析与推荐

如果你是一名育种工作者，或者种业企业的负责人，你一定有过这样的经历：

• Excel表格越做越臃肿，多年多点数据根本理不清；

• 田间采集靠纸质记录，回来补录错误率居高不下；

• 品种晋级靠老育种人的经验判断，缺乏数据支撑；

• 基因型数据和表型数据割裂，难以联合分析；

• 每次出报告都要手工拼凑，效率低、格式乱……

这些痛点，正是当前我国大多数种业公司和科研单位每天都在面对的真实困境。好消息是，随着育种4.0时代的到来——常规育种+生物技术+信息化三位一体的模式正在迅速普及，一批专注于育种数字化的软件平台已经脱颖而出。

本文将从育种人视角出发，梳理当前市场上育种软件的核心痛点，并重点介绍一款在国内一个成熟、全面的智能育种平台——百奥云BAISeeds平台，供大家参考。

一、育种软件市场现状：为什么选错软件比没有软件更糟？

市面上的农业/育种相关软件琳琅满目，有的侧重田间数据记录，有的主打基因分析，有的是通用统计工具的农业版。很多企业和院校买了软件之后却发现：

• 功能碎片化，品种测试、基因型分析、繁育管理各用一套工具，数据无法打通；

• 本土化不足，界面和流程不符合中国育种家的使用习惯；

• 缺乏深度分析，只能存储数据，无法支持晋级决策；

• 没有持续迭代，买来就停更，问题无人跟进。

真正好的育种软件，应该像一位懂育种的数字化助手——既能帮你管数据，又能帮你做分析，还能帮你做决策。按照这个标准来看，目前国内真正达到这一水准的平台并不多，而百奥云是其中最值得关注的一家。

二、百奥云是谁？一家什么样的公司？

长沙百奥云数据科技有限公司成立于2018年1月，总部位于湖南长沙，在三亚、北京设有分公司。这是一家由海归高层次人才创立的新型农业高新技术企业。

创始人王冰冰博士毕业于美国爱荷华州立大学遗传学专业，曾在杜邦先锋担任基因组信息挖掘团队负责人，回国后参与组建华智生物技术有限公司。他带领的团队专业技能覆盖生物信息、统计分析、数据管理、软件开发、遗传育种、分子生物学、机器学习和图像识别等多个领域，是一支农业+生物+IT复合型新生力量。

核心数字一览

• 成立年份：2018年

• 软件著作权：42项

• 发明专利：6项（含2项完全自主产权已获批）

• 顶级论文：6篇（Plant Communications、Plant Physiology等）

• 合作客户：隆平高科、正大种业、DBN等国内头部企业及多所高校科研单位

• 荣誉：三次入选中国未来农业TOP100，三次荣登IFA种业创新TOP榜单

企业使命是让育种变轻松，愿景是应用人工智能，引领精准育种。这不是一句空洞的口号，而是贯穿在每一款产品里的产品哲学。

三、百奥云BAISeeds平台全景解析

BAISeeds是Biotech和AI Seeds的简写，是一个整合生物技术和人工智能技术的育种平台。平台采用7+2产品矩阵——7个核心模块+2个大数据入口，覆盖从种质资源创新到良种选配的完整数据链。

1. 种质资源系统GeRMS——资源管理从此不再乱

这是专为科研单位和种企设计的数字化管理平台，覆盖种质材料从入库登记、存储监控到出库使用的全生命周期管理。系统通过条形码/二维码实现资源唯一标识，支持批量出入库操作及库存动态更新，并结合库存预警功能（库存量、发芽率、有效期等自动提醒），确保资源有效利用。

亮点：种质材料统一编码，一码通行BAISeeds各模块；系统自动生成系谱图，支持3D和2D视图展示；整合表型相似性分析、性状相关性分析、聚类分析、PCA分析、系谱分析等丰富数据分析功能。

2. 百奥繁育FiNMS——育种圃管理全流程数字化

作为BAISeeds平台的核心模块，百奥繁育深度融合现代商业化育种实际流程，围绕群体构建、亲本选育、回交改良及材料组配等核心场景，打造覆盖方案设计、繁育实施及田间调查的数字化管理平台。

系统通过繁育清单组织、授粉计划设计、田间数据采集及系谱世代自动升级等功能，构建从种质资源创新到良种选配的完整数据链，实现材料系谱演化追溯与育种决策闭环管理。支持自交、杂交、回交及DH育种等多种育种方法，收获材料自动回归种质资源库，推动遗传基因的持续积累与优化。

3. 百奥E采——田间采集，一部手机搞定

很多育种团队的数据采集效率低下，根本原因在于工具落后。百奥E采是一款移动端数据采集工具，设置了育种助手小程序和APP企业版两个版本。

• 支持离线采集，不怕田间没信号；

• 田间扫码一键获取信息；

• 支持数据、图片和语音采集，15秒连录性状；

• 可基于Web端创建分发任务，多人协同，统一记录标准。

4. 表型数据系统PheDS——数据驱动育种决策

PheDS是很多育种企业最直接感受到数字化价值的模块。它以流程自动化和数据驱动可视化为设计理念，支持品种测试试验创建、数据采集与录入、多年多点数据分析、快速晋级决策、测试报告一键生成、结果可视化等全流程操作。

特别值得一提的几个功能：

• 原始数据空间校正：针对田间数据误差较大的问题，系统采用空间校正方法减少环境不均一误差，校正后的差异能反映出品种之间真正的差异。

• 田间热力图：田间产量分布可视化，辅助检测各试点田间管理情况，便于科学调整测试点。

• 七种可视化图表：包括柱形图、折线图、K线图、雷达图、散点图、适应区域图和地图等，直观呈现数据背后的意义。

• 品种测试报告一键生成：支持在线编辑、多人共享、修改历史跟踪，导出可编辑文档到本地，完全符合国家品种审定要求。

• 区域适应性分析：通过分析比较品种间、品种与对照在地域上的性状适应性，帮助企业定位品种适应的区域，为精准销售提供数据支持。

• 晋级推荐与追踪：可根据设置好的晋级标准，自动推荐符合条件的品种，晋级时可快速查看田间图片，晋级后可追踪晋级过程。

5. 基因型大数据系统GBDS——挖掘数据资产

GBDS是专为海量SNP基因数据设计的高效管理分析平台，采用分布式数据库架构，支持PB级数据存储与秒级检索，可整合多物种、多版本基因组数据。其三特点让人印象深刻：

• 更海量：系统基于大数据集群分布式存储，可存储百亿级SNP基因型数据，高扩展、高可靠、高性能。

• 更快速：秒级快速检索，轻松查看指定区间的基因型，检索速度不随数据量增加而变慢。

• 更专业：整合专业生信分析工具，有效进行全基因组关联分析、遗传距离、PCA、聚类分析、ADMIXTURE分析等。

此外，系统还支持基因编辑变异位点确认、目标基因快速定位及回交育种回复率检测，实现材料遗传背景深度解析与相似性评估。系统内置专业可视化模块，提供进化树构建、品种真实性鉴定等工具。

6. 基因组预测与选择系统GPaSS——智能育种加速器

基因组选择（Genomic Selection）这一概念由挪威生命科学大学的Theo Meuwissen教授于2001年提出，是当前最前沿的育种技术之一。百奥云的GPaSS系统将这一技术做成了易用的产品工具。

GPaSS提供多达8种算法供用户自由构建模型，涵盖：

• 主流混合线性模型：GBLUP、RRBLUP

• 贝叶斯系列：BayesA、BayesB、BayesCpi

• 机器学习方法：支持向量机（SVM）、随机森林（RF）

• 深度学习方法：DNNGP（由中国农业科学院联合多家单位共同开发，速度更快，在大规模数据集上预测优势明显）

GPaSS支持自交系预测和杂交组配预测两大场景，并提供综合指数评价和性状两两关联选择功能，最终筛选出候选材料清单。用户还可以上传真实观测表型数据进行准确性验证。

7. 生物技术实验室信息管理系统BT-LIMS——专为生物育种研究而打造

LIMS系统广泛应用于各行业实验室管理，但在生物育种领域，市场上缺乏能满足特定需求的个性化管理系统。百奥云BT-LIMS系统专为生物育种研发打造，覆盖从项目启动到种子收获的全链条流程。

系统精心设计了9个功能模块，7大核心模块贯穿整个研发流程，包含：全面掌控项目进展、个性化转化实验数据记录、智能化管理载体信息、历史记录一键溯源、多重审批严格质量控制、数据智能流转与共享等核心亮点。

结语

育种是一件慢工出细活的事业，但这不代表我们不能用快工具来辅助它。数字化、智能化的育种工具，不是要取代育种家的经验和直觉，而是把育种家从繁琐的数据管理中解放出来，让他们把更多时间和精力放在真正重要的创新和决策上。

百奥云的使命是让育种变轻松，这句话听起来简单，做起来不易。但从他们七年来不断迭代的产品和持续增长的客户口碑来看，他们显然正在一步一步地兑现这个承诺。