据不完全统计,截至 2025 年,空间转录组分析工具已达 594 款,横跨 77 种技术平台[1]。这不仅折射出该领域的蓬勃活力,更映射出一个让无数科研工作者感同身受的尴尬现实:在同一次实验中,要在视野、分辨率与基因覆盖之间做出「取舍」,已成为这个领域的某种「宿命」。
空间组学的核心困境,被业内形象地称为「不可能三角」——大视野 vs 高分辨率 vs 全转录组,三者似乎永远无法兼得。同样令人困扰的,是灵敏度与通量之间的矛盾——不断提升检测通量的同时,往往要牺牲对稀少转录本的捕捉能力。
过去,许多研究者不得不在这些核心维度间反复权衡,被迫在深度(检测范围)与广度(样品规模)中取舍。想象一下——你站在切片机前,手里只剩最后一张发黄的组织切片,甚至没米粒大。它的「前世」并不乐观:在福尔马林里泡了半年,RNA 质量被判「死刑」。问了三家测序公司,回复如出一辙:「降解严重,建议重新取材。」这意味着再等半年,而课题等不起了。你盯着那张切片,不敢动手,一旦上机失败,这个课题就真结束了。
这是过去空间组学研究的真实困境:不是因为科学问题不够好,而是技术不允许你犯错。珍贵的样本成了不敢尝试的样本。
近日,10x Genomics 以一场名为「Impossible」的发布会,正式发布空间原位分析新平台Atera。它正面解构了「不可能三角」,在大视野(> 5 cm²)、亚细胞分辨率与高通量转录组检测(覆盖 > 18,000 个基因)之间实现了性能层面的全面提升,为空间生物学研究提供新的技术路径。
北京时间2026 年 5 月 8 日上午 10:00,10x Genomics 将举办Atera 平台中文网络研讨会。资深科学家将详解全转录组空间解析的实际应用、高通量队列研究案例及关键性能数据,并现场答疑。
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Atera 如何重塑科研边界?
1. 全转录组覆盖 + 多维定制:终结「盲人摸象」式研究
Atera 全面覆盖 18,000+ 蛋白质编码基因,并支持在全转录组基础上叠加最多 1,000 个自定义基因。同时提供 Atera Select 模块化靶向 panel(1,000~2,000 重)和完全定制 panel(最多 1,000 基因),可检测 SNVs、基因异构体、病毒序列及 CRISPR 向导 RNA。一次实验,兼顾探索与验证,终结「盲人摸象」式研究。
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Atera WTA 全转录组、panel Atera Select 模块化、panel Atera 完全定制 panel
2. 产能全面释放:年 800+ 全转录组样本处理能力
系统单次运行支持 4 张标准载玻片,单张成像面积超 500 mm²,年处理能力高达 800 个 1 cm² 全转录组样本。与传统平台 Xenium 相比,通量提升约 4 倍,手动操作仅需 3~4 小时,样品准备周期 2~3 天。单台 Atera ≈ 4 台 Xenium,极大优化人力与设备投入成本。
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3. 单细胞级灵敏度:精准捕捉被「淹没」的生物学信号
根据 10x Genomics 官方内部测试(宫颈癌、乳腺癌 FFPE 样本),Atera 假阳性率低于 5%~11%;单个海马神经元可检测超 23,000 条转录本。Atera WTA 与 Chromium Single Cell Flex 的基因表达相关性 r² = 0.75,定量结果与传统单细胞测序高度一致,让低丰度转录本和稀有细胞无处遁形。
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4. 更智能的数据基础设施:解放计算力,聚焦科学
Atera 配套云端分析平台,无需编程与命令行操作,即可在浏览器中完成空间数据的可视化与挖掘。支持 10x Genomics Cloud 或第三方云服务,数据瞬间传输、跨团队协作无障碍。研究人员可将精力从繁琐的计算中解放出来,真正聚焦科学问题本身。
5. 生态初成:10x Genomics 整体战略协同推进,Atera 未来已来
随着 Atera 发布,10x Genomics 同步推出 Catalyst Research Services 专业样本检测服务,提供从原始图像到生物学结论的全链条加速。远期路线图包括空间蛋白质组学、碱基测序、多物种 WTA panel 及 3,000-plex Select 模块。一个完整的空间多组学生态正在形成。
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17 世纪,显微镜让人类首次看见细胞;20 世纪,测序技术读通基因蓝图;2026 年,Atera 让科研人员同时看到细胞在哪儿、表达什么、微环境长什么样——终于无需再做「交集性妥协」。我们坚信,Atera 将为生物标志物发现、药物开发与精准医疗开启全新可能。
北京时间2026 年 5 月 8 日上午 10:00
Atera 平台中文网络研讨会
期待您的参与!
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内容策划:王丹琦
内容审核:朱卿
题图来源:图虫创意
参考文献
[1] GUO Z Z, WU R, LI W, et al. Mapping biology in space: from spatial transcriptomics platforms to analytical tools and databases [J]. Sci Bull (Beijing), 2026, 71(4): 921-45.
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