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AI治好了狗的癌症,那人呢?

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作者:Tony

最近有一个刷爆全球科技圈和医疗圈的真实故事:一位来自澳大利亚的程序员,用ChatGPT、AlphaFold等工具,为自己的爱犬设计出一款个性化mRNA癌症疫苗,狗狗在治疗后腿部的肿瘤从网球般大小逐渐变好,现在依旧在欢快地追着兔子。



图源:Paul Conyngham

AI、癌症、逆袭……当这些词汇交融,网友们表示“我们要的就是这样的AI啊”,“爱(AI)能排除万难”;马斯克、布罗克曼(OpenAI总裁)等科技圈大佬也纷纷转发点赞,“仅仅是数字生物学的开始”,“窥见通用人工智能机遇的一角”。

对于肿瘤患者和家属而言,真正戳人的不是“奇迹”本身,而是它暗示着一种可能:如果有人能靠AI把一只狗从“只剩几个月”里抢回来,那是不是也有机会推广到患者身上?但当我们把情绪放在一边,认真追问“我们能不能复制”时,答案就会变得复杂——接下来我们就详细说说。

1

破解四个难题,他用AI“手搓”疫苗

2019年,澳大利亚的程序员保罗·康宁汉姆(Paul Conyngham)领养了一只斗牛梗与沙皮犬的混血犬,在日常相处中他俩建立了深厚的感情。

2024 年,狗狗后腿上长出了网球大小的肿瘤,确诊肥大细胞癌,这是犬类最常见的皮肤癌,在沙皮犬混血中尤其容易出现侵袭性极强的类型。保罗花了几万澳元进行传统手术和化疗后,肿瘤扩散的速度慢下来了,但没有缩小。兽医认为,狗狗的生命仅剩1-6个月。

保罗不想接受这个答案。他打开了ChatGPT——不是让AI帮忙治病,只是想让它帮自己想清楚下一步该怎么走。

ChatGPT给出了方向:免疫疗法

具体说,是针对肿瘤突变设计的个性化疫苗。如果能找到狗狗肿瘤里独有的那些突变,理论上就可以设计一种疫苗,让它的免疫系统去识别和攻击这些突变细胞。

第一个难题:如何提取肿瘤的DNA和RNA并进行分析?

保罗了解到,可以读取基因信息的机器需要花费大约100万美元,他只能联系可提供相关服务的公司或学校。

马丁·史密斯(Martin Smith)是澳大利亚最大的大学基因组学实验室中心主任,在收到保罗“想给自己的狗做基因测序”的请求时,相信他的表情是比较微妙的。

他告诉保罗,基因测序生成数据容易,但解读数据极其困难,计算负担很大。不过保罗表示,他是数据分析师(有17年机器学习和数据分析经验),可以搞定数据分析。

于是,在花了3000澳元(约合不到15000元人民币)后,保罗拿到了宠物狗的基因组数据:一份来自肿瘤组织,另一份来自血液。血液中的有核细胞可作为相对“干净”的对照,用来对比发现肿瘤特有的突变位点。尽管这一方式并非完美(若存在血液系统微小转移,可能引入干扰),但对保罗而言,这是在有限条件下最可行的方案。

第二个难题:这两份DNA数据各有约300GB,且信息就像是碎片,如何把这些碎片组装成基因组去分析?

这个问题保罗是通过AI解决的,他把两份数据送进自己搭建的一套机器学习流水线,开始逐一比对突变位点。这其中:

  • ChatGPT扮演的是研究助理:协助保罗规划研究策略,梳理海量医学知识,告诉他接下来该怎么做 。
  • AlphaFold则像结构预测员:因为可以较为精准地预测蛋白质的3D结构,保罗借助它来分析狗狗肿瘤中突变蛋白的三维构象,旨在寻找那些能强效激活免疫系统、却不误伤正常细胞的新抗原。

整套流程,保罗一边做一边查,就这样一步步破解了DNA密码。

然后他再次找到了马丁教授,告诉他自己分析了数据,找到了发生突变的蛋白质,接着通过另一套算法筛选出了潜在的靶点,并将它们与药物匹配。但他自己不会做药物合成,希望马丁教授能帮他找到可以做出药物的研究机构。

第三个难题:如何根据潜在靶点找到或做出适合狗狗的治疗药物?

在马丁教授的帮助下,他们先是发现在美国有一种现成的免疫药物,认为可能有效。但在申请“同情用药”(获取尚处于研究阶段药物以治疗严重疾病的特定途径)时,却被药企告知这种方式是为人类设计的,被婉拒了。

后来,他们又聊到了在新冠疫情中被大规模推广的mRNA技术。mRNA即信使RNA,就像蛋白质合成的“指令手册”,指导细胞合成所需的蛋白质。

就这样,保罗的目光开始转向mRNA疫苗,从DNA序列中他已经知道狗狗的哪些部分是损坏的,如果能在肿瘤产生的RNA指令中找到相同的突变,那么就知道癌症信号是从哪里来的。

结果他发现了7个新抗原,即在肿瘤细胞中高表达、正常细胞中不表达的抗原,也就是肿瘤特异性标志物,可以作为靶点来设计疫苗。保罗把得到的新抗原选项输入给Gemini,返回了一个疫苗配方,然后用Grok进行检查,发现了其中一些错误并进行了修正。

因此最终的疫苗配方是由Grok开发的,长度约半页纸。



保罗用于创建mRNA疫苗的部分代码;图源:Paul Conyngham

帕尔·索达森(Pall Thordarson)领导的UNSW RNA研究所是澳大利亚顶级的RNA研究机构之一,在看完保罗的方案后,他接了这个项目。

帕尔教授团队用那半页设计,合成了一支脂质纳米粒子包裹的mRNA疫苗。从收到方案到疫苗制备完成,不到两个月。

帕尔教授同时感叹道,一位没有生物学背景的数据工程师靠算法告诉我们怎么构建这支mRNA,这在过去是不可想象的。疫苗设计技术正在实现大众化、普及化。

第四个难题:伦理审批

疫苗已经准备好了,但仍需获得伦理批准才能使用。在保罗看来,这比疫苗设计本身更耗精力,他花了三个月写了一百多页的申请文件,仍未获得批准。

正当保罗为伦理审批焦头烂额的时候,命运再次帮了他一把。

美国犬类癌症联盟创始人Mari Maeda在偶然看到保罗的故事后,把他介绍给了昆士兰大学兽医学院的瑞秋·阿拉维娜(Rachel Allavena)教授。

瑞秋教授在研究犬类免疫疗法领域造诣颇深,已为170多只患癌狗狗做过实验治疗,其中五分之一的肿瘤完全消失。更关键的是,在她已有的伦理审批框架中,可以直接覆盖保罗设计的这支mRNA疫苗。

至此,保罗终于让他的宠物狗用上了他设计的疫苗,并见证了喜人的疗效:

  • 2025年12月,第一针
  • 2026年2月,第二针
  • 2026年3月,第三针



从左至右:试验开始前、第一针注射后1周、第一针注射后7周、第三针注射后;图源:Paul Conyngham

原本在2025年12月前后日渐萎靡的狗狗,如今重焕生机,不仅玩起了玩具,还能奔跑、冲刺,在户外看到兔子时也能欢快地追赶它。

2

那么,我们也能用AI为家人“手搓”疫苗吗?

用AI救助了癌症晚期狗狗,这是一个充满温情的故事。但故事之外,不少人认为,AI能帮助狗治愈癌症,是否意味着人类离治愈癌症也不远了?

首先,“AI治好了癌症”这个结论被夸大了。根据保罗更新的狗狗近况,肿瘤是变小了,但并非完全消失。而且它身上还有一个较大的肿瘤对这次治疗没有反应,目前他们正在做第二轮基因测序,希望找到新的突变位点,从而设计出第二支、更有针对性的疫苗。这也许代表着未来癌症治疗的一种方向,但在人类身上应用仍需要漫长的时间去验证。

其次,动物实验疗法的监管比人类医学宽松得多。如果要推广到人类,中间隔着数年的临床试验、监管审批和可重复性验证,这套为人类健康负责的“保险杠”,是任何技术都无法逾越的。帮助狗狗做基因测序的马丁教授就提出,真正的个性化癌症治疗可能还需要5-10年。

此外,术业有专攻,各环节专业人士的配合必不可少:

  • 一方面,保罗本人17年的机器学习和数据分析经验,以及如今恰好有一批AI工具成熟到了可以被非生物学家使用的程度。这其中的筛选和解读过程,远不是普通人使用AI工具问几句话那么简单。
  • 另一方面,有愿意相信他的科学家:支持基因测序的马丁教授,开发癌症疫苗的帕尔教授团队,帮助通过伦理审批并完成治疗的瑞秋教授。这其中任何一个人说不,可能都不止是翻倍的困难。

还有,AI并非万能。在治疗过程中,新南威尔士大学的结构生物学家Kate Michie就提醒,AlphaFold并不总是准确,狗狗的c-KIT模型置信度只有 54.55,数据偏低。虽然AI承担了很多研究助手的数据分析的工作,但还是需要实验室工作去验证。

最后,如果把目标从“救狗”换成“救人”,需要什么?

  1. 需要一个合法的“临床入口”,而不是个人意志;
  2. 需要肿瘤组织与对照样本,以及规范的测序与数据处理;
  3. 需要完善的“新抗原筛选”与人工复核机制,而不是一次模型推理;
  4. 需要GMP(药品生产质量管理规范)级别的制造、追溯体系与放行检测;
  5. 需要足够的时间窗口;
  6. 需要联合治疗与严密随访,而不是“打一针就结束”。

因此,对普通人来说,这个故事并不是教我们如何“手搓”疫苗,而是看到,目前的AI正以前所未有的速度,加速专业治疗方案的研发。如保罗在采访中所说,我们有机会将某些癌症从“死刑判决书”变为“可管理的疾病”了,这是一个值得期待的未来。

3

把希望落到能承受的地方

再回到这个故事本身,站在患者与家属的位置,我们也许可以这样理解它——

它不是给了我们一个“照做就能成功”的教程;它给我们的是一张“现实世界里个体化抗癌方案如何落地”的结构图:测序拿到肿瘤“身份证”、专家与算法共同筛靶、合规制造药物与质量控制、持续随访评估——AI在其中加速了人能做的部分,但它没有把医学的门槛变成零。

也正因为如此,当我们再问“我能不能为家人手搓一支疫苗”时,就应该理解这个问题的关键其实是:我能不能进入一个让“定制疫苗”变得可能的体系?——有团队、有流程、有制造、有监管、有窗口期。

在这个意义上,这个故事确实把“更多可能性”放到了我们面前:它让我们看到,医学的未来或许不是某一天突然出现“万能解药”,而是越来越多癌症被拆成可以被识别、被追踪、被反复修正的“工程问题”。而我们能做的,是在希望最汹涌的时候,也努力弄清楚:它需要什么条件,哪些部分正在变得更快、更可及。



图源:包图网

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