摘要:CD8+T 细胞是抗癌抗毒的核心免疫细胞,却易在癌症中陷入终末耗竭状态失去杀瘤能力,而组织驻留记忆 T 细胞能长期护佑机体,二者分子表达相似却功能相反。研究团队通过多组学结合Taiji 算法,绘制出 T 细胞命运调控图谱,发现 ZSCAN20、JDP2 是耗竭特异性转录因子,KLF6 为记忆细胞分化关键因子,敲除耗竭因子可恢复 T 细胞功能且不影响记忆细胞形成,为精准 T 细胞工程和肿瘤免疫治疗开辟新路径。
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一、抗癌免疫的核心难题:T 细胞的 “冰火两重天”
CD8+T 细胞是免疫系统里的抗癌主力军,对抗肿瘤和病毒全靠它的杀瘤能力。但在癌症这类慢性疾病中,它极易陷入终末耗竭状态,彻底失去杀伤癌细胞的功能,成了 “躺平” 的免疫细胞。与之相反,组织驻留记忆 T 细胞能在组织中形成长期保护,有效抑制肿瘤生长。有意思的是,这两种细胞的基因表达模式高度相似,功能却天差地别,这也成了科研的一大痛点:怎么唤醒耗竭 T 细胞,还不破坏有益记忆细胞的形成?
二、全新研究思路:揪出调控 T 细胞命运的 “基因开关”
为了解开这个难题,研究团队把目光投向了转录因子,这些蛋白正是调控细胞命运的核心开关。团队整合了 9 种状态下 CD8+T 细胞的多组学数据,搭建了专属的分析平台,还用上了 Taiji 这个特殊算法。这个算法不只是看转录因子的表达量,更能评估它在基因调控网络中的全局重要性,精准找出真正调控 T 细胞命运的关键因子,避免了传统分析的遗漏问题,为后续研究打下了精准的基础。
三、关键发现:两类转录因子,分别掌控耗竭与记忆
通过这份绘制出的转录因子图谱,研究团队终于厘清了两种细胞的调控差异。尽管部分调控因子是二者共享的,但ZSCAN20和JDP2这两个此前未被研究的转录因子,被证实是 T 细胞耗竭的特异性驱动因子,而KLF6则是促进 T 细胞向记忆细胞分化的关键。在小鼠实验中敲除编码前两者的基因,小鼠和人类的 T 细胞耗竭被有效阻止,杀瘤功能也成功恢复,更惊喜的是,记忆细胞的形成完全没受影响。
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这份图谱清晰展现了终末耗竭 T 细胞中的单状态转录因子,也通过体内基因敲除实验验证了耗竭因子的关键作用,敲除相关基因的 T 细胞,进入耗竭状态的比例远低于对照组,直观证明了这些因子是 T 细胞功能异常的核心原因。
四、小鼠实验验证:恢复杀瘤能力,助力免疫治疗
在小鼠模型中,针对 ZSCAN20 和 JDP2 的干预手段,不仅让 T 细胞重新拥有了肿瘤控制能力,还大幅提升了小鼠对免疫治疗的响应效果。更关键的是,整个过程中组织驻留记忆 T 细胞的形成和功能都没受到任何损伤。这一结果直接证实,调控 T 细胞耗竭和记忆形成的基因程序是可以被功能解耦的,我们完全能做到精准阻断细胞功能异常,同时保留机体的保护性免疫,这是肿瘤免疫研究的一大重要突破。
五、临床转化的曙光与挑战
这项研究绘制的转录因子图谱,为精准 T 细胞工程提供了全新蓝图。通过敲除耗竭特异性的基因开关,我们能设计出既保有强大杀瘤能力,又能形成长期免疫保护的工程化 T 细胞。而且这个 “计算 + 实验” 的研究框架,还能推广到其他细胞类型,大大加速细胞疗法的研发进程。当然挑战也存在,免疫系统的复杂性让转录因子的功能具有相对性,人类肿瘤微环境的抑制信号,也可能影响工程化细胞的表现,这些都是后续需要攻克的问题。
六、未来研究方向:打造更智能的免疫治疗方案
研究团队接下来的目标,是打造优化的 T 细胞工程 “配方”,把抑制耗竭驱动因子和增强 KLF6 这类记忆促进因子结合起来。同时,借助人工智能技术建模,不断优化这些因子组合,实现更理性的设计,打造出更智能、更持久的免疫治疗手段。从 2019 年研究团队被这个科学谜题吸引,到跨学科合作碰撞出火花,再到如今的关键发现,这场免疫与计算的结合,正为肿瘤治疗带来全新的可能。
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