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Science丨唐尧、张天任等开发极端pH条件下自组装多肽颗粒

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在多肽自组装与超分子化学领域,构建兼具高度有序结构与优异环境耐受性的纳米材料,是当前面临的重要挑战。天然蛋白质能够通过复杂的非共价相互作用实现精密的层级组装,但其精密结构通常对环境敏感 。 绝大多数天然蛋白质仅能在狭窄的 pH 和温度范围内维持折叠结构,一旦置于极端 pH (如强酸或强碱)环境,非共价相互作用改变会导致蛋白质变性或无序聚集,限制了利用静电相互作用调控其组装行为的潜力。

近日,特拉华大学材料科学与工程系Darrin J. Pochan团队与宾夕法尼亚大学化学系Jeffery G. Saven团队合作,在 Science 发表了题为

Patchy peptide particles for pH-responsive assembly into liquid crystals or lattices
的研究论文。特拉华大学 Yao Tang (唐尧) 与 Tianren Zhang (张天任) 为共同第一作者, Daibei-Yang (杨岱蓓) 提供了关键计算工作 。该团队以四聚体卷曲螺旋肽(Bundlemer)为研究对象,利用其已知氨基酸位点,在表面引入特定表面电荷图案( Patchy Charge Pattern ) ” ,系统探究其在不同pH环境下的自组装行为,最终实现多肽在极端pH条件下的精准、稳定自组装单条卷曲螺旋肽链( individual coiled-coil chain ) ,为极端环境适用的软物质材料研发提供了新的理论依据与技术路径。


该研究的核心设计的是: Bundlemer 序列包含四个经典的七肽重复单元( heptad ),设计关键在于电荷分布 —— 负电荷残基( Glu )集中在第 1-2 个重复单元,正电荷残基( Lys/Arg )分布在第 3-4 个重复单元,形成 “−−++” 型表面电荷图案;同时构建该电荷图案的多肽变体( PATCH1 、 PATCH2 ,后者电荷密度更高),并设置氨基酸组成完全相同但电荷分布杂乱的对照多肽,结合分子动力学模拟,明确电荷图案 介 导的自组装机制。

实验与模拟表明, pH=1 (强酸)条件下,多肽颗粒表面氨基酸残基质子化、整体带正电,通过卷曲螺旋 首尾相连 ( end-to-end stacking )形成独特的单条卷曲螺旋肽链 —— 这种链段并非普通一维纳米纤维,而是由卷曲螺旋结构首尾精准对接形成的特异性链段。该链段使材料在低浓度(约 4 wt% )下形成向列相液晶( Nematic LC ),高浓度( 10 wt% )下因链间强烈静电排斥,进一步组装成二维六方堆积结构( Hexagonal Columnar Phase )。与之形成鲜明对比的是, 电荷分布打乱的对照多肽,即便在相同 pH 条件下也无法形成单条卷曲螺旋肽链,仅能以孤立卷曲螺旋分散存在,佐证了表面电荷有序分布的决定性作用。

pH=14 (强碱)条件下,多肽氨基酸残基去质子化、整体带负电,尽管负电荷间排斥效应使组装门槛高于酸性条件,且未观察到六方相,但体系仍能形成单条卷曲螺旋肽链并组装成液晶相。 pH=7 (中性)时,多肽颗粒表面 “−−++” 电荷图案完整保留,既能够形成单条卷曲螺旋肽链,又能在相反电荷图案的静电互补性驱动下,使肽链组装成高度有序的柱状类正交晶格; SAXS 建模分析显示,相邻 Bundlemer 链错开半个颗粒长度,以实现静电配对能最优化。

对比 PATCH1 与 PATCH2 (高电荷密度变体)的实验结果,揭示了电荷密度对组装的双重影响: pH=1 时,更高电荷密度增强链间排斥, PATCH2 仅需 0.5 wt% 即可形成液晶,且相变阈值显著降低,体现高电荷密度对组装的促进作用;但 pH=14 时, PATCH2 末端过高负电荷密度在界面产生强烈局部排斥,破坏卷曲螺旋首尾衔接的共线性,导致无法形成单条卷曲螺旋肽链,即便浓度达 10 wt% 也仅以孤立颗粒存在。

MD 模拟进一步从原子层面解析了多肽颗粒首尾衔接的微观机制: N 端残基( 1-3 位)呈非螺旋散乱结构, C 端残基( 27-29 位)为螺旋构象,这种构象差异至关重要 ——N 端的灵活性使其能与相邻 Bundlemer 的 C 端形成紧密内部疏水接触,这种疏水核心的延伸与对接,是卷曲螺旋端对端堆叠、形成单条卷曲螺旋肽链的物理基础。对于 PATCH1 ,不同 pH 下相互作用类型存在差异: pH=7 时,界面存在经典盐桥相互作用( Asp/Glu 与 Lys/Arg 之间); pH=1/14 时,质子化状态改变使盐桥转化为极性接触,但空间接触得以保持,这也解释了为何 PATCH1 能在极端 pH 下维持首尾衔接、形成特异性链段。而 PATCH1 与 PATCH2 在 pH=14 时的差异,源于 PATCH2 过高电荷密度导致的强静电排斥,使束间角度波动增加、界面极性接触显著减少, “ 排斥力 ” 超过 “ 疏水锁 ” 结合力,最终丧失共线性与成链能力,与实验结果完全吻合。

基于模拟结果,研究团队通过端基修饰实验验证了首尾衔接机制:在多肽两端分别添加三个甘氨酸( Gly ), N 端延伸( 3G-N )时, PATCH1-3G-N 和 PATCH2-3G-N 仍能保持卷曲螺旋首尾衔接能力,正常形成单条卷曲螺旋肽链;而 C 端延伸( 3G-C )时,两种多肽均完全失去成链能力,无法形成该特异性链段及液晶相。这一实验有力证实了计算模型的预测,明确 C 端疏水核心( Ile4 和 Ala29 相互作用)在介导 Bundlemer 纵向聚合、形成单条卷曲螺旋肽链中的决定性作用,同时也展现了该体系在 N 端进行功能化修饰的潜力。

该研究的核心创新在于,通过设计具有特定表面电荷图案的卷曲螺旋Bundlemer多肽纳米粒子,实现其在pH=1714的极端范围内的稳定、可控自组装,同时明确了单条卷曲螺旋肽链的形成机制,以及表面电荷图案对该链段形成及后续组装的决定性作用。


基于实验与模拟结果,研究团队建立了多肽自组装核心设计原则:保留 C 端疏水核心以支撑肽链形成、利用末端构象差异实现精准衔接、构建 “−−++” 型电荷图案并借助 D2 对称性调控组装。该设计原则不仅为极端环境智能组装材料提供了新范式,更可推广至其他卷曲螺旋基序, 助力新型 功能材料研发。

综上,该研究通过多手段结合,揭示了表面电荷图案导的Bundlemer自组装机制,明确单条卷曲螺旋肽链的形成规律,建立了可复制的设计原则,填补了极端pH条件下多肽精准自组装的研究空白,为相关软物质材料研发提供了关键理论与技术支撑。

原文链接:science.org/doi/10.1126/science.adz6812

制版人: 十一

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