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Nat Commun丨于骏/曹义娟/郑波/徐梅利用单细胞与空间多组学解析卵巢型子宫内膜异位症的转录与代谢特征

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子宫内膜异位症是一种 常见的 良性妇科疾病,以子宫内膜样组织在子宫外异位生长为特征,常引发慢性盆腔痛、严重痛经及不孕等临床表现。根据病灶分布与浸润深度,该病可分为卵巢型、腹膜浅表型与深部浸润型三种亚型。其中,卵巢型子宫内膜异位症已被多项研究提示为卵巢透明细胞癌和 卵巢 子宫内膜样癌的潜在前驱病变,其高度异质性的分子特征亟待深入解析,以推动亚型特异性诊疗策略的开发与预后管理精准化。

近日,南通大学医学院生殖医学研究院于骏教授团队联合 徐州市 中心医院曹义娟/徐梅主任 团队、苏州市立医院郑波副研究员团队,在国际期刊Nature Communications上发表了题为Single-cell and spatially resolved omics reveal transcriptional and metabolic signatures of ovarian endometriomas的研究成果 ,利用单细胞与空间多组学联合解析卵巢型子宫内膜异位症的转录与代谢全景图谱


尽管 前期已有 研究初步构建子宫内膜异位症的单细胞转录组图谱( Nat. Genet. 2023; 2024 ), 但 其在空间分辨层面的 转录与代谢联动 机制 尚不清晰 。本研究聚焦卵巢型子宫内膜异位症,整合单细胞转录组测序( scRNA -seq )、数字空间分析系统 - 全转录组图谱技术( DSP-WTA ) 及非靶向基质辅助激光解吸电离 - 质谱成像技术( MALDI-MSI ,分辨率 50 μm ) 等 前沿技术,首次在单细胞与空间维度同步揭示其转录与代谢特征。


通过 DSP-WTA 技术,团队 克服了 特定细胞群在空间分布上的局限性,实现对关键区域特定细胞群进行转录组分析 。结合 MALDI-MSI 高通量代谢物成像,研究进一步在 50 微米精度下识别出多个与病变密切相关的代谢标志物 。通过整合单细胞转录组与空间转录组、空间代谢组信息 ,本研究不仅发现了具有高置信度的生物标志物,也为局部微环境下稀少细胞群体的功能研究提供了全新的技术路径。

值得一提的是,于骏教授团队近年来联合多家临床单位,围绕单细胞技术开展系列深入研究,先后系统揭示了卵巢透明细胞癌( Commun Biol. 2025 )、子宫内膜异位症间质 细胞 异质性( Hum Mol Genet. 2025 )及睾丸相关疾病( Cell Biosci . 2025; Cell Mol Biol Lett. 2025; Cell Prolif . 2025; Aging Cell. 2024; Redox Biol. 2023 )中的关键机制与干预靶点。

本研究的创新性在于构建了一套整合 scRNA -seq 、 DSP-WTA 与 MALDI-MSI 的空间多组学技术体系,为卵巢型子宫内膜异位症的早期识别、分子分型及靶向治疗提供了 重要 的数据支撑与策略依据。

南通大学医学院生殖医学研究院 于骏 教授、苏州市立医院郑波副研究员、徐州市中心医院 曹义娟 和 徐梅 主任医师为本文通讯作者。 徐州中心医院祁玉娟 副主任医师 为 本文的 第一作者 , 南通大学附属医院陈霞主治医师、徐州 市 中心医院厉振北 副主任医师与 硕士研究生郑森 、 以及 苏州市立医院 青年教师 武田田为 本文的 共同第一作者。

原文链接:https://doi.org/10.1038/s41467-025-66706-8

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