AAV基因治疗药物是生物制药领域的新兴力量。自2012年首款药物获批以来,全球已有约8款AAV药物上市,其中一半集中于2020年之后。在国内,AAV疗法也迎来快速发展期:首款药物预计于2025年上市,目前已有40多项IND获批,至少7款已进入Ⅲ期临床。
尽管AAV药物研发进展迅速,但其生产工艺中仍存在一个关键难点:病毒包装过程中产生的空壳病毒难以有效去除,且工艺开发缺乏成熟经验参考。
AAV结构与体外包装:工艺复杂,空壳病毒是主要挑战
如图1所示,AAV病毒颗粒为直径约26 nm的二十面体蛋白衣壳,内部包裹约4.7 kb的单链DNA基因组。作为药物载体,其基因组会根据治疗目的进行调整,而衣壳结构通常保持稳定。
AAV的体外包装过程极为复杂(图2)。目前的生产工艺中,除完整病毒颗粒外,常伴随产生大量仅含部分基因组或完全不含基因组的空壳病毒,甚至空壳比例高于完整病毒。这些空壳病毒不具备治疗功能,需在下游纯化中有效去除。然而,空壳与完整病毒在外观上几乎一致,唯一差异在于衣壳内部是否含有DNA——其分离难度犹如从大量空的金蛋中识别出藏有奖品的那一颗。
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空壳AAV的纯化:polyQUAT 表现卓越
完整病毒与空壳病毒之间的关键差异在于内部DNA的有无。DNA带负电,因此两者在电荷属性上存在细微差别,这为离子交换层析分离提供了理论可能。
我们选用AAV9变体(PHP.eB),对比测试了艾万拓多模式强阴离子交换填料BAKERBOND™ polyQUAT(下称polyQUAT)与3款该领域常用强阴离子填料(填料1–3)。结果显示,polyQUAT在空壳去除与病毒回收方面综合表现更优。
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经亲和纯化并置换缓冲液后的AAV样品,分别使用4种强阴离子填料进行进一步纯化(图3)。收集洗脱组分后,采用ddPCR与AUC(分析型超速离心)分别测定病毒滴度与空壳率,并计算回收率,结果汇总于表1与表2。
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在本实验中,polyQUAT在空壳去除效果与病毒回收率两方面均表现最佳,展现出其在AAV纯化中的显著优势。
polyQUAT技术特点:多模式协同,独特配基实现高分辨率
如前所述,完整AAV与空壳病毒因结构高度相似而极难分离。艾万拓polyQUAT多模式阴离子填料凭借其独特的配基结构(图4),实现了优异的分离效果,为AAV下游工艺开发提供有力工具。
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该配基具有较长的分支骨架,有助于与样品充分接触;同时携带多种带电基团,可形成强度各异的相互作用。这些特性共同赋予polyQUAT超高分辨率,使其在复杂分离任务中表现卓越。
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