生信女神刘小乐团队！TIMER3重磅升级

在肿瘤免疫分析中，表达差异和生存分析是前提(表达有差异，差异影响表型)，相关分析是拓展，包括与病理分期、治疗手段、年龄、种族、吸烟、突变、性别、共表达等因素的相关情况。免疫浸润是近些年的热点，从2018年免疫治疗获得诺奖，到2025年外周免疫抑制获得诺奖，热度不减。随着免疫研究的不断延伸、拓展，免疫和生信分析相互成就，助推生信和免疫研究更上一层楼。

纯生信21天教程（可以操作的肿瘤免疫学）

在进行某个基因的免疫分析时，有的果朋友无从下手，主要是因为对肿瘤免疫认识不足。因此，做免疫分析前，务必掌握肿瘤微环境和肿瘤免疫循环等概念，否则一头雾水，或者断章取义。免疫系统在肿瘤发生、发展和治疗中都起着至关重要的作用。随着大数据时代的到来，对肿瘤免疫特征进行综合分析日臻成熟，这方面的代表包括张泽民、刘小乐等。

网址: https://cistrome.shinyapps.io/timer/

TIMER (Tumor Immune Estimation Resource)算法用常规转录组测序的数据分析常见各种免疫细胞在肿瘤微环境的浸润情况，TIMER2.0版本更是将内容条理化。好消息传来，，TIMER也升级到3.0。

网址：https://compbio.cn/timer3/

肿瘤的差异分析

生存分析

突变分析

相关分析（基于表达）

富集分析

免疫分析，与免疫细胞浸润之间的关系

免疫预后分析

免疫治疗响应与表达分析

免疫治疗的差异分析火山图和表格

免疫治疗预后分析

免疫治疗预测分析

个性化分析，需要上传清洁数据

作者是李太文博士，四川大学华西口腔医学院口腔基础医学系硕导，生信大牛刘雪莉教授的博后，以第一作者参与TIMER、TIMER2.0、TISCH、TISCH2.0和HUSCH等在线平台的开发。，李太文博士则回到母校，创建自己的实验室。期待这对师徒继续书写传奇！

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