
1 型糖尿病( T1D )是一种复杂的自身免疫性疾病,占所有糖尿病患者的 5%~10% ,其核心病理特征是免疫系统介导的胰岛 β 细胞破坏和胰岛素缺乏。长期以来,研究普遍认为 T1D 的遗传风险主要通过免疫系统实现,这一观点得到全基因组关联分析( GWAS )中主要组织相容性复合体( MHC )区域的强信号支持。然而,越来越多的证据提示,胰腺细胞本身 —— 尤其是 β 细胞 —— 也可能直接参与疾病发生。一些风险变异会改变 β 细胞对促炎因子的反应,从而影响其存活率。近期的单细胞功能基因组学工作还发现,胰管细胞和腺泡细胞在疾病进展中也发挥积极作用,表现出免疫样特征。但目前,对于这些非免疫细胞在 T1D 遗传风险中的作用机制,以及风险变异如何通过 β 细胞发挥致病作用,仍缺乏系统性的功能验证。
近日 ,Cell Reports在线发表了 康奈尔医学院陈水冰团队和密歇根大学Stephen C.J. Parker团 队题为Integrative single-cell multi-omics profiling of human pancreatic islets identifies T1D-associated genes and regulatory signals的研究文章。该研究利用人类胚胎干细胞( hESC )衍生β细胞模型,结合单细胞/单核多组学数据和GWAS精细定位,系统解析了胰岛细胞在T1D遗传风险中的作用。研究人员鉴定出DLK1/MEG3、RASGRP1和TOX三个直接通过β细胞介导风险的关键遗传位点,并通过基因敲除、调控元件缺失和等位基因敲入等策略进行了功能验证,揭示这些基因在β细胞分化与存活中的重要作用。这一工作为理解 T1D 的细胞机制提供了新视角,并为通过增强 β 细胞自身防御能力的精准干预提供了新的潜在靶点。
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研究团队首先采集健康供体胰岛,部分样本暴露于细胞因子组合( TNF-α 、 IFN-γ 、 IL-1β )或柯萨奇病毒 B4 ( CVB4 ),模拟自身免疫和病毒应激,随后进行单细胞转录组( scRNA -seq )和单核 ATAC-seq 测序,绘制了 10 种主要细胞类型的基因表达和染色质开放图谱。在 β 细胞中,细胞因子刺激强烈激活免疫应答通路, CVB4 感染则更多触发凋亡信号。差异分析显示,这些扰动引发的转录变化与前驱期 T1D ( AAB+ ) β 细胞的病理特征高度一致。功能 GWAS 分析表明,除免疫细胞外, β 细胞、胰管细胞和腺泡细胞的特异开放染色质区域也显著富集 T1D 风险变异,提示多种胰腺细胞类型直接参与遗传风险的传递。
为了锁定最有可能通过 β 细胞介导风险的位点,研究人员将 GWAS 精细定位结果与细胞类型特异染色质开放区结合。最终筛选出三个位点: TOX 位点的 rs1947178 位于 β 细胞活跃的内含子调控元件; RASGRP1 位点的 rs55728265 落在启动子区域; DLK1/MEG3 位点的 rs3783355 则在细胞因子或 CVB4 刺激下与 DLK1 、 MEG3 启动子的染色质互作增强。序列功能预测显示,这些风险等位基因均可能改变所在调控元件的可及性和转录活性。
为验证这些预测,团队构建了 DLK1 -/- 、 RASGRP1 -/- 、 TOX -/- 、 DLK1 Δ 元件、 RASGRP1 Δ 元件及 rs3783355 A/A 同源型 hESC 系。所有细胞系均可正常形成内胚层,但 DLK1 、 RASGRP1 或 TOX 缺失显著降低了 β 细胞的分化效率,其中 DLK1 -/- 和 RASGRP1 -/- β 样细胞在基础及细胞因子刺激下的早期凋亡率明显升高,而 TOX 缺失主要影响分化,对凋亡影响不大。调控元件缺失的表型与基因缺失一致。携带 rs3783355 风险等位基因的细胞, DLK1 表达下降,分化受阻,凋亡率升高,进一步支持其致病作用。
机制分析发现, DLK1 缺失显著增加启动子区域的染色质开放性,提示直接的转录调控效应,并扰乱线粒体功能与氧化还原平衡; RASGRP1 缺失则主要在内含子和启动子区域降低开放性,重塑应激相关的转录网络。虽然两者在染色质变化方向上不同,但都激活了与氧化应激和炎症敏感性相关的通路,使 β 细胞在促炎环境下更易受损。令人鼓舞的是,抗氧化剂 N- 乙酰半胱氨酸( NAC )可部分恢复两种缺陷细胞的分化和存活,提示氧化应激是它们的共同致病环节。
综上所述,该研究整合单细胞多组学、 GWAS 精细定位和 hESC 功能验证,鉴定了三个直接作用于 β 细胞的 T1D 风险位点及其候选致病变异,揭示了这些变异通过影响 β 细胞分化与存活、增加氧化应激敏感性来促进疾病发展的机制。这一成果不仅补充了免疫中心论的不足,强调了 β 细胞内在防御的重要性,还为未来通过增强 β 细胞抗压能力的精准干预提供了新的思路。
原文链接:https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(25)00836-8
制版人:十一
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