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冷冻干燥机在冻干前，把需要冻干的产品分装，如果是水果蔬菜类的、把预处理好的直接装在冻干物料盘中，蒸发表面尽量大、厚度尽量薄些，亦或是玻瓶或安瓶，装量要均匀，然后装入冻干物料盘。
装入冻干机前，要先将冻干箱体空箱降温，然后将产品放入冻干箱内进行预冻，抽真空前需要根据冷凝器冷冻机的降温速度提前使冷凝器工作，抽真空时冷凝器应达到<-40℃左右的温度，待真空度达到预先设置的数值，即可对冻干箱内产品进行加热。
冷冻干燥机的整个升华干燥的时间约12-24小时左右，与产品的种类、形状大小、装载量、冻干曲线及机器的性能等都有关联。
冷冻干燥机的冻干曲线是在冻干过程中，把产品和板层的温度、冷凝器温度和真空度对照时间划成曲线。一般以温度为纵坐标，时间为横坐标。
冻干不同的产品采用不同的冻干曲线。同一产品使用不同的冻干曲线时，产品的质量也不相同，冻干曲线还与冻干机的性能有关。
不同的产品，不同的冻干机应用不同的冻干曲线。
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