干货实操+独家解密，CELL一作带你玩转时空组学

研究团队依托华大时空组学技术 Stereo-seq 与多种单细胞组学测序技术，首次创建了完整解码动物发育过程的多模态数据集，绘制出果蝇全发育周期的 3D 单细胞时空多组学图谱。这一里程碑式成果系统揭示了细胞类型分化的时空动态和关键调控网络，为发育生物学、发育缺陷及相关疾病研究奠定了全新分子基础。

时空组学技术持续攻坚，多篇顶刊见证突破

越来越多的顶刊成果，正在用事实证明——华大时空组学技术 Stereo-seq正在成为生命科学前沿突破的强劲引擎。为了进一步帮助大家了解并应用时空组学，8月6日14:00-15:30华大时空组学联合百奥智汇举行解密顶刊文章——时空组学驱动精准发现引擎直播课程，特邀南方科技大学副研究员胡琪楠、华大生命科学研究院生物信息副研究员张银、北京百奥智汇科技有限公司技术支持甄彩鑫，从研究、应用、实践等角度为大家全面解析时空组学。

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课程内容速览

报告一

▶ 分享主题：单细胞三维时空多组学解析果蝇组织发育的关键调控因子

▶ 分享嘉宾：南方科技大学副研究员胡琪楠

▶ 核心内容：

▪ 构建跨胚胎至蛹期的果蝇单细胞 3D 时空多组学图谱 Flysta3D‑v2，整合 Stereo‑seq、scRNA‑seq、scATAC‑seq，获得超 400 万单细胞分辨率连续分子图谱。

▪ 应用 Spateo 框架实现多模态数据配准、细胞命运轨迹重建和全胚胎三维测量，追踪神经、中肠等组织发育动态。

▪ 揭示中肠区域化建立时空模型，为组织稳态和再生研究提供新范式。

▪ 绘制中肠细胞亚型分化路径，发现铜细胞谱系特异性调控因子 exex，并通过功能验证证实其调控铜离子稳态。

▪ 发布交互式数据库和分析代码，为果蝇发育及跨物种研究提供系统化资源。

报告二

▶ 分享主题：时空组学技术揭示疾病发病机制

▶ 分享嘉宾：华大生命科学研究院生物信息副研究员张银

▶ 核心内容：

▪ 时空组学技术揭示乳腺癌脉管微环境

Stereo‑seq 技术解析 30 例乳腺癌与转移淋巴结，绘制高分辨率空间图谱，首次发现小静脉平滑肌细胞与 ACKR1⁺ 内皮细胞协同形成富趋化因子的微环境，关联免疫浸润和临床疗效。

▪ 时空组学技术揭示爆发性心肌炎机制

单核与空间转录组分析 CVB3 诱导小鼠 FM，揭示间皮细胞作为早期关键靶点，引发炎症级联。发现 Cd8⁺ T 细胞及 IFN‑γ / Spi1 轴是心肌细胞损伤关键路径，IVIG 治疗显著改善预后，提示潜在治疗靶点。

报告三

▶ 分享主题：理论×实践：解锁时空高分之道

▶ 分享嘉宾：北京百奥智汇科技有限公司技术支持甄彩鑫

▶ 核心内容：

▪ Stereo‑seq：500nm亚细胞级空间转录组，兼容新鲜冷冻和FFPE组织，芯片可定制，最大可支持13x13cm超大视野，满足多种场景的临床科研需求。

▪ Stereo-CITE：同时捕获mRNA+蛋白组，解锁更多维度信息，全面解析疾病发生发展机制。

▪ 项目经验分享：高质量实测数据分享，捕获基因数、检测灵敏度等性能全面提升，让科研探索快人一步。