网易首页 > 网易号 > 正文 申请入驻

逆行而上,Cell重磅:CRISPR激活文库筛出新受体!好的思路,值得分享!

0
分享至

文库筛选除了用于免疫检查点分子,也可以用于病毒受体的筛选。腺相关病毒(AAV)因其安全性、长期表达和组织靶向性等优势,已成为递送治疗基因的主流工具。但是,AAV病毒侵入细胞的关键受体并没有得到系统性地阐释。2025年7月,Cell期刊发表题为An alternate receptor for adeno-associated viruses的研究论文。这篇文章使用CRISPR激活文库展开了全基因组层面的探究。

采用全基因组CRISPR激活文库(SAM系统),突破传统敲除文库的局限。传统敲除文库难以发现低表达或功能冗余的受体(如AAVR缺失时无代偿途径);激活文库通过强制过表达20,000+基因,灵敏识别出潜在受体CPD(AAVR2)。筛选策略上,AAVR缺陷细胞(eHAP AAVR KO)感染AAV8-eGFP,通过GFP阳性细胞分选和MAGeCK算法分析富集的sgRNA,锁定CPD基因,并将其命名为AAVR2。该研究不仅解析了AAVR2的分子作用机制,还开发出基于CPD的增强型基因治疗策略。

研究团队构建了AAVR基因敲除的eHAP细胞模型(eHAP AAVR KO),这些细胞可抵抗AAV8病毒转导。他们使用全基因组sgRNA文库(靶向>20,000个人类基因的启动子区)的CRISPR协同激活调控系统(SAM);通过dCas9-VP64和MS2-p65-HSF1组分实现靶基因的转录激活;用AAV8-eGFP病毒感染筛选池,分选GFP阳性细胞群体;高通量测序分析富集的sgRNA及其靶基因。

经过多轮筛选和生物信息学分析(MAGeCK算法),羧肽酶D(CPD)基因的靶向sgRNA在GFP阳性细胞中显著富集:6条靶向CPD的sgRNA中有3条显著富集(FDR<0.05);这些sgRNA均靠近CPD转录起始位点(TSS);单sgRNA验证实验证实:激活CPD表达可使AAVR KO细胞的AAV8转导效率恢复50倍以上;研究者将这一新受体正式命名为AAVR2

体外功能验证。在HuH7(人肝癌细胞)和Hepa1-6(小鼠肝癌细胞)中过表达AAVR2,可使AAV8转导效率提升。更重要的是,AAV11和AAV12完全依赖AAVR2,且独立于已知的AAVR通路。基因敲除反证:CRISPR敲除AAVR2可完全阻断AAV12转导,但不影响AAV8;siRNA敲低AAVR2同样选择性抑制AAV12转导。

体内功能验证。研究者构建了AAVR2基因敲除小鼠模型,发现Aavr2纯合敲除(-/-)胚胎致死,显示其在发育中的关键作用;杂合敲除(+/-)小鼠肝脏AAVR2蛋白表达降低50%;注射AAV11后,肝脏转导效率在杂合小鼠中降低,肌肉中转导效率降低。这一结果首次在动物模型中证实AAVR2是体内AAV转导的必需因子

常规的CRISPR敲除文库筛选在寻找"代偿性受体"时存在局限——当AAVR缺失后,若没有其他受体能替代其功能,筛选将没有结果;CRISPR激活文库筛选通过"功能获得性"策略,强制过表达所有候选基因,能灵敏地捕捉到那些低表达但具备潜在代偿能力的受体分子。

参考资料,仅用于交流:

特别声明:以上内容(如有图片或视频亦包括在内)为自媒体平台“网易号”用户上传并发布,本平台仅提供信息存储服务。

Notice: The content above (including the pictures and videos if any) is uploaded and posted by a user of NetEase Hao, which is a social media platform and only provides information storage services.

相关推荐
热点推荐
中央明确养老金改革方向,2026年公平养老迈出关键一步

中央明确养老金改革方向,2026年公平养老迈出关键一步

轻拂两袖风尘终
2026-01-25 15:33:50
紫金矿业:拟280亿元收购联合黄金100%股权

紫金矿业:拟280亿元收购联合黄金100%股权

每日经济新闻
2026-01-26 21:10:02
金隅集团裁员1.32万人

金隅集团裁员1.32万人

地产微资讯
2026-01-26 21:29:58
世体:拉莫斯与塞维就收购达成协议,未来几天将签署意向书

世体:拉莫斯与塞维就收购达成协议,未来几天将签署意向书

懂球帝
2026-01-26 18:34:39
闹大了!因爆料林高远从国家队退役,前国手郝帅遭遇严重网暴

闹大了!因爆料林高远从国家队退役,前国手郝帅遭遇严重网暴

凤幻洋
2026-01-26 15:54:09
清华大学教授痛批:现在中国大多数人都沦为半人,半人时代横行

清华大学教授痛批:现在中国大多数人都沦为半人,半人时代横行

谈史论天地
2026-01-26 13:40:03
以一己之力负债2.4万亿,许家印靠山是谁?说出来你可能不信

以一己之力负债2.4万亿,许家印靠山是谁?说出来你可能不信

历史伟人录
2025-11-28 13:58:56
李湘和老燕子夫妻的“H南帮”!

李湘和老燕子夫妻的“H南帮”!

八卦疯叔
2026-01-26 11:45:10
国航、东航、南航、山航、厦航、上航等,集体公告

国航、东航、南航、山航、厦航、上航等,集体公告

台州交通广播
2026-01-27 01:03:43
女记者退脏衣后续:正脸曝光已社死,单位撇清关系,山东文旅沦陷

女记者退脏衣后续:正脸曝光已社死,单位撇清关系,山东文旅沦陷

好贤观史记
2026-01-26 11:29:58
法国第一美人消失25年,被救时竟已沦为46斤人畜,亲妈在阁楼里藏了整整25年的秘密终于曝光了

法国第一美人消失25年,被救时竟已沦为46斤人畜,亲妈在阁楼里藏了整整25年的秘密终于曝光了

历史回忆室
2026-01-02 19:54:11
黄金与白银在刷新历史高点后大幅回调

黄金与白银在刷新历史高点后大幅回调

财联社
2026-01-27 05:24:04
中国顾客在法国餐厅用筷子吃披萨,被人拍下传网上,引网友讨论

中国顾客在法国餐厅用筷子吃披萨,被人拍下传网上,引网友讨论

我心纵横天地间
2026-01-24 23:32:50
宗庆后母亲去世,娃哈哈百亿遗产案仍悬

宗庆后母亲去世,娃哈哈百亿遗产案仍悬

蓝鲨消费
2026-01-26 17:49:17
外媒:多架巴空军战略运输机现身成都,歼-35已经开始交货?

外媒:多架巴空军战略运输机现身成都,歼-35已经开始交货?

头条爆料007
2026-01-26 19:43:57
主打一个相信,恩佐在埃斯特旺破门前5秒就提前开始庆祝了

主打一个相信,恩佐在埃斯特旺破门前5秒就提前开始庆祝了

懂球帝
2026-01-26 17:43:28
博主:26岁中国香港代表队球员巴拉克将前往内地联赛踢球

博主:26岁中国香港代表队球员巴拉克将前往内地联赛踢球

懂球帝
2026-01-26 16:10:04
不查不知道一查吓一跳,坐拥北京60亩马场的于谦,私下到底有多壕

不查不知道一查吓一跳,坐拥北京60亩马场的于谦,私下到底有多壕

小熊侃史
2026-01-20 07:40:05
来了,曼联!曝9500万“顶星”空降加盟红魔!两员大将遭火速放逐

来了,曼联!曝9500万“顶星”空降加盟红魔!两员大将遭火速放逐

头狼追球
2026-01-26 11:37:29
美方扶持的4位中国富豪开始露头了:在华疯狂捞金,扭头捐给美国

美方扶持的4位中国富豪开始露头了:在华疯狂捞金,扭头捐给美国

米果说识
2026-01-26 22:16:39
2026-01-27 07:28:49
芒果师兄 incentive-icons
芒果师兄
一起学习,共同成长,让生信助力科研。
487文章数 67关注度
往期回顾 全部

科技要闻

印奇再上牌桌,阶跃融资50亿

头条要闻

女子被丈夫和闺蜜背叛一夜白头:听到儿子叫第三者妈妈

头条要闻

女子被丈夫和闺蜜背叛一夜白头:听到儿子叫第三者妈妈

体育要闻

叛逆的大公子,要砸了贝克汉姆这块招牌

娱乐要闻

张雨绮被抵制成功!辽视春晚已将她除名

财经要闻

从美式斩杀线看中国社会的制度韧性构建

汽车要闻

宾利第四台Batur敞篷版发布 解锁四项定制创新

态度原创

游戏
旅游
本地
数码
军事航空

猎魂世界:先遣服1.5版本新内容汇总!这第7魂环真是够那个了!

旅游要闻

边陲小村吃上旅游饭(大国小村)

本地新闻

云游中国|格尔木的四季朋友圈,张张值得你点赞

数码要闻

1399元 小米首款儿童手表开售:秒级连续定位、支持水域提醒

军事要闻

委代总统称遭美威胁:马杜罗已死

无障碍浏览 进入关怀版