浙江
近期 Nature Medicine、Genome Biology 等期刊在微生物领域连发重磅研究。
▶ 来自斯坦福大学的研究团队通过连续血糖监测、代谢生理检测以及代谢组学、脂质组学、蛋白质组学和微生物组学等多维度多组学方法，发现与餐后血糖反应（PPGR）及代谢表型相关的分子标志物，揭示了个体对多种标准碳水化合物膳食 PPGR 的差异及其背后的代谢生理机制[1]。
▶周宏伟教授、何肖龙教授团队通过宏基因组、代谢等多组学联合分析发现，肝硬化患者肠道中
Ruminococcus gnavus产生的苯乙胺（PEA）在脑中积累，导致肝性脑病。该过程依赖细菌苯丙氨酸脱羧酶（PDC）及宿主单胺氧化酶 B（MAO-B）活性下降。靶向 PDC 或 PEA 可缓解神经症状，提示其为潜在治疗靶点 [2] 。
▶华大生命科学研究院基于华大自主测序平台，开展宏基因组高通量深度测序，对大规模健康年轻人群的鼻腔微生物组进行研究，构建了迄今为止最为全面的鼻腔微生物群落目录，揭示了不同性别的鼻腔微生物差异，并首次系统地评估鼻腔微生物这条「防线」的强度，为开发新的预防和治疗策略提供了重要线索[3]。
如今发文越来越卷，如何将微生物研究与宏基因组测序与代谢等其他组学巧妙结合，以此碰撞出新的火花？「微生物+组学」的研究思路是什么？有哪些常见的发文套路？
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精彩内容抢先看：
讲师一：高杰 广州医科大学附属第二医院消化科 教授 博士生导师
主题：消化系统疾病宏基因功能酶挖掘
1. 聚焦肠道菌群功能酶在克罗恩病、肝性脑病中的突破性发现及临床转化；
2. 利用宏基因组、细菌培养组、代谢组等多组学分析发现肠道菌群 DL-内肽酶是产生 NOD2 配体的关键酶。体内实验证明，低活性的 DL-内肽酶会增加小鼠对肠炎的易感性。直接补充 DL-内肽酶、产 DL-内肽酶益生菌或小分子 NOD2 激活剂，能通过激活 NOD2 信号缓解小鼠肠炎。深入阐述菌源 DL-内肽酶通过 NOD2 信号缓解克罗恩病具体机制；
3. 通过临床队列研究与宏基因组数据验证发现肝硬化病人中单胺合成能力显著提升并锁定关键物种
Ruminococcus gnavus及其关键酶 PDC，之后结合动物实验验证、多组学分析等方法，证实了菌源苯丙氨酸脱羧酶（PDC）是肝性脑病关键病因。
讲师二：张喆 深圳华大生命科学研究院 生物信息副研究员
主题：宏基因组测序鼻腔微生物组群落提升疾病预测与生物标志物发现
1. 通过大规模宏基因组测序分析，揭示鼻腔微生物组性别差异；
2. 构建了全面的人鼻腔细菌 MAGs 目录，并整合真菌群落进行分析；
3. 在分类学和功能水平上系统评估性别差异，发现鼻腔微生物组在不同性别之间存在的广泛性别特异性特征；
4. 鼻腔微生物群落关键物种的性别依赖性遗传进化特征，表明遗传进化力量在塑造性别特异性方面发挥了重要作用。
参考文献
[1].Wu Y, Ehlert B, Metwally AA, et al. Individual variations in glycemic responses to carbohydrates and underlying metabolic physiology.
Nature Medicine. 2025.
[2]He X, Hu M, Xu Y, et al. The gut–brain axis underlying hepatic encephalopathy in liver cirrhosis.
Nature Medicine. 2025.
[3]Ju Y, Zhang Z, et al. Integrated large-scale metagenome assembly and multi-kingdom network analyses identify sex differences in the human nasal microbiome.
Genome Biol. 2024.
内容策划：刘青、潘成
内容审核：朱卿
题图来源：图虫创意
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