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Nature重磅:首次从木乃伊中提取完整人类基因组序列

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撰文丨王聪

编辑丨王多鱼

排版丨水成文

古埃及文明曾繁荣了数千年,在其鼎盛时期,古埃及建造了众多叹为观止的金字塔,此外,他们还曾流行制作木乃伊,其中,许多数千年前的木乃伊保存至今,科学家们一直希望从中提取古 DNA。然而,木乃伊的制作过程以及炎热的气候条件加速了 DNA 分解,导致其中的 DNA 保存状况不佳。

直到 1985 年, 进化遗传学家Svante Pääbo(2022 年诺奖得主)在Nature期刊发表论文【1】,首次从一个 2400 年前的古埃及儿童木乃伊中提取到了数千个 DNA 碱基对(但这些提取到的 DNA 可能存在现代人类 DNA 的污染)。2017 年,图宾根大学和马克斯·普朗克研究所的研究人员从三个 2000-3600 年前的古埃及木乃伊中提取了有限的 DNA【2】。

2025 年 7 月 2 日,利物浦约翰摩尔斯大学、弗朗西斯·克里克研究所的研究人员在Nature期刊发表了题为:Whole-genome ancestry of an Old Kingdom Egyptian 的研究论文【3】。

该研究从一个距今大约 4800 年的生活在最早期金字塔建造时期的木乃伊的牙齿中成功提取了完整人类基因组,这也是首个古埃及人类的完整基因组序列。基因组分析显示,这一木乃伊遗骸显示出与北非新石器时代的祖先以及美索不达米亚(现在的中东部分地区)人群相似的血统。

该研究分析了一个发现于 1902 年的古埃及遗骸, 放射性碳测年显示,其生活在公元前 2855-公元前 2570 年左右, 这一时期与古埃及的早王朝时期末尾以及古王国时期起始相重叠,此时古埃及尚未开始广泛的木乃伊制作。遗骸被埋葬于一个岩石墓穴的密封的陶罐中,这表明其社会地位较高(但尚未达到精英统治阶层)。

研究团队从遗骸中提取了 7 组 DNA 样本,其中 2 组保存足够完好,可以进行基因组测序,并成功构建了完整的基因组序列,研究团队将测序结果 与 3233 个现代个体和 805 个古代个体的基因组数据库进行对比分析, 通过遗传模拟,研究团队将这个遗骸的基因组的绝大部分追溯到大约 6000 年前的北非新石器时代的祖先。此外,该基因组的约 20% 与东部新月沃土地区(即 美索不达米亚,现在的伊拉克、土耳其、叙利亚、伊朗等中东地区 ) 的人最为接近,这里是 苏美尔文明的发源地,也是 最早的文字系统之一的诞生地。

这个遗骸属于一名男性(有 Y 染色体), 研究团队对遗骸的进一步分析揭示了更多关于他生平的细节,他存在着 关节炎和骨质疏松症的迹象 , 年龄在 44-64 岁之间,在当时属于高龄。此外,骨骼磨损迹象表明他一生从事体力劳动,长时间弯腰驼背地坐在硬表面上,在结合同时期墓葬中的发现,研究团队推测他可能是一名陶工 ,这也符合他具有较高的 社会地位,但尚未达到精英统治阶层。

总的来说,这一发现 推动了我们对古王国时期 ( 公元前2686-前2125年 ) 埃及人的理解,该研究还揭示了可能有利于 DNA 保存的埋葬条件,为今后的发现铺平了道路。

论文链接

1. https://www.nature.com/articles/314644a0

2. https://www.nature.com/articles/ncomms15694

3. https://www.nature.com/articles/s41586-025-09195-5

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