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GraphPad Prism 五大分析模型操作指南:从入门到精通

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图片来源:小编自己的

接上篇,目前很多同学仅使用其基础统计功能(如 t 检验、ANOVA),而忽略了其高级统计模型(如非线性回归、生存分析、多变量分析等)。本篇将详细介绍如何在 GraphPad Prism 中应用不同的高级统计模型,包括:

非线性回归(Nonlinear Regression)

生存分析(Survival Analysis)

多变量分析(Multivariate Analysis)

混合效应模型(Mixed Effects Models)

主成分分析(PCA)

快来学!

1

非线性回归(Nonlinear Regression)

适用场景:拟合剂量-反应曲线、酶动力学(Michaelis-Menten)、生长曲线(Gompertz)、受体结合(Sigmoidal dose-response)等。

Step 1:输入数据:

在数据表中输入 X(如药物浓度)和 Y(如反应值)。

Step 2:选择模型:

点击Analyze → Nonlinear regression (curve fit)

从预设模型中选择(如「Dose-response - Inhibition」「Kinetics - Michaelis-Menten」)或自定义方程(User-defined equation

Step 3:调整参数:

根据研究目的增加 IC50 或 EC50 的设置

2

生存分析(Survival Analysis)

适用场景:比较两组或多组的生存曲线(如临床试验中的生存率、动物实验中的存活时间)。

Step 1:输入数据:

列 1:时间(如天数)

列 2:事件(1 = 死亡/事件发生,0 = 删失)

分组列(如对照组 vs 处理组)

Step 2:选择分析:

Analyze → Survival analyses → Survival curve

Step 3:设置参数:

选择比较方法(Log-rank test、Gehan-Breslow-Wilcoxon test)

Step 4:

根据分析结果标注相关参数:

Hazard Ratio(HR)(风险比)

P 值(组间差异显著性)

3

多变量分析(Multivariate Analysis)

适用场景:分析多个变量对结果的影响(如多元线性回归、逻辑回归)。

Step 1:输入数据:

因变量(X)

多个自变量(Y1, Y2, ...)

Step 2:选择分析:

Analyze → Multiple regression(线性回归)

Analyze → Logistic regression(逻辑回归)

Step 3:

根据研究需要设置参数,选择相应的图表:

4

混合效应模型(Mixed Effects Models)

适用场景:重复测量数据、嵌套数据(如不同时间点的测量、同一患者的多次观测)。

Step 1: 输入数据:

点击Graphs → New Graph →选择「Grouped」「XY」

X轴:时间(Time)或分组变量(Treatment)。

Y 轴:因变量(Response)。

Step 2:选择分析:

1

打开数据表,点击Analyze → Mixed Models → Mixed Effects Model

2

选择因变量(Response)和固定效应(Fixed Effects,如 Treatment、Time)。

3

指定随机效应(Random Effects,如Subject ID)。

Step 3:设置参数:

定义固定效应和随机效应

选择协方差结构(如 AR1、Compound Symmetry)

5

主成分分析(PCA)

适用场景:降维、识别数据模式(如基因表达、代谢组学数据)。

Step 1:输入数据:

Step 2:选择分析:

Analyze → Principal Component Analysis (PCA)

Step 3:设置参数:

Options 中设置数据的标准化方法和主成分选择方法。这里标准化方法默认为 Z-score 标准化

下期预告:

将从宏录制、脚本编写到批量处理,手把手教你成为 GraphPad 高效能用户。

关于 GraphPad 的使用操作,还有哪些想要了解的,可以留言,我来写~你来学~

题图来源:自制

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