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专访镁伽科技:AI for Science 时代来临,需要下一代数据基建

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如果要投出2024年度科技热词,AI for Science绝对能当选。

连续包揽诺贝尔物理学奖和化学奖,证明了AI 在各个领域的巨大潜力。

这昭示着科学研究方法的一次革命,数据驱动的科研越来越受到重视。但在生命科学领域,由于缺乏高质量的数据,AI for Science有明显的局限性。

如何实现这一目标,镁伽有自己的思考。

“就像自动驾驶只会在电动汽车上出现,AI+生命科学也必然意味着底层架构的重塑。”镁伽科技创始人兼首席执行官黄瑜清表示

究其原因,是因为当下生命科学实验室的设备和耗材,绝大多数仍是为手工操作而设计,并没有大规模累积数据的能力。

今年9月,镁伽鲲鹏实验室3.0正式发布,可以看作是对 AI for Science 这一范式转变的回应。

镁伽将镁伽鲲鹏实验室定义为“生命科学行业的数据工厂”,凭借智能自动化技术,镁伽鲲鹏实验室不仅有大规模生产数据的能力,还实现了数据治理与模型训练。

如同汽车从内燃机驱动转向电机驱动一样,这标志着生命科学从手工转向自动化,底层架构设计的转变也为AI大脑预留了足够的空间。

镁伽鲲鹏实验室的落地,也让镁伽在生命科学产业走向了一个新的方向,区别于以往的单个模块化自动化仪器,积极拓展下游应用和服务。

近日,智药局与镁伽科技创始人兼首席执行官黄瑜清联合创始人兼首席运营官张琰,以及首席科学家方攀峰博士聊了聊,他们深入阐述了镁伽在生命科学智能化的突破,以及镁伽鲲鹏实验室的能力与规划。

从左至右:镁伽科技首席科学家方攀峰博士、镁伽科技创始人兼首席执行官黄瑜清、镁伽科技联合创始人兼首席运营官张琰

历时5年打磨

早在2019年,黄瑜清就提出要建设超级实验室的目标,彼时镁伽还只是100人左右的团队。

黄瑜清回忆道:“那个时候我们刚刚调整公司战略,从研发机器人本体转型到智能实验室整体解决方案,当时我们手里的武器只有机器人技术,业内很少有人相信镁伽的实验室能成功。”

公司转型的背后,不仅来自生命科学实验室场景的特殊性,还有镁伽对生命科学行业自动化的业务理解。

不同于汽车制造、3C等非常标准化的生产需求,几百年来生命科学领域自动化水平不高,主要源于实验室操作过于复杂,实验流程又过于个性化。

这也导致如果用做标准化产品的思路打入实验室,客户会有不断的新需求产生。面对生命科学不断出现的定制化需求,镁伽觉得有必要走在客户的前面。

于是,镁伽果断放弃了死磕标准化自动化设备,转而将仪器进行自动化整合和改造,提供实验室整套的解决方案。

而疫情期间生命科学产业催生出大量自动化需求,也让镁伽积累了足够深的行业knowhow,帮助公司快速地实现产品迭代和升级。

2021年,通用型智能自动化生物实验室-镁伽鲲鹏实验室正式落地。这不仅意味着镁伽拥有构建生命科学平台的能力,也能为高校和企业开放这些能力,推动行业进步。

图:镁伽鲲鹏实验室3.0—全自动细胞实验平台

实际上,镁伽鲲鹏实验室不仅解决了智能实验室建得起的问题,还解决了用得起的问题。

除了头部外,很少有公司能够引进一整套智能实验设备,开机后更是一次自动化药物筛查就是超过200万的成本,这中间很多都是不必要的试剂损耗。

镁伽鲲鹏实验室不仅能避免前期成本投入,通过精准控制技术,镁伽的分液设备能够精准到微升甚至钠升级,极大的降低实验成本。

镁伽科技联合创始人兼首席运营官张琰形象地描述了实验室从1.0到3.0的区别。

他表示,镁伽鲲鹏实验室1.0像一间展示中心,展现出镁伽从软硬件一体出发,有构建大型智能实验室的能力。

2.0阶段,镁伽鲲鹏实验室则更像是一个练武场,公司组建了经验丰富的科学家团队,通过鲲鹏实验室开发自动化应用,以实战的角度来指导实验室的建设和运维。

到了3.0阶段,镁伽鲲鹏实验室又一次大幅度升级为生命科学的数据工厂,在实验通量提升40倍,数据生成能力提升100倍的同时,将试剂损耗降低70%。

如今,镁伽在生命科学领域已经形成了一支强大的交叉型研究队伍,包括100位生物和医药人才,和300多位工程技术骨干,打破传统学科壁垒,实现了技术与知识的深度融合。

据透露,随着技术、团队和市场的不断完善,镁伽鲲鹏实验室已经服务了多家医药企业、CRO和高校研究院,多条业务线实现高速增长。

一个老生常谈的论调,无论是AI生命科学还是AI制药,都面临着缺乏高质量数据的阻碍。

实际上,这其中不仅是数据规模的问题,更重要的一步是数据治理。

不谈数据治理,就没有优秀的AI模型,得到的也只能是“垃圾进,垃圾出”诺奖成果蛋白质结构预测模型AlphaFold2前期就耗费了大量精力对数据进行预处理。

在镁伽看来,数据治理不仅是数据清洗、转换、合并等能力,本质上其实是个软硬件协同问题。

尤其生命科学实验室设备通常来自不同品牌,接口也不一样,因此数据格式本身就存在大量的噪音。这些原始数据无法喂给模型,甚至不同设备之间数据的相关性也是问题。

“生命科学实验室需要一个强大的中台,它既能灵活地支持无穷多的科学应用,同时又要稳定可靠地管理好无穷多的设备组合,保证它们7x24小时的稳定运行。”

为此,镁伽打造了一个名为Megalnfomics的数智化平台,它包含了中央调度软件、数据集成软件、信息化管理软件、生信分析软件等,这些软件保证了数据的有效收集、结构化、分析和追溯,当然还有最重要的安全性。

图:Megalnfomics数智化平台

镁伽鲲鹏实验室3.0还首度引入了数字孪生软件,它能在虚拟状态1:1地建设实验室,在不消耗实际资源的情况下,对实验方案进行预演和优化,提前排除潜在风险。

而这背后一切都离不开镁伽过往部署大型实验室的经验。

换句话说,镁伽鲲鹏实验室这家生命科学的数据工厂,本质上不是输出自动化能力,而是大规模高质量生命科学数据的能力。

找到了这样的行业痛点,过去三年间镁伽鲲鹏实验室的业务大幅度增长,尤其是面对人工无法解析的场景。

例如宏基因组测序方面,在上千人的样本量面前,镁伽经过结构化的数据能够真正做到“开箱即用”。

“我们的感受非常明显,每当接触有大队列需求的客户,他们的反馈是市面上终于有人能干这个事情了。”张琰表示,“以往面对这样大批次高质量的数据需求,合作伙伴只能通过传统CRO来完成,进展非常缓慢。”

镁伽科技首席科学家方攀峰补充道:“甚至得到大规模样本处理和数据的结果后,还衍生出我们意想不到的新需求,这些都是镁伽鲲鹏实验室区别于传统CRO的特别之处。”

如今,镁伽鲲鹏实验室平台已经拓展到细胞基因编辑、高通量药物筛选、类器官自动化、中医药研究发现、合成生物学等领域的研究。

在这些领域,镁伽已经成功打通“AI+干湿实验”闭环的能力,涉及到从设计到构建到测试,拿到实验结果后再把数据清洗整理后喂给大模型训练,极大缩短了如抗体设计等领域的研发时间。

此外,镁伽也在根据业务模式进行全新的探索,将生产数据的能力沉淀为有形的资产。

张琰表示:“尽管实验室当前定位依然是生命科学的高质量数据生成工厂,但未来数据的归属权问题,与合作伙伴都可以协商,提供多个可选择方案。”

当前,中国生命科学领域正在经历一次重大调整。尤其在生物医药,投资人的热情正在恢复消退,不少公司融资更加困难,研发预算也更加紧张。

面对不确定的市场环境,黄瑜清给出的答案是:抓住快速增长的新兴市场的机会。

正如镁伽曾经抓住了核酸自动化检测、分子诊断等风口,尽管不少业务已经萎缩,但在国产替代以及出海等新背景下,仍然有大量细分市场等待挖掘。

“根据我们的判断,实验室国产替代和自主可控的逻辑下,自动化和人工智能的需求仍然有较高的需求,同时我们也在不断开拓海外市场。”黄瑜清解释道。

多年来镁伽引以为傲的是,他们一直是行业大客户的开拓者,早期融资时投资人甚至看不懂PPT,黄瑜清首先要花一个小时时间解释什么叫生命科学,然后再接着讲什么叫生命科学自动化,再证明生命科学自动化不是伪命题而是真需求。

同样,镁伽作为一家提供先进生产力工具的公司,在生命科学复杂场景下积累的大量经验,也正在帮助镁伽快速进入集成电路、能源化工等领域。

无论市场冷暖如何变化,镁伽始终坚持创业时的初心。

那就是未来生命科学实验室一定会从手工转向智能化,许多底层工具都有重做一遍的机会,这个穿越周期的判断也是镁伽不断投入研发的动力。

成立8年来,镁伽从当初3人的小团队拓展为上千人的队伍,累计研发投入超12亿元。

尽管有先发优势,但迎接来自国内乃至海外同行的竞争,黄瑜清的回答也显得颇有底气。

“中国有世界上强大的供应链体系,例如细胞领域最常见的实验流程,通过自动化设备再加上机械臂等技术,我们只花了6个月左右就能执行实验,但要让这样一套系统能够7 × 24 小时的稳定运转,我们耗费了两年多的心血。”

这背后需要解决非常多的工程学问题,以及对于生命科学实验流程的深度认知和梳理。

镁伽曾对智能实验室技术发展进行一次详细的划分:

L1代表基础的自动化硬件,实现实验室单点自动化,而越往上则越需要数字化和AI软件的参与,到了L5阶段,AI能够自主进行实验室设计与运营,完全解放科学家的双手。

图:镁伽对智能实验室技术发展的定义

如果说智能实验室上半场是自动化仪器与实验调度,那么下半场则是智能化。换句话说,这也是镁伽的真正价值所在——软硬件技术的深耕和完善

同时,镁伽也紧紧布局自身产业上下游,通过合作、孵化和投资等方式做大朋友圈,加速智能实验室的进程。

产业链上游,镁伽投向了自动化关键零件生产商;产业链下游,镁伽则持续孵化投资了多家AI+生命科学应用公司,包括小分子智能化合成企业镁睿化学,以及大分子设计和制造公司智源深澜

无论是诺贝尔奖奋力拥抱AI,还是国家《新一代人工智能发展规划》,都让包括镁伽等一批头部AI for Science公司被持续关注。

黄瑜清表示,在生命科学领域有太多难题还有待解开,有的罕见病和神经退行性疾病,人们连发病机制都还没弄清楚。

“我相信当研发效率提升后,在我有生之年这些疾病一定会看到成果。”他坚定地说。

—The End—

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