北京
本研究旨在调查2022年陕西省城固县一起霍乱疫情的源头。通过对病例进行个案调查、现场环境的卫生学调查，以及收集当地气温和降水资料，采集了病例、同餐人员及同期腹泻患者的粪便或肛拭子样本，还有剩余食品、环境水体、水产品样本进行霍乱弧菌核酸检测及分离培养。
方法
对病例进行详细的个案调查，了解临床症状、体征及流行病学史。
对患者居住地进行现场卫生学调查，采集可疑来源食物、饮用水和水产品鱼类样本。
采集的样本进行霍乱弧菌核酸检测及分离培养。
对分离到的霍乱弧菌进行血清学和质谱鉴定，进行药敏试验。
提取菌株DNA进行毒力基因检测，利用二代测序平台进行全基因组测序。
使用测序数据进行毒力基因及耐药基因预测，与既往分离的霍乱弧菌及pubMLST下载的基因组序列进行分析。
从病例和带菌者中分离到的霍乱弧菌为O139群，携带ctxAB毒力基因。
药物敏感性测试显示对多种药物敏感，但对氯霉素、多粘菌素类、四环素类、氨基糖苷类有抗药性。
全基因组测序分析结果显示，菌株为大流行菌克隆株序列型（ST）69型，与陕西省既往霍乱菌株无关联。
在水体样本中检出霍乱弧菌hlyA和O139群基因核酸阳性，但ctxAB毒力基因阴性。
本起疫情由霍乱弧菌O139群引起，可能与水产品污染有关。
高温、干旱等因素可能是霍乱发生的原因之一。
建议在流行季节加强对腹泻病例、水体及水产品的监测，及时采取措施，避免疫情扩散。
文献原文
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