国务院哪个部门配备的副部级干部最多？

国务院共有26个组成部门，国务院组成部门（不包括国防部）的副部级干部包括副部长（副主任、副行长、副审计长）、明确为副部级的党组成员（党委委员）等，其中分管日常工作的副部长明确为正部级；国务院部分组成部门设置党委委员、政治部主任职务；国务院部分组成部门的党组成员（党委委员）、副部长（副主任、副行长）兼任部委管理的国家局的局长（应急管理部政治部主任兼任国家消防救援局政治委员）。

此外，在国务院部分组成部门管理或代管的有关单位、直属单位、直属高校、派出机构、驻港澳机构、驻外机构中，配备若干名副部级干部。

国务院组成部门（不包括国防部）的副部级干部大致如下:

(一)外交部的副部级干部包括有关领导成员，中国驻美国、俄罗斯、英国、法国、德国、日本、印度、巴西、南非、埃及等国家的大使，驻联合国（纽约总部）、联合国（日内瓦办事处）、欧盟、世贸组织等国家组织的代表，驻香港、澳门公署的特派员等。

(二)国家发改委的副部级干部包括有关领导成员等。

(三)教育部的副部级干部包括有关领导成员，直属高校中的副部级干部等；教育部的直属高校共有75所，其中北京大学、清华大学、中国人民大学、北京师范大学、中国农业大学等26所高校的党委书记、校长是副部级干部，也就是说教育部的直属高校中共有52名副部级干部。

(四)科技部的副部级干部包括有关领导成员（科技日报社社长由科技部党组成员兼任），国家自然科学基金委员会主任等。

(五)工信部的副部级干部包括有关领导成员，北京航空航天大学、北京理工大学、哈尔滨工业大学、西北工业大学等部直属高校的党委书记、校长等。

(六)国家民委的副部级干部包括有关领导成员等。

(七)公安部的副部级干部包括有关领导成员等。

(八)国家安全部的副部级干部包括有关领导成员等。

(九)民政部的副部级干部包括有关领导成员，以及中国老龄协会的负责人等。

(十)司法部的副部级干部包括有关领导成员等。

(十一)财政部的副部级干部包括有关领导成员等。

(十二)人社部的副部级干部包括有关领导成员等。

(十三)自然资源部的副部级干部包括有关领导成员等（中国地质调查局的党组书记、局长由自然资源部党组成员兼任）。

(十四)生态环境部的副部级干部包括有关领导成员等。

(十五)住建部的副部级干部包括有关领导成员等。

(十六)交通运输部的副部级干部包括有关领导成员等。

(十七)水利部的副部级干部包括有关领导成员，长江水利委员会、黄河水利委员会的主任、党组书记等。

(十八)农业农村部副部级干部包括有关领导成员等（中国农业科学院院长由农业农村部党组成员兼任，中国农业科学院院长、党组书记均是副部级干部）。

(十九)商务部副部级干部包括有关领导成员等。

(二十)文旅部的副部级干部包括有关领导成员等（文旅部党组成员、故宫博物院院长，中国国家博物馆馆长均是副部级干部）。

(二十一)国家卫健委的副部级干部包括有关领导成员等。

(二十二)退役军人事务部的副部级干部包括有关领导成员等。

(二十三)应急管理部的副部级干部包括有关领导成员等（中国地震局的局长、党组书记由应急管理部党委委员兼任）。

(二十四)中国人民银行的副部级干部包括有关领导成员等。

(二十五)审计署的副部级干部包括有关领导成员等。

综上所述，在国务院组成部门中，教育部（包括部机关、直属高校）配备的副部级干部最多。