美国科学家基于p72序列对非洲猪瘟基因型重新评估：25种基因型减少到仅6种基因型

美国农业部农业研究局（USDA-ARS）宣布，研究人员已将非洲猪瘟（ASF）病毒株的数量从25种重新分类为仅有6种独特基因型。

研究小组表示，大多数基于p72序列的基因型在最初创建时，既没有根据任何特定的方法标准进行鉴定，也没有与现有的非洲猪瘟病毒基因型进行正确比较。“根据我们对p72蛋白序列的分析，我们建议将当前仅基于p72序列创建的25种基因型减少到6种。为了帮助区分新旧基因型分类系统，我们建议用阿拉伯数字（1、2、8、9、15 和 23）代替以前使用的罗马数字。”

这项科学创新可能有助于重新定义全球非洲猪瘟研究人员对非洲猪瘟病毒分离株的分类方式，并可能使科学家更容易开发出与全球非洲猪瘟流行地区流行的不同毒株相匹配的疫苗。

ARS 高级科学家Douglas Gladue表示：“此前，全球范围内已鉴定出25种不同的（非洲猪瘟）病毒基因型。我们的研究团队最近重新评估了所有公开的病毒DNA序列，发现最初被确定为新型的大多数基因型（基因组成）并未被正确鉴定，也没有与现有的非洲猪瘟基因型进行比较。”

他补充说：“根据这项分析，实际上，独特的基因型比非洲猪瘟研究界认为的要少，这意味着影响全球的非洲猪瘟病毒的多样性较低。这一信息很重要，因为它可能会减少以前认为用于预防所有非洲猪瘟基因型所需的疫苗数量。”

病毒的准确分类对于流行病学调查和制定具有成本效益的对策至关重要，包括为非洲猪瘟的独特毒株设计疫苗。

这项大规模工作中， ARS研究人员重新分析了全球非洲猪瘟病毒实验室的12,000多种历史和当前病毒分离株。这项工作是基于SciNet的计算能力实现的，SciNet是ARS用于解决农业大数据问题的超级计算机集群。

尽管非洲猪瘟病毒给全球养猪业造成了巨大的经济损失，但美国尚未暴发疫情。传染性极强的非洲猪瘟病毒于2007年从非洲传播到格鲁吉亚，此后席卷欧洲、多米尼加共和国和亚洲，并于2023年初到达南非。该病毒无法从猪传播给人类。

本月的《Viruses》杂志重点介绍了这项研究，其中包括国家生物农业防御基地、加拿大食品检验局以及乌干达麦克雷雷大学的研究和开发投入。

参考链接：https://www.thepigsite.com/news/2023/11/usda-researchers-confirm-six-unique-strains-of-african-swine-fever

https://www.mdpi.com/1999-4915/15/11/2246

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